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new operators for "multiPhylo" + fixed small bug in bind.tree()
[ape.git] / ChangeLog
index 229acbec29ae826afeb53fdf749dcc7e8540fe84..2ccbdf4ab33d9e56dd6736975ae4b3e3de31c01a 100644 (file)
--- a/ChangeLog
+++ b/ChangeLog
@@ -1,3 +1,26 @@
+               CHANGES IN APE VERSION 2.5-3
+
+
+NEW FEATURES
+
+    o There are now replacement operators for [, [[, and $ for the class
+      "multiPhylo" (i.e., TREES[11:20] <- rmtree(10, 100)). They check
+      that the tip labels are the same in all trees.
+
+    o Objects of class "multiPhylo" can be built with c(): there are
+      methods for the classes "phylo" and "multiPhylo".
+
+    o The internal functions .compressTipLabel and .uncompressTipLabel are
+      now documented.
+
+
+BUG FIXES
+
+    o bind.tree(x, y, where, position = 0) did not work correctly if 'y'
+      was a single-edge tree and 'where' was a tip.
+
+
+
                CHANGES IN APE VERSION 2.5-2
 
 
@@ -40,7 +63,7 @@ OTHER CHANGES
 
 
 
-               CHANGES IN APE VERSION 2.5-1
+               CHANGES IN APE VERSION 2.5-1
 
 
 NEW FEATURES
@@ -87,7 +110,7 @@ OTHER CHANGES
 
 
 
-       CHANGES IN APE VERSION 2.5
+               CHANGES IN APE VERSION 2.5
 
 
 NEW FEATURES