]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blobdiff - NEWS
cleaning of C files and update on simulation of OU process
[ape.git] / NEWS
diff --git a/NEWS b/NEWS
index a5c311cf221987f3faa3005e0876d374cbd09743..2a2601eed63c5c5303ef39cc0153505399129d6a 100644 (file)
--- a/NEWS
+++ b/NEWS
@@ -1,11 +1,22 @@
                CHANGES IN APE VERSION 2.7-3
 
 
+NEW FEATURES
+
+    o mantel.test() has a new argument 'alternative' which is
+      "two-sided" by default. Previously, this test was one-tailed
+      with no possibility to change.
+
+
 BUG FIXES
 
     o Branch lengths were wrongly updated with bind.tree(, where = <tip>,
       position = 0). (Thanks to Liam Revell for digging this bug out.)
 
+    o Simulation of OU process with rTraitCont() did not work correctly.
+      This now uses formula from Gillespie (1996) reduced to a BM
+      process when alpha = 0 avoiding division by zero.
+
 
 
                CHANGES IN APE VERSION 2.7-2