]> git.donarmstrong.com Git - neurodebian.git/commitdiff
Merge branch 'master' into scale-brochure
authorDon Armstrong <don@donarmstrong.com>
Thu, 19 Feb 2015 20:28:20 +0000 (12:28 -0800)
committerDon Armstrong <don@donarmstrong.com>
Thu, 19 Feb 2015 20:28:20 +0000 (12:28 -0800)
Conflicts:
artwork/brochure/brochure_debian-neurodebian.tex

artwork/brochure/brochure_debian-neurodebian.tex

index 75a052680a343f2114072d79d10ba2654a99db20..5c4493e2aec0dd6615eaffe01f276cd15edebc11 100644 (file)
@@ -232,7 +232,7 @@ teams, such as Debian-Science or Debian-Med.
 \begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
 \item[Install on a hard-drive] \url{http://www.debian.org/distrib/}
 \item[Live CD/DVD] \url{http://www.debian.org/CD/live/}
-\item[Run in a Virtual Machine] \url{http://neuro.debian.net/vm.html}
+%\item[Run in a Virtual Machine] \url{http://neuro.debian.net/vm.html}
 \item[Development version] \url{http://www.debian.org/devel/debian-installer}
 \item[Use in a cloud] \url{https://wiki.debian.org/Cloud}
 \item[Docker: \texttt{docker pull debian}]
@@ -289,7 +289,8 @@ Command line:
   \url{http://www.debian.org/consultants}
 \end{description}
 
-\begin{comment}
+%\begin{comment}
+\pagebreak
 \ndsection{Reasons to choose Debian}
 \paragraph{It is maintained by its users}
 
@@ -356,9 +357,6 @@ dist-upgrade in newer releases) and you can upgrade from a CD in a matter of
 minutes or point apt at one of the over 300 Debian mirrors and upgrade over the
 net.
 
-\rotatebox{90}{\includegraphics[height=.9\columnwidth]{distro-dev}}
-\rotatebox{90}{Description}
-
 \paragraph{Multiple architectures and kernels}
 
 Currently Debian supports an impressive number of CPU architectures: alpha,
@@ -373,210 +371,14 @@ fact that software doesn't always work the way users want. Users are encouraged
 to submit bug reports and are notified when and why the bug was closed. This
 system allows Debian to respond to problems quickly and honestly.
 
+%\rotatebox{90}{\paragraph{Distribution Development Process}}
+\rotatebox{90}{\includegraphics[height=.9\columnwidth]{distro-dev}}
 
 \ndsection{Acknowledgements}
 \end{comment}
 
 \end{multicols}
 
-
-\pagebreak
-%%
-%% NeuroDEBIAN
-%%
-\begin{multicols}{3}    % 3 columns
-
-\section*{The Universal Research Platform}
-\begin{center}
-\includegraphics[width=\columnwidth]{logo_tuned/label}
-\url{http://neuro.debian.net}
-%\ndsection{NeuroDebian Project:}
-% \hrule
-\end{center}
-
-\ndsection{NeuroDebian is}
-
-a Debian project that provides the Neuroscience community with a
-stable and versatile research platform -- the Debian operating system.
-Since 2005, \mbox{NeuroDebian} integrates neuroscience software into Debian
-to allow neuroscientists to benefit from the advantages of
-the universal operating system in their day-to-day research activities.
-The NeuroDebian repository
-(\url{http://neuro.debian.net}) offers the latest research software for
-all Debian suites (and various releases of Ubuntu).
-The combination of a stable generic
-operating system, Debian, and a variety of conveniently accessible research
-software creates a versatile research platform for neuroscience that offers the
-latest methodologies of the field to everyone, for free.
-These advantages make NeuroDebian increasingly popular among
-neuroscientists and scientific software developers.
-
-\vspace{2em}
-
-\ndsubsection{NeuroDebian is NOT}
-
-yet another Debian GNU/Linux derivative distribution.  All work done
-by the NeuroDebian project targets the official Debian operating system. This
-approach helps to increase the longevity of the project by relying on the
-efforts of thousands of Debian contributors.
-
-\vspace{3em}
-\columnbreak
-
-\ndsubsection{Software at your fingertips}
-\begin{flushright}
-\vspace{-0.5em}
-\url{http://neuro.debian.net/pkgs.html}
-\vspace{-0.1em}
-\end{flushright}
-\textit{Distributed computing:} Condor, DMTCP, IPython, \ldots \\
-\textit{Electrophysiology:} BioSig, Neo, Sigviewer, \ldots\\
-\textit{Machine Learning:} MDP, PyMVPA, sklearn, \ldots\\
-\textit{Neural Modeling:} Brian, CNrun, PyNN, XPPAUT \ldots\\
-\textit{Imaging:} AFNI, CMTK, FSL, Mricron, NiPy \ldots\\
-\textit{Psychophysics:} PsychoPy, Psychtoolbox-3, PyEPL \ldots\\
-\vspace{-0.8em}
-
-% TODO: Environments... -- list avail cloud env using NeuroDebian
-
-\ndsubsection{Benefits from Debian integration}
-
-\begin{itemize}[nolistsep,leftmargin=1pc]
-
-% rephrase to outline the benefit, not burden
-\item Debian standards and policies guarantee quality.% and robustness.
-
-\item Debian's centralized bug tracking system provides a unified
-  single-point of entry for bug reporting and troubleshooting
-  for any software in Debian.
-
-\item Debian makes software available through a world-wide distribution
-  network, thus offloading bandwidth demands.
-
-\item Other Debian contributors handle large-scale aspects of
-  deployment, quality assurance, porting and integration at the level
-  of the entire distribution:
-
-\begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc]
-\item[Porting] Software sources get built for 11 hardware
-  architectures and 3 kernels (Linux, HURD, kFreeBSD). Porter teams
-  maintain build infrastructure and help make the code
-  platform-agnostic.
-\item[QA] Whole-archive rebuilds assure robustness of packaging and
-  warn about upcoming problems (core libraries upgrades) beforehand.
-\item[Internationalization (I18n)] Translator teams help localize
-  software for more than 60 languages.
-\end{description}
-
-\item Neuroscience software becomes a 1st-class citizen within the
-  Debian project, which guarantees its longevity, smooth installation
-  and upgrades.
-
-%\item Participation in the Debian community helps to assure Debian's
-%  aptness for the neuroscientific software demands
-
-\end{itemize}
-
-
-
-%\columnbreak
-
-\ndsubsection{How to get NeuroDebian}
-
-\textit{Debian/Ubuntu:} \url{neuro.debian.net} repository \\
-\textit{Others:} NeuroDebian Virtual Machine
-
-% Here place a left-top corner of OSX with seamless mode
-\vspace{3mm}
-\includegraphics[width=\columnwidth]{../shots/mac_vm_mricron}
-
-\begin{comment}
-\ndsubsection{Developers oriented information}
-
-%\columnbreak
-
-\ndsubsection{Who is using NeuroDebian}
-
-\noindent
-%\includegraphics[width=\columnwidth]{usage_worldmap}
-
-buga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga dugabuga duga
-\end{comment}
-
-
-\def\blank{\hspace{0em}\vspace{-1em}}
-\columnbreak
-
-\ndsubsection{Work-in-progress}
-\begin{description}[nolistsep,leftmargin=1pc,style=nextline]
-\item[Increased coverage]
-\textit{Electrophysiology:} Fieldtrip \\
-\textit{Neural Modeling:} NEURON, (NEST), LFPy \\
-\textit{Imaging:} DTI-TK, Freesurfer, XNAT, \ldots
-% \epigraph{Having FreeSurfer integrated into the Debian operating system by the NeuroDebian team would have enormous benefits for us, and for the thousands of users of FreeSurfer across the world.}{Prof. Bruce Fischl}{Director, Computational Core at Martinos Center at Massachusetts General Hospital, Charlestown, Massachusetts, USA}
-\item[Improved quality assurance]
-  Extended integration and regression testing\\
-  \url{http://testkraut.readthedocs.org}
-\item[Available snapshotting service]
-  % Entire NeuroDebian repository for any given past moment
-  All versions of packages readily available
-\item[Data as the 1st-class citizen]
-  \url{http://datalad.org} data distribution
-\item[Community knowledge exchange portal]
-  \url{http://community.neurodebian.org}
-% yoh: see TODO above -- we can say that it is available already
-%\item[Universal availability]
-%  % \begin{itemize}[nolistsep,leftmargin=1pc,topsep=0em]
-%  % \item Virtual Appliance enhancements
-%  %\item
-%  Cloud computing
-%  %\end{itemize}
-\end{description}
-
-
-\ndsubsection{Testimonials}
-\begin{flushright}
-\vspace{-0.5em}
-\url{http://neuro.debian.net/testimonials.html}
-\vspace{-0.5em}
-\end{flushright}
-
-% TODO  yoh: This one remains the best summary IMHO.  But may be
-% we would just kick this section out an place Testimonials into References
-\epigraph{The approach taken with NeuroDebian is plainly the most appropriate
-approach to software distribution for the dominant platform in brain
-image analysis, and I have great confidence that this project will be
-a major asset to the neuroscience community in facilitating the
-distribution of stable software, improving the reliability and
-replicability of analyses, and in helping to improve software
-development practices.}{Prof. Daniel Y. Kimberg}{Director, Data
-Processing Facility, Center for Functional Neuroimaging, University of
-Pennsylvania, Philadelphia, USA}
-
-\ndsubsection{Acknowledgements}
-
-NeuroDebian is grateful to all Debian developers and contributors for
-developing the Debian operating system, to
-\href{http://www.incf.org}{INCF} for the support in community outreach
-and technical collaborations, and to
-Prof. \href{http://haxbylab.dartmouth.edu}{James V. Haxby}
-(\href{http://www.dartmouth.edu/~psych}{PBS Department, Dartmouth
-  College}) for his continued support and endless supply of Italian
-espresso (\url{http://neuro.debian.net/coffeeart.html}).
-
-
-\ndsubsection{References}
-
-Halchenko, Y. O. \& Hanke, M. (2012). \href{http://www.frontiersin.org/Neuroinformatics/10.3389/fninf.2012.00022/full}{Open is not enough. Let’s take the next step: An integrated, community-driven computing platform for neuroscience}. Frontiers in Neuroinformatics, 6:22.
-
-% TODO: adjust for the new layout
-\url{http://neuro.debian.net/#publications}
-
-%\columnbreak
-\end{multicols}
-
-
-
 \end{document}