]> git.donarmstrong.com Git - neurodebian.git/commitdiff
adding few more subprojects
authorYaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>
Fri, 28 Jan 2011 18:16:01 +0000 (13:16 -0500)
committerYaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>
Fri, 28 Jan 2011 18:16:01 +0000 (13:16 -0500)
sphinx/proj_electrophys.rst [new file with mode: 0644]
sphinx/proj_freesurfer.rst [new file with mode: 0644]
sphinx/proj_psychophysics.rst [new file with mode: 0644]
sphinx/proj_snapshots.rst [new file with mode: 0644]

diff --git a/sphinx/proj_electrophys.rst b/sphinx/proj_electrophys.rst
new file mode 100644 (file)
index 0000000..7f4b909
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,61 @@
+.. -*- mode: rst; fill-column: 78 -*-
+.. ex: set sts=4 ts=4 sw=4 et tw=79:
+
+.. _project_electrophys:
+
+*****************
+Electrophysiology
+*****************
+
+The majority of the electrophysiology research community in neuroscience is
+`locked-in` the proprietary software solutions which accompanying data
+acquisition hardware.  That impairs their ability to adopt novel data analysis
+methodologies and experimental setups.  There already exist a variety of
+primarily Linux-based FOSS_ solutions in this domain.  But software
+development and dissemination is often impaired by the absence of the efforts
+centralization and existing problems with the support of the core components
+by the used operating systems.  Nevertheless, Debian_ and its derivatives
+already dominate as the operating systems of choice by such projects.
+
+We are planing to help addressing existing issues in the core necessary
+components provided by Debian_ to help upstream authors with streamlining
+their development.  Furthermore we are planing to package some popular
+deployment-ready |FOSS| solutions and make them an integral part of Debian_.
+
+Status
+------
+
+We have collected information on interesting and alive projects in this domain
+within neuroscience-electrophysiology_ task page.  To gather information on
+the needs of the researchers interested in this field we have researched
+researchers demands while helding a :ref:`Debian booth at SfN10 conference
+<chap_debian_booth_sfn2010>`.  To further elaborate the work plan, we have
+initiated discussions with upstream authors (private correspondence and on
+neurodebian-devel_, neurodebian-upstream_ mailing lists).
+
+.. todo:: Electrophysiology coverage
+
+   * Help to ensure adequate status in Debian of the necessary core components,
+     e.g. Comedi_, RTAI_ (see |DBTS|: 606122_, 608091_, 609633_):
+   * Consider packaging prebuilt kernels with |RTAI| patches/support to make
+     available from NeuroDebian repository
+
+.. _606122: http://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=606122
+.. _608091: http://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=608091
+.. _609633: http://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=609633
+
+..
+ .. _: http://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=
+
+
+References
+----------
+
+* RTAI_
+* Comedi_
+* `Debian-Science Electrophysiology task page <http://blends.alioth.debian.org/science/tasks/electrophysiology>`_.
+* `Debian-Science Data acquisition task page <http://blends.alioth.debian.org/science/tasks/dataacquisition>`_.
+* `Debian-Science Brain-Computer Interface task page <http://blends.alioth.debian.org/science/tasks/bci>`_.
+
+
+.. include:: link_names.txt
diff --git a/sphinx/proj_freesurfer.rst b/sphinx/proj_freesurfer.rst
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b3a4747
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,29 @@
+.. -*- mode: rst; fill-column: 78 -*-
+.. ex: set sts=4 ts=4 sw=4 et tw=79:
+
+.. _project_freesurfer:
+
+********************
+Packaging FreeSurfer
+********************
+
+Status
+------
+
+We have been in contact with upstream developers and awaiting on the
+resolution of legal aspects which would allow redistribution of FreeSurfer
+under reasonable |FOSS| license terms.
+
+This project will continue as soon as licensing issue gets resolved.
+
+..
+ .. todo:: 
+
+
+..
+ References
+ ----------
+
+ <references>
+
+.. include:: link_names.txt
diff --git a/sphinx/proj_psychophysics.rst b/sphinx/proj_psychophysics.rst
new file mode 100644 (file)
index 0000000..5b777ca
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,24 @@
+.. -*- mode: rst; fill-column: 78 -*-
+.. ex: set sts=4 ts=4 sw=4 et tw=79:
+
+.. _project_psychophysics:
+
+************
+Psychopysics
+************
+
+<description>
+
+Status
+------
+
+<status report>
+
+.. todo:: Tailor Debian for psychopysics research
+
+
+References
+----------
+
+<references>
+.. include:: link_names.txt
diff --git a/sphinx/proj_snapshots.rst b/sphinx/proj_snapshots.rst
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e044936
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,36 @@
+.. -*- mode: rst; fill-column: 78 -*-
+.. ex: set sts=4 ts=4 sw=4 et tw=79:
+
+.. _project_snapshots:
+
+***********************************
+NeuroDebian repository snapshotting
+***********************************
+
+The official Debian snapshotting service (http://snapshot.debian.org) allows
+obtaining any version of any software that was ever present in Debian, and
+provides a complete state of the Debian archive with all software versions
+corresponding to a specific date.  We are going to adopt this service to
+provide this functionality for the NeuroDebian repository itself, thus
+covering backports of our packages for all supported Debian and Ubuntu
+releases, as well as staging packages that have not been accepted into Debian,
+but may already be used by researchers.  Used in conjunction with the official
+Debian snapshotting repository, it would allow for the reconstruction of
+entire research environments or simply for installation of a particular
+previous version of a product of interest.
+
+
+.. _`Debian snapshotting service`: http://snapshot.debian.org/
+
+
+Status
+------
+
+We have adapted http://snapshot.debian.org implementation to snapshot
+NeuroDebian repository and snapshotting service was deployed on 2010-10-12.
+
+.. todo:: NeuroDebian snapshotting service
+
+   * Provide web-frontend to access existing snapshots within NeuroDebian
+     website.
+