From 4926ddf7ba9dd7273dfcdedad8141833330f5d67 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: martinahansen <martinahansen@74ccb610-7750-0410-82ae-013aeee3265d>
Date: Thu, 27 Sep 2012 13:02:11 +0000
Subject: [PATCH] removed kmer_freq test files

git-svn-id: http://biopieces.googlecode.com/svn/trunk@1947 74ccb610-7750-0410-82ae-013aeee3265d
---
 bp_test/out/kmer_freq.out.1 | 528 +----------------------
 bp_test/out/kmer_freq.out.2 |  38 --
 bp_test/out/kmer_freq.out.3 |  38 --
 bp_test/out/kmer_freq.out.4 | 806 ------------------------------------
 bp_test/test/test_kmer_freq |  12 -
 5 files changed, 16 insertions(+), 1406 deletions(-)
 delete mode 100644 bp_test/out/kmer_freq.out.2
 delete mode 100644 bp_test/out/kmer_freq.out.3
 delete mode 100644 bp_test/out/kmer_freq.out.4

diff --git a/bp_test/out/kmer_freq.out.1 b/bp_test/out/kmer_freq.out.1
index cbb552a..f0dea7a 100644
--- a/bp_test/out/kmer_freq.out.1
+++ b/bp_test/out/kmer_freq.out.1
@@ -1,518 +1,22 @@
 DUMMY: nothing
 ---
 SEQ: atcgatcgatcg
-AAAA: 0
-AAAT: 0
-AAAC: 0
-AAAG: 0
-AATA: 0
-AATT: 0
-AATC: 0
-AATG: 0
-AACA: 0
-AACT: 0
-AACC: 0
-AACG: 0
-AAGA: 0
-AAGT: 0
-AAGC: 0
-AAGG: 0
-ATAA: 0
-ATAT: 0
-ATAC: 0
-ATAG: 0
-ATTA: 0
-ATTT: 0
-ATTC: 0
-ATTG: 0
-ATCA: 0
-ATCT: 0
-ATCC: 0
-ATCG: 2
-ATGA: 0
-ATGT: 0
-ATGC: 0
-ATGG: 0
-ACAA: 0
-ACAT: 0
-ACAC: 0
-ACAG: 0
-ACTA: 0
-ACTT: 0
-ACTC: 0
-ACTG: 0
-ACCA: 0
-ACCT: 0
-ACCC: 0
-ACCG: 0
-ACGA: 0
-ACGT: 0
-ACGC: 0
-ACGG: 0
-AGAA: 0
-AGAT: 0
-AGAC: 0
-AGAG: 0
-AGTA: 0
-AGTT: 0
-AGTC: 0
-AGTG: 0
-AGCA: 0
-AGCT: 0
-AGCC: 0
-AGCG: 0
-AGGA: 0
-AGGT: 0
-AGGC: 0
-AGGG: 0
-TAAA: 0
-TAAT: 0
-TAAC: 0
-TAAG: 0
-TATA: 0
-TATT: 0
-TATC: 0
-TATG: 0
-TACA: 0
-TACT: 0
-TACC: 0
-TACG: 0
-TAGA: 0
-TAGT: 0
-TAGC: 0
-TAGG: 0
-TTAA: 0
-TTAT: 0
-TTAC: 0
-TTAG: 0
-TTTA: 0
-TTTT: 0
-TTTC: 0
-TTTG: 0
-TTCA: 0
-TTCT: 0
-TTCC: 0
-TTCG: 0
-TTGA: 0
-TTGT: 0
-TTGC: 0
-TTGG: 0
-TCAA: 0
-TCAT: 0
-TCAC: 0
-TCAG: 0
-TCTA: 0
-TCTT: 0
-TCTC: 0
-TCTG: 0
-TCCA: 0
-TCCT: 0
-TCCC: 0
-TCCG: 0
-TCGA: 2
-TCGT: 0
-TCGC: 0
-TCGG: 0
-TGAA: 0
-TGAT: 0
-TGAC: 0
-TGAG: 0
-TGTA: 0
-TGTT: 0
-TGTC: 0
-TGTG: 0
-TGCA: 0
-TGCT: 0
-TGCC: 0
-TGCG: 0
-TGGA: 0
-TGGT: 0
-TGGC: 0
-TGGG: 0
-CAAA: 0
-CAAT: 0
-CAAC: 0
-CAAG: 0
-CATA: 0
-CATT: 0
-CATC: 0
-CATG: 0
-CACA: 0
-CACT: 0
-CACC: 0
-CACG: 0
-CAGA: 0
-CAGT: 0
-CAGC: 0
-CAGG: 0
-CTAA: 0
-CTAT: 0
-CTAC: 0
-CTAG: 0
-CTTA: 0
-CTTT: 0
-CTTC: 0
-CTTG: 0
-CTCA: 0
-CTCT: 0
-CTCC: 0
-CTCG: 0
-CTGA: 0
-CTGT: 0
-CTGC: 0
-CTGG: 0
-CCAA: 0
-CCAT: 0
-CCAC: 0
-CCAG: 0
-CCTA: 0
-CCTT: 0
-CCTC: 0
-CCTG: 0
-CCCA: 0
-CCCT: 0
-CCCC: 0
-CCCG: 0
-CCGA: 0
-CCGT: 0
-CCGC: 0
-CCGG: 0
-CGAA: 0
-CGAT: 2
-CGAC: 0
-CGAG: 0
-CGTA: 0
-CGTT: 0
-CGTC: 0
-CGTG: 0
-CGCA: 0
-CGCT: 0
-CGCC: 0
-CGCG: 0
-CGGA: 0
-CGGT: 0
-CGGC: 0
-CGGG: 0
-GAAA: 0
-GAAT: 0
-GAAC: 0
-GAAG: 0
-GATA: 0
-GATT: 0
-GATC: 2
-GATG: 0
-GACA: 0
-GACT: 0
-GACC: 0
-GACG: 0
-GAGA: 0
-GAGT: 0
-GAGC: 0
-GAGG: 0
-GTAA: 0
-GTAT: 0
-GTAC: 0
-GTAG: 0
-GTTA: 0
-GTTT: 0
-GTTC: 0
-GTTG: 0
-GTCA: 0
-GTCT: 0
-GTCC: 0
-GTCG: 0
-GTGA: 0
-GTGT: 0
-GTGC: 0
-GTGG: 0
-GCAA: 0
-GCAT: 0
-GCAC: 0
-GCAG: 0
-GCTA: 0
-GCTT: 0
-GCTC: 0
-GCTG: 0
-GCCA: 0
-GCCT: 0
-GCCC: 0
-GCCG: 0
-GCGA: 0
-GCGT: 0
-GCGC: 0
-GCGG: 0
-GGAA: 0
-GGAT: 0
-GGAC: 0
-GGAG: 0
-GGTA: 0
-GGTT: 0
-GGTC: 0
-GGTG: 0
-GGCA: 0
-GGCT: 0
-GGCC: 0
-GGCG: 0
-GGGA: 0
-GGGT: 0
-GGGC: 0
-GGGG: 0
 ---
 SEQ: atcgatcgatcgATCGATCGATCG
-AAAA: 0
-AAAT: 0
-AAAC: 0
-AAAG: 0
-AATA: 0
-AATT: 0
-AATC: 0
-AATG: 0
-AACA: 0
-AACT: 0
-AACC: 0
-AACG: 0
-AAGA: 0
-AAGT: 0
-AAGC: 0
-AAGG: 0
-ATAA: 0
-ATAT: 0
-ATAC: 0
-ATAG: 0
-ATTA: 0
-ATTT: 0
-ATTC: 0
-ATTG: 0
-ATCA: 0
-ATCT: 0
-ATCC: 0
-ATCG: 5
-ATGA: 0
-ATGT: 0
-ATGC: 0
-ATGG: 0
-ACAA: 0
-ACAT: 0
-ACAC: 0
-ACAG: 0
-ACTA: 0
-ACTT: 0
-ACTC: 0
-ACTG: 0
-ACCA: 0
-ACCT: 0
-ACCC: 0
-ACCG: 0
-ACGA: 0
-ACGT: 0
-ACGC: 0
-ACGG: 0
-AGAA: 0
-AGAT: 0
-AGAC: 0
-AGAG: 0
-AGTA: 0
-AGTT: 0
-AGTC: 0
-AGTG: 0
-AGCA: 0
-AGCT: 0
-AGCC: 0
-AGCG: 0
-AGGA: 0
-AGGT: 0
-AGGC: 0
-AGGG: 0
-TAAA: 0
-TAAT: 0
-TAAC: 0
-TAAG: 0
-TATA: 0
-TATT: 0
-TATC: 0
-TATG: 0
-TACA: 0
-TACT: 0
-TACC: 0
-TACG: 0
-TAGA: 0
-TAGT: 0
-TAGC: 0
-TAGG: 0
-TTAA: 0
-TTAT: 0
-TTAC: 0
-TTAG: 0
-TTTA: 0
-TTTT: 0
-TTTC: 0
-TTTG: 0
-TTCA: 0
-TTCT: 0
-TTCC: 0
-TTCG: 0
-TTGA: 0
-TTGT: 0
-TTGC: 0
-TTGG: 0
-TCAA: 0
-TCAT: 0
-TCAC: 0
-TCAG: 0
-TCTA: 0
-TCTT: 0
-TCTC: 0
-TCTG: 0
-TCCA: 0
-TCCT: 0
-TCCC: 0
-TCCG: 0
-TCGA: 5
-TCGT: 0
-TCGC: 0
-TCGG: 0
-TGAA: 0
-TGAT: 0
-TGAC: 0
-TGAG: 0
-TGTA: 0
-TGTT: 0
-TGTC: 0
-TGTG: 0
-TGCA: 0
-TGCT: 0
-TGCC: 0
-TGCG: 0
-TGGA: 0
-TGGT: 0
-TGGC: 0
-TGGG: 0
-CAAA: 0
-CAAT: 0
-CAAC: 0
-CAAG: 0
-CATA: 0
-CATT: 0
-CATC: 0
-CATG: 0
-CACA: 0
-CACT: 0
-CACC: 0
-CACG: 0
-CAGA: 0
-CAGT: 0
-CAGC: 0
-CAGG: 0
-CTAA: 0
-CTAT: 0
-CTAC: 0
-CTAG: 0
-CTTA: 0
-CTTT: 0
-CTTC: 0
-CTTG: 0
-CTCA: 0
-CTCT: 0
-CTCC: 0
-CTCG: 0
-CTGA: 0
-CTGT: 0
-CTGC: 0
-CTGG: 0
-CCAA: 0
-CCAT: 0
-CCAC: 0
-CCAG: 0
-CCTA: 0
-CCTT: 0
-CCTC: 0
-CCTG: 0
-CCCA: 0
-CCCT: 0
-CCCC: 0
-CCCG: 0
-CCGA: 0
-CCGT: 0
-CCGC: 0
-CCGG: 0
-CGAA: 0
-CGAT: 5
-CGAC: 0
-CGAG: 0
-CGTA: 0
-CGTT: 0
-CGTC: 0
-CGTG: 0
-CGCA: 0
-CGCT: 0
-CGCC: 0
-CGCG: 0
-CGGA: 0
-CGGT: 0
-CGGC: 0
-CGGG: 0
-GAAA: 0
-GAAT: 0
-GAAC: 0
-GAAG: 0
-GATA: 0
-GATT: 0
-GATC: 5
-GATG: 0
-GACA: 0
-GACT: 0
-GACC: 0
-GACG: 0
-GAGA: 0
-GAGT: 0
-GAGC: 0
-GAGG: 0
-GTAA: 0
-GTAT: 0
-GTAC: 0
-GTAG: 0
-GTTA: 0
-GTTT: 0
-GTTC: 0
-GTTG: 0
-GTCA: 0
-GTCT: 0
-GTCC: 0
-GTCG: 0
-GTGA: 0
-GTGT: 0
-GTGC: 0
-GTGG: 0
-GCAA: 0
-GCAT: 0
-GCAC: 0
-GCAG: 0
-GCTA: 0
-GCTT: 0
-GCTC: 0
-GCTG: 0
-GCCA: 0
-GCCT: 0
-GCCC: 0
-GCCG: 0
-GCGA: 0
-GCGT: 0
-GCGC: 0
-GCGG: 0
-GGAA: 0
-GGAT: 0
-GGAC: 0
-GGAG: 0
-GGTA: 0
-GGTT: 0
-GGTC: 0
-GGTG: 0
-GGCA: 0
-GGCT: 0
-GGCC: 0
-GGCG: 0
-GGGA: 0
-GGGT: 0
-GGGC: 0
-GGGG: 0
+---
+REC_TYPE: KMER_FREQ
+KMER: ATCG
+COUNT: 9
+---
+REC_TYPE: KMER_FREQ
+KMER: TCGA
+COUNT: 7
+---
+REC_TYPE: KMER_FREQ
+KMER: CGAT
+COUNT: 7
+---
+REC_TYPE: KMER_FREQ
+KMER: GATC
+COUNT: 7
 ---
diff --git a/bp_test/out/kmer_freq.out.2 b/bp_test/out/kmer_freq.out.2
deleted file mode 100644
index 411af63..0000000
--- a/bp_test/out/kmer_freq.out.2
+++ /dev/null
@@ -1,38 +0,0 @@
-DUMMY: nothing
----
-SEQ: atcgatcgatcg
-AA: 0
-AT: 3
-AC: 0
-AG: 0
-TA: 0
-TT: 0
-TC: 3
-TG: 0
-CA: 0
-CT: 0
-CC: 0
-CG: 2
-GA: 2
-GT: 0
-GC: 0
-GG: 0
----
-SEQ: atcgatcgatcgATCGATCGATCG
-AA: 0
-AT: 6
-AC: 0
-AG: 0
-TA: 0
-TT: 0
-TC: 6
-TG: 0
-CA: 0
-CT: 0
-CC: 0
-CG: 5
-GA: 5
-GT: 0
-GC: 0
-GG: 0
----
diff --git a/bp_test/out/kmer_freq.out.3 b/bp_test/out/kmer_freq.out.3
deleted file mode 100644
index a697e78..0000000
--- a/bp_test/out/kmer_freq.out.3
+++ /dev/null
@@ -1,38 +0,0 @@
-DUMMY: nothing
----
-SEQ: atcgatcgatcg
-AA: 0
-AU: 0
-AC: 0
-AG: 0
-UA: 0
-UU: 0
-UC: 0
-UG: 0
-CA: 0
-CU: 0
-CC: 0
-CG: 2
-GA: 2
-GU: 0
-GC: 0
-GG: 0
----
-SEQ: atcgatcgatcgATCGATCGATCG
-AA: 0
-AU: 0
-AC: 0
-AG: 0
-UA: 0
-UU: 0
-UC: 0
-UG: 0
-CA: 0
-CU: 0
-CC: 0
-CG: 5
-GA: 5
-GU: 0
-GC: 0
-GG: 0
----
diff --git a/bp_test/out/kmer_freq.out.4 b/bp_test/out/kmer_freq.out.4
deleted file mode 100644
index b18313e..0000000
--- a/bp_test/out/kmer_freq.out.4
+++ /dev/null
@@ -1,806 +0,0 @@
-DUMMY: nothing
----
-SEQ: atcgatcgatcg
-FF: 0
-FL: 0
-FS: 0
-FY: 0
-FC: 0
-FW: 0
-FP: 0
-FH: 0
-FQ: 0
-FR: 0
-FI: 0
-FM: 0
-FT: 0
-FN: 0
-FK: 0
-FV: 0
-FA: 0
-FD: 0
-FE: 0
-FG: 0
-LF: 0
-LL: 0
-LS: 0
-LY: 0
-LC: 0
-LW: 0
-LP: 0
-LH: 0
-LQ: 0
-LR: 0
-LI: 0
-LM: 0
-LT: 0
-LN: 0
-LK: 0
-LV: 0
-LA: 0
-LD: 0
-LE: 0
-LG: 0
-SF: 0
-SL: 0
-SS: 0
-SY: 0
-SC: 0
-SW: 0
-SP: 0
-SH: 0
-SQ: 0
-SR: 0
-SI: 0
-SM: 0
-ST: 0
-SN: 0
-SK: 0
-SV: 0
-SA: 0
-SD: 0
-SE: 0
-SG: 0
-YF: 0
-YL: 0
-YS: 0
-YY: 0
-YC: 0
-YW: 0
-YP: 0
-YH: 0
-YQ: 0
-YR: 0
-YI: 0
-YM: 0
-YT: 0
-YN: 0
-YK: 0
-YV: 0
-YA: 0
-YD: 0
-YE: 0
-YG: 0
-CF: 0
-CL: 0
-CS: 0
-CY: 0
-CC: 0
-CW: 0
-CP: 0
-CH: 0
-CQ: 0
-CR: 0
-CI: 0
-CM: 0
-CT: 0
-CN: 0
-CK: 0
-CV: 0
-CA: 0
-CD: 0
-CE: 0
-CG: 2
-WF: 0
-WL: 0
-WS: 0
-WY: 0
-WC: 0
-WW: 0
-WP: 0
-WH: 0
-WQ: 0
-WR: 0
-WI: 0
-WM: 0
-WT: 0
-WN: 0
-WK: 0
-WV: 0
-WA: 0
-WD: 0
-WE: 0
-WG: 0
-PF: 0
-PL: 0
-PS: 0
-PY: 0
-PC: 0
-PW: 0
-PP: 0
-PH: 0
-PQ: 0
-PR: 0
-PI: 0
-PM: 0
-PT: 0
-PN: 0
-PK: 0
-PV: 0
-PA: 0
-PD: 0
-PE: 0
-PG: 0
-HF: 0
-HL: 0
-HS: 0
-HY: 0
-HC: 0
-HW: 0
-HP: 0
-HH: 0
-HQ: 0
-HR: 0
-HI: 0
-HM: 0
-HT: 0
-HN: 0
-HK: 0
-HV: 0
-HA: 0
-HD: 0
-HE: 0
-HG: 0
-QF: 0
-QL: 0
-QS: 0
-QY: 0
-QC: 0
-QW: 0
-QP: 0
-QH: 0
-QQ: 0
-QR: 0
-QI: 0
-QM: 0
-QT: 0
-QN: 0
-QK: 0
-QV: 0
-QA: 0
-QD: 0
-QE: 0
-QG: 0
-RF: 0
-RL: 0
-RS: 0
-RY: 0
-RC: 0
-RW: 0
-RP: 0
-RH: 0
-RQ: 0
-RR: 0
-RI: 0
-RM: 0
-RT: 0
-RN: 0
-RK: 0
-RV: 0
-RA: 0
-RD: 0
-RE: 0
-RG: 0
-IF: 0
-IL: 0
-IS: 0
-IY: 0
-IC: 0
-IW: 0
-IP: 0
-IH: 0
-IQ: 0
-IR: 0
-II: 0
-IM: 0
-IT: 0
-IN: 0
-IK: 0
-IV: 0
-IA: 0
-ID: 0
-IE: 0
-IG: 0
-MF: 0
-ML: 0
-MS: 0
-MY: 0
-MC: 0
-MW: 0
-MP: 0
-MH: 0
-MQ: 0
-MR: 0
-MI: 0
-MM: 0
-MT: 0
-MN: 0
-MK: 0
-MV: 0
-MA: 0
-MD: 0
-ME: 0
-MG: 0
-TF: 0
-TL: 0
-TS: 0
-TY: 0
-TC: 3
-TW: 0
-TP: 0
-TH: 0
-TQ: 0
-TR: 0
-TI: 0
-TM: 0
-TT: 0
-TN: 0
-TK: 0
-TV: 0
-TA: 0
-TD: 0
-TE: 0
-TG: 0
-NF: 0
-NL: 0
-NS: 0
-NY: 0
-NC: 0
-NW: 0
-NP: 0
-NH: 0
-NQ: 0
-NR: 0
-NI: 0
-NM: 0
-NT: 0
-NN: 0
-NK: 0
-NV: 0
-NA: 0
-ND: 0
-NE: 0
-NG: 0
-KF: 0
-KL: 0
-KS: 0
-KY: 0
-KC: 0
-KW: 0
-KP: 0
-KH: 0
-KQ: 0
-KR: 0
-KI: 0
-KM: 0
-KT: 0
-KN: 0
-KK: 0
-KV: 0
-KA: 0
-KD: 0
-KE: 0
-KG: 0
-VF: 0
-VL: 0
-VS: 0
-VY: 0
-VC: 0
-VW: 0
-VP: 0
-VH: 0
-VQ: 0
-VR: 0
-VI: 0
-VM: 0
-VT: 0
-VN: 0
-VK: 0
-VV: 0
-VA: 0
-VD: 0
-VE: 0
-VG: 0
-AF: 0
-AL: 0
-AS: 0
-AY: 0
-AC: 0
-AW: 0
-AP: 0
-AH: 0
-AQ: 0
-AR: 0
-AI: 0
-AM: 0
-AT: 3
-AN: 0
-AK: 0
-AV: 0
-AA: 0
-AD: 0
-AE: 0
-AG: 0
-DF: 0
-DL: 0
-DS: 0
-DY: 0
-DC: 0
-DW: 0
-DP: 0
-DH: 0
-DQ: 0
-DR: 0
-DI: 0
-DM: 0
-DT: 0
-DN: 0
-DK: 0
-DV: 0
-DA: 0
-DD: 0
-DE: 0
-DG: 0
-EF: 0
-EL: 0
-ES: 0
-EY: 0
-EC: 0
-EW: 0
-EP: 0
-EH: 0
-EQ: 0
-ER: 0
-EI: 0
-EM: 0
-ET: 0
-EN: 0
-EK: 0
-EV: 0
-EA: 0
-ED: 0
-EE: 0
-EG: 0
-GF: 0
-GL: 0
-GS: 0
-GY: 0
-GC: 0
-GW: 0
-GP: 0
-GH: 0
-GQ: 0
-GR: 0
-GI: 0
-GM: 0
-GT: 0
-GN: 0
-GK: 0
-GV: 0
-GA: 2
-GD: 0
-GE: 0
-GG: 0
----
-SEQ: atcgatcgatcgATCGATCGATCG
-FF: 0
-FL: 0
-FS: 0
-FY: 0
-FC: 0
-FW: 0
-FP: 0
-FH: 0
-FQ: 0
-FR: 0
-FI: 0
-FM: 0
-FT: 0
-FN: 0
-FK: 0
-FV: 0
-FA: 0
-FD: 0
-FE: 0
-FG: 0
-LF: 0
-LL: 0
-LS: 0
-LY: 0
-LC: 0
-LW: 0
-LP: 0
-LH: 0
-LQ: 0
-LR: 0
-LI: 0
-LM: 0
-LT: 0
-LN: 0
-LK: 0
-LV: 0
-LA: 0
-LD: 0
-LE: 0
-LG: 0
-SF: 0
-SL: 0
-SS: 0
-SY: 0
-SC: 0
-SW: 0
-SP: 0
-SH: 0
-SQ: 0
-SR: 0
-SI: 0
-SM: 0
-ST: 0
-SN: 0
-SK: 0
-SV: 0
-SA: 0
-SD: 0
-SE: 0
-SG: 0
-YF: 0
-YL: 0
-YS: 0
-YY: 0
-YC: 0
-YW: 0
-YP: 0
-YH: 0
-YQ: 0
-YR: 0
-YI: 0
-YM: 0
-YT: 0
-YN: 0
-YK: 0
-YV: 0
-YA: 0
-YD: 0
-YE: 0
-YG: 0
-CF: 0
-CL: 0
-CS: 0
-CY: 0
-CC: 0
-CW: 0
-CP: 0
-CH: 0
-CQ: 0
-CR: 0
-CI: 0
-CM: 0
-CT: 0
-CN: 0
-CK: 0
-CV: 0
-CA: 0
-CD: 0
-CE: 0
-CG: 5
-WF: 0
-WL: 0
-WS: 0
-WY: 0
-WC: 0
-WW: 0
-WP: 0
-WH: 0
-WQ: 0
-WR: 0
-WI: 0
-WM: 0
-WT: 0
-WN: 0
-WK: 0
-WV: 0
-WA: 0
-WD: 0
-WE: 0
-WG: 0
-PF: 0
-PL: 0
-PS: 0
-PY: 0
-PC: 0
-PW: 0
-PP: 0
-PH: 0
-PQ: 0
-PR: 0
-PI: 0
-PM: 0
-PT: 0
-PN: 0
-PK: 0
-PV: 0
-PA: 0
-PD: 0
-PE: 0
-PG: 0
-HF: 0
-HL: 0
-HS: 0
-HY: 0
-HC: 0
-HW: 0
-HP: 0
-HH: 0
-HQ: 0
-HR: 0
-HI: 0
-HM: 0
-HT: 0
-HN: 0
-HK: 0
-HV: 0
-HA: 0
-HD: 0
-HE: 0
-HG: 0
-QF: 0
-QL: 0
-QS: 0
-QY: 0
-QC: 0
-QW: 0
-QP: 0
-QH: 0
-QQ: 0
-QR: 0
-QI: 0
-QM: 0
-QT: 0
-QN: 0
-QK: 0
-QV: 0
-QA: 0
-QD: 0
-QE: 0
-QG: 0
-RF: 0
-RL: 0
-RS: 0
-RY: 0
-RC: 0
-RW: 0
-RP: 0
-RH: 0
-RQ: 0
-RR: 0
-RI: 0
-RM: 0
-RT: 0
-RN: 0
-RK: 0
-RV: 0
-RA: 0
-RD: 0
-RE: 0
-RG: 0
-IF: 0
-IL: 0
-IS: 0
-IY: 0
-IC: 0
-IW: 0
-IP: 0
-IH: 0
-IQ: 0
-IR: 0
-II: 0
-IM: 0
-IT: 0
-IN: 0
-IK: 0
-IV: 0
-IA: 0
-ID: 0
-IE: 0
-IG: 0
-MF: 0
-ML: 0
-MS: 0
-MY: 0
-MC: 0
-MW: 0
-MP: 0
-MH: 0
-MQ: 0
-MR: 0
-MI: 0
-MM: 0
-MT: 0
-MN: 0
-MK: 0
-MV: 0
-MA: 0
-MD: 0
-ME: 0
-MG: 0
-TF: 0
-TL: 0
-TS: 0
-TY: 0
-TC: 6
-TW: 0
-TP: 0
-TH: 0
-TQ: 0
-TR: 0
-TI: 0
-TM: 0
-TT: 0
-TN: 0
-TK: 0
-TV: 0
-TA: 0
-TD: 0
-TE: 0
-TG: 0
-NF: 0
-NL: 0
-NS: 0
-NY: 0
-NC: 0
-NW: 0
-NP: 0
-NH: 0
-NQ: 0
-NR: 0
-NI: 0
-NM: 0
-NT: 0
-NN: 0
-NK: 0
-NV: 0
-NA: 0
-ND: 0
-NE: 0
-NG: 0
-KF: 0
-KL: 0
-KS: 0
-KY: 0
-KC: 0
-KW: 0
-KP: 0
-KH: 0
-KQ: 0
-KR: 0
-KI: 0
-KM: 0
-KT: 0
-KN: 0
-KK: 0
-KV: 0
-KA: 0
-KD: 0
-KE: 0
-KG: 0
-VF: 0
-VL: 0
-VS: 0
-VY: 0
-VC: 0
-VW: 0
-VP: 0
-VH: 0
-VQ: 0
-VR: 0
-VI: 0
-VM: 0
-VT: 0
-VN: 0
-VK: 0
-VV: 0
-VA: 0
-VD: 0
-VE: 0
-VG: 0
-AF: 0
-AL: 0
-AS: 0
-AY: 0
-AC: 0
-AW: 0
-AP: 0
-AH: 0
-AQ: 0
-AR: 0
-AI: 0
-AM: 0
-AT: 6
-AN: 0
-AK: 0
-AV: 0
-AA: 0
-AD: 0
-AE: 0
-AG: 0
-DF: 0
-DL: 0
-DS: 0
-DY: 0
-DC: 0
-DW: 0
-DP: 0
-DH: 0
-DQ: 0
-DR: 0
-DI: 0
-DM: 0
-DT: 0
-DN: 0
-DK: 0
-DV: 0
-DA: 0
-DD: 0
-DE: 0
-DG: 0
-EF: 0
-EL: 0
-ES: 0
-EY: 0
-EC: 0
-EW: 0
-EP: 0
-EH: 0
-EQ: 0
-ER: 0
-EI: 0
-EM: 0
-ET: 0
-EN: 0
-EK: 0
-EV: 0
-EA: 0
-ED: 0
-EE: 0
-EG: 0
-GF: 0
-GL: 0
-GS: 0
-GY: 0
-GC: 0
-GW: 0
-GP: 0
-GH: 0
-GQ: 0
-GR: 0
-GI: 0
-GM: 0
-GT: 0
-GN: 0
-GK: 0
-GV: 0
-GA: 5
-GD: 0
-GE: 0
-GG: 0
----
diff --git a/bp_test/test/test_kmer_freq b/bp_test/test/test_kmer_freq
index 4af9bf6..61c5709 100755
--- a/bp_test/test/test_kmer_freq
+++ b/bp_test/test/test_kmer_freq
@@ -5,15 +5,3 @@ source "$BP_DIR/bp_test/lib/test.sh"
 run "$bp -I $in -O $tmp"
 assert_no_diff $tmp $out.1
 clean
-
-run "$bp -I $in -s 2 -O $tmp"
-assert_no_diff $tmp $out.2
-clean
-
-run "$bp -I $in -s 2 -t rna -O $tmp"
-assert_no_diff $tmp $out.3
-clean
-
-run "$bp -I $in -s 2 -t protein -O $tmp"
-assert_no_diff $tmp $out.4
-clean
-- 
2.39.5