]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blobdiff - DESCRIPTION
new trex() + kronoviz() and bug fixing in identify.phylo()
[ape.git] / DESCRIPTION
index 0ff3acf22f2c9e272140b0a23d8d325a3bd9261e..32054d419cf3b963ae83df5ec1285a689ddbb794 100644 (file)
@@ -1,8 +1,8 @@
 Package: ape
-Version: 2.3-2
-Date: 2009-07-06
+Version: 2.7-1
+Date: 2011-03-22
 Title: Analyses of Phylogenetics and Evolution
-Author: Emmanuel Paradis, Ben Bolker, Julien Claude, Hoa Sien Cuong, Richard Desper, Benoit Durand, Julien Dutheil, Olivier Gascuel, Gangolf Jobb, Christoph Heibl, Daniel Lawson, Vincent Lefort, Pierre Legendre, Jim Lemon, Yvonnick Noel, Johan Nylander, Rainer Opgen-Rhein, Korbinian Strimmer, Damien de Vienne
+Author: Emmanuel Paradis, Ben Bolker, Julien Claude, Hoa Sien Cuong, Richard Desper, Benoit Durand, Julien Dutheil, Olivier Gascuel, Christoph Heibl, Daniel Lawson, Vincent Lefort, Pierre Legendre, Jim Lemon, Yvonnick Noel, Johan Nylander, Rainer Opgen-Rhein, Klaus Schliep, Korbinian Strimmer, Damien de Vienne
 Maintainer: Emmanuel Paradis <Emmanuel.Paradis@ird.fr>
 Depends: R (>= 2.6.0)
 Suggests: gee
@@ -13,11 +13,10 @@ Description: ape provides functions for reading, writing, plotting,
   in a phylogenetic framework, analyses of diversification and
   macroevolution, computing distances from allelic and nucleotide
   data, reading nucleotide sequences, and several tools such as
-  Mantel's test, computation of minimum spanning tree, the population
-  parameter theta based on various approaches, nucleotide diversity,
-  generalized skyline plots, estimation of absolute evolutionary rates
-  and clock-like trees using mean path lengths, non-parametric rate
-  smoothing and penalized likelihood. Phylogeny estimation can be done
-  with the NJ, BIONJ, and ME methods.
+  Mantel's test, computation of minimum spanning tree, generalized
+  skyline plots, estimation of absolute evolutionary rates and
+  clock-like trees using mean path lengths, non-parametric rate
+  smoothing and penalized likelihood. Phylogeny estimation can be
+  done with the NJ, BIONJ, and ME methods.
 License: GPL (>= 2)
 URL: http://ape.mpl.ird.fr/