]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blobdiff - man/consensus.Rd
new compute.brtime() + minor change in dist.topo.R
[ape.git] / man / consensus.Rd
index c99dd3622d9bcce047a762d0886c0421462d50fd..2f7bdeb282018b18821a66d0958c90f8b1d59f37 100644 (file)
@@ -2,10 +2,10 @@
 \alias{consensus}
 \title{Concensus Trees}
 \usage{
-consensus(..., p = 1, check.labels = FALSE)
+consensus(..., p = 1, check.labels = TRUE)
 }
 \arguments{
-  \item{...}{either (i) a single object of class \code{"phylo"}, (ii) a
+  \item{\dots}{either (i) a single object of class \code{"phylo"}, (ii) a
     series of such objects separated by commas, or (iii) a list
     containing such objects.}
   \item{p}{a numeric value between 0.5 and 1 giving the proportion for a
@@ -22,16 +22,16 @@ consensus(..., p = 1, check.labels = FALSE)
   0.5 and 1 can be used.
 }
 \details{
-  Using (the default) \code{check.labels = FALSE} results in
-  considerable decrease in computing times. This requires that (i) all
-  trees have the same tip labels, \emph{and} (ii) these labels are
+  Using \code{check.labels = FALSE} results in
+  considerable decrease in computing times. This requires that all
+  trees have the same tip labels, \emph{and} these labels are
   ordered similarly in all trees (in other words, the element
   \code{tip.label} are identical in all trees).
 }
 \value{
   an object of class \code{"phylo"}.
 }
-\author{Emmanuel Paradis \email{Emmanuel.Paradis@mpl.ird.fr}}
+\author{Emmanuel Paradis}
 \seealso{
   \code{\link{prop.part}}, \code{\link{dist.topo}}
 }