]> git.donarmstrong.com Git - neurodebian.git/commitdiff
Merge branch 'master' of alioth:/git/pkg-exppsy/neurodebian
authorMichael Hanke <michael.hanke@gmail.com>
Thu, 12 May 2011 20:50:08 +0000 (16:50 -0400)
committerMichael Hanke <michael.hanke@gmail.com>
Thu, 12 May 2011 20:50:08 +0000 (16:50 -0400)
* 'master' of alioth:/git/pkg-exppsy/neurodebian:
  pollutted survey with list of software

1  2 
sandbox/survey.rst

diff --combined sandbox/survey.rst
index 6a00f6fef510574a16a91e454dac9d3ff154f7c8,d127e1746f0ea7d1540b74312d66f4c9a64cc0c2..896b72a8d53cc3deadaf1dd8e801239ee1a99c62
@@@ -1,6 -1,6 +1,6 @@@
  
 -Computing environments in neuroscience research
 -===============================================
 +Scientific software usage in neuroscience research
 +==================================================
  
  .. raw:: html
  
     }
     </script>
  
 -General
 --------
 +   <form name="nss_survey" enctype="application/x-www-form-urlencoded">
  
 -Subfield of neuroscience: ``MRI, EEG, MEG, electrophys. ...``
 -Position: ``undergraduate, phd student, postdoc, professor/supervisor, sysadmin``
 -employer: ``higher education (private/public funding), research facility
 -(private/public funding, company)``
 -country: ``long list``
 -do you develop software intended to be used by other researchers: ``yes, no``
 +Personal background
 +-------------------
  
 -Personal computing environment
 -------------------------------
 +.. raw:: html
 +
 +   <table>
 +   <tr class="oddrow">
 +   <td>
 +
 +Which country are working in?
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +
 +.. raw:: html
 +   :file: select_country.inc
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr><td>
 +
 +Where are you working?
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <select name="position" size="1">
 +   <option value="none" selected="selected" label="Select an option"></option>
 +   <option value="edu_priv" label="Higher education (privately funded)"></option>
 +   <option value="edu_pub" label="Higher education (publicly funded)"></option>
 +   <option value="research_priv" label="Research institution (privately funded)"></option>
 +   <option value="research_pub" label="Research institution (publicly funded)"></option>
 +   <option value="company" label="Company"></option>
 +   </select>
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td>
 +
 +What is your position?
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <select name="position" size="1">
 +   <option value="none" selected="selected" label="Select an option"></option>
 +   <option value="undergrad" label="Undergraduate student"></option>
 +   <option value="graduate" label="PhD student"></option>
 +   <option value="postdoc" label="Postdoc"></option>
 +   <option value="professor" label="Professor/Supervisor"></option>
 +   <option value="ra" label="Research assistant"></option>
 +   <option value="researcher" label="Other researcher"></option>
 +   <option value="sysadmin" label="System administrator"></option>
 +   </select>
 +   </td></tr><tr><td>
 +
 +What type of data are you working with? Please check all items that apply.
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <table><tr><td>
 +   <input type="checkbox" name="datamod" value="behav" />Behavioral<br />
 +   <input type="checkbox" name="datamod" value="mri" />MRI/fMRI/DTI<br />
 +   <input type="checkbox" name="datamod" value="meeg" />EEG/MEG<br />
 +   </td><td>
 +   <input type="checkbox" name="datamod" value="pet" />PET/SPECT<br />
 +   <input type="checkbox" name="datamod" value="ephys" />Electrophysiology<br />
 +   <input type="checkbox" name="datamod" value="spectro" />Microspectroscopy<br />
 +   <input type="checkbox" name="datamod" value="other" />
 +   <input name="other_datamodality" type="text" size="20" maxlength="40">
 +   </td></tr></table>
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td>
 +
 +Are you developing software that is intended to be used by other researchers?
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <span><input type="radio" name="developer" value="yes" />Yes</span>
 +   <span><input type="radio" name="developer" value="no" checked="checked" />No</span>
 +   </td>
 +   </tr>
 +   </table>
 +
 +Personal scientific software environment
 +----------------------------------------
 +
 +Here are a few questions about your personal scientific software environment
 +for research activities like data acquisition, computational modeling, and data
 +analysis. You might be running this on your laptop, desktop, personal
 +workstation or any other machine where **you decide** what software you are
 +using, and you typically also have permission to **install it yourself**.  If
 +you are operating different environments, please describe the one that you find
 +most productive for your research purposes. If you don't have a machine that
 +you administer yourself, instead, please indicate what kind of scientific
 +software environment you would like to be doing your research in.
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   <table>
 +   <tr>
 +   <td>
 +
 +What type of hardware are you using?
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <select name="pref_env" size="1">
 +   <option value="none" selected="selected" label="Select an option"></option>
 +   <option value="laptop" label="Laptop/Portable device"></option>
 +   <option value="desktop" label="Commodity desktop"></option>
 +   <option value="workstation" label="High-performance workstation"></option>
 +   <option value="cluster" label="Compute cluster"></option>
 +   <option value="grid" label="Grid/Cloud-computing facility"></option>
 +   </select>
 +   </td></tr><tr><td>
 +
 +What operating system is this environment running on?
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <select name="pref_env" size="1">
 +
 +.. raw:: html
 +   :file: select_os_options.inc
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </select>
 +   </td></tr><tr><td>
 +
 +What fraction of your research activity time do you spend in this software
 +environment as opposed to any other environment that you migh have access to?
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <select name="pref_time" size="1">
 +   <option value="none" selected="selected" label="Select an option"></option>
 +   <option value="notime" label="None/I don't have this environment"></option>
 +   <option value="little" label="Less then half of the time"></option>
 +   <option value="most" label="More than half of the time"></option>
 +   <option value="always" label="All of the time"></option>
 +   </select>
 +   </td></tr><tr><td>
 +
 +How much time do you spend each month on maintaining this environment?  This
 +includes the time spent on operating system (security) upgrades, as well as
 +installing and updating scientific software.
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <input name="maint_time" type="text" size="3" maxlength="3"> hours per month
 +   </td>
 +   </tr>
 +   </table>
 +
 +---------------------------------------------------------------
 +
 +Please indicate how much you agree to the following statements.
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   <table>
 +   <tr><th colspan="2" style="text-align:left;font-weight:normal">
 +
 +*I prefer this particular scientific software environment because ...*
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </th></tr><tr class="oddrow">
 +   <td class="task">
 +
 +... the developers of an important research software recommend it
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr><td class="task">
 +
 +
 +... of the variety of available research software for this environment
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td class="task">
 +
 +
 +... of the availibility of commercial support
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr><td class="task">
 +
 +
 +... many of my colleagues use something similar
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td class="task">
 +
 +
 +... it is popular and I can get solutions for problems from web forums and mailing lists
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr><td class="task">
 +
 +
 +... I rely on an particular application that only runs in this environment
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td class="task">
 +
 +
 +... it has adequate support for all required hardware
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr><td class="task">
 +
 +
 +... I have the necessary technical skills to maintain this environment myself
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td>
 +   </tr>
 +   </table>
 +
 +
 +Managed scientific software environment
 +---------------------------------------
 +
 +The following questions are about a managed environment of scientific software
 +that is provided to you to carry out computing and data analysis related
 +research activities. Such an environment is typically managed by **dedicated IT
 +staff**, and **you don't have permissions to install arbitrary software**. This
 +environment may be shared by many researchers in a lab, a whole research
 +institution, or even be publicly accessible. If you have access to multiple
 +environments of this kind, please describe the one that offers most support for
 +your particular research purposes.
 +
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   <table class="questionaire">
 +   <tr>
 +   <td>
 +
 +What type of hardware is this software environment running on?
 +
 +.. raw:: html
  
 -Here are a few questions about your preferred computing environment for
 -research activities like data acquisition and data analysis. This might be your
 -laptop, desktop, personal workstation or any other machine where **you decide**
 -what software you are using, and you have permission to install it yourself.
 -If you are using multiple environment, please describe the one that you find
 -most productive for research purposes. If you don't have access to a machine
 -for research purposes that you administer yourself, instead, please indicate
 -what kind of environment you would like to be doing your research in.
 +   </td><td class="response">
 +   <select name="pref_env" size="1">
 +   <option value="none" selected="selected" label="Select an option"></option>
 +   <option value="laptop" label="Laptop/Portable device"></option>
 +   <option value="desktop" label="Commodity desktop"></option>
 +   <option value="workstation" label="High-performance workstation"></option>
 +   <option value="cluster" label="Compute cluster"></option>
 +   <option value="grid" label="Grid/Cloud-computing facility"></option>
 +   </select>
 +   </td></tr><tr><td>
  
 -Do you have it: ``yes, no``
  
 -Type: ``laptop, commodity desktop, dedicated workstation,
 -compute cluster, grid/cloud computing environment``
 +What operating system is this environment running on?
  
 -Operating system: ``detailed choice, long list``
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <select name="pref_env" size="1">
 +
 +.. raw:: html
 +   :file: select_os_options.inc
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </select>
 +   </td></tr><tr><td>
  
 -I prefer this environment because is offers (check all items that apply):
 +What fraction of time do you spend in this environment during your research
 +activities?
  
 -``checkboxes (variety of available software; hardware support; ...)``
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <select name="pref_time" size="1">
 +   <option value="none" selected="selected" label="Select an option"></option>
 +   <option value="notime" label="None/I don't use this"></option>
 +   <option value="little" label="Less then half of the time"></option>
 +   <option value="most" label="More than half of the time"></option>
 +   <option value="always" label="All of the time"></option>
 +   </select>
 +   </td>
 +   </tr>
 +   </table>
  
 +---------------------------------------------------------------
  
 -Institutionally provided computing environment
 -----------------------------------------------
 +How much do you agree to the following statements?
  
 -The following questions are about
 -What your employer offers.
 +.. raw:: html
  
 -Do you use it: ``yes, no``
 +   <table>
 +   <tr class="oddrow">
 +   <td class="task">
  
 -Type: ``laptop, commodity desktop, dedicated workstation,
 -compute cluster, grid/cloud computing environment``
 +This environment provides me with the best available tools for my research.
  
 -Operating system: ``detailed choice, long list``
 +.. raw:: html
  
 -I dislike (check all items that apply):
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr><td class="task">
 +
 +The support staff solves all my technical problems and addresses my demands in
 +a timely fashion.
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td class="task">
 +
 +There are always enough licenses for essential commerical software tools.
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr><td class="task">
 +
 +I need to deploy additional software to be able to perform my research in this environment.
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td class="task">
 +
 +
 +Using this managed environment is more cost effective than operating a suitable
 +environment myself.
 +
 +.. raw:: html
  
 -``checkboxes (limited set of available software; slow admin response; ...)``
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr><td class="task">
  
 +.. raw:: html
  
 +   </td>
 +   </tr>
 +   </table>
  
  Virtualization
  --------------
  
 -Do you use it? ``yes, no``
 +The following questions are about your usage of systems for hardware
 +virtualization in your research -- so-called **virtual machines**.
 +Virtualization is a technology that allows running more than one operating
 +systems on one machine at the same time.
  
 -IF
 -~~
 +.. raw:: html
  
 -What solution: ``multi select vbox, vmware, kvm, xem, qemu``
 -On what host system: ``detailed list``
 -With what guest system ``detailed list``
 +   <table>
 +   <tr class="oddrow">
 +   <td class="task">
  
 -Why do you use it: ``multi select``
 +How often do you use virtual machines for your research purposes?
  
 -  - Otherwise software incompatible with my system
 -  - Flexible snapshots
 -  - Portable (test developed software across platforms)
 +.. raw:: html
  
 -What fraction of computing task do you do in a VM?
 +   </td><td class="response">
 +   <select name="pref_time" size="1">
 +   <option value="none" selected="selected" label="Select an option"></option>
 +   <option value="never" label="Never"></option>
 +   <option value="occasionally" label="Occasionally"></option>
 +   <option value="often" label="Often"></option>
 +   <option value="always" label="Exclusively"></option>
 +   </select><div style="font-size:60%">(skip the remaining questions of this section if "never")</div>
 +   </td></tr><tr><td class="task">
  
 -Do you do computing on clusters?
 -Do you do computing in a cloud?
 +Which products for virtualization are you using?
  
 +.. raw:: html
  
 -Software usage
 ---------------
 +   </td><td class="response">
 +   <table><tr><td>
 +   <input type="checkbox" name="" value="" />VMWare<br />
 +   <input type="checkbox" name="" value="" />VirtualBox<br />
 +   <input type="checkbox" name="" value="" />Parallels<br />
 +   <input type="checkbox" name="" value="" />QEMU<br />
 +   </td><td>
 +   <input type="checkbox" name="" value="" />Virtual PC<br />
 +   <input type="checkbox" name="" value="" />Xen<br />
 +   <input type="checkbox" name="" value="" />KVM<br />
 +   <input type="checkbox" name="" value="other" />
 +   <input name="other_vm" type="text" size="20" maxlength="40">
 +   </td></tr></table>
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td>
 +
 +What **guest operating system** is running inside virtual machine?
  
 -What software are you using in your research?
 +.. raw:: html
  
 -? Do you use real-time Linux kernel? if yes, which: ``multi select RTAI, Xenomai, RT_Linux``
 +   </td><td class="response">
 +   <select name="pref_env" size="1">
  
 +.. raw:: html
 +   :file: select_os_options.inc
  
 -General purpose computing
 -~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
 +.. raw:: html
  
 -``check boxes``
 +   </select>
 +   </td></tr><tr><td>
  
 -Matlab, R, Python, Octave, ...
 +What **host operating system** are the virtual machines running on?
  
 -``various collections of software for various purposes``
 +.. raw:: html
  
 +   </td><td class="response">
 +   <select name="pref_env" size="1">
  
 -NeuroDebian
 ------------
 +.. raw:: html
 +   :file: select_os_options.inc
  
 -Do you use NeuroDebian repository: ``yes, no``
 +.. raw:: html
  
 -....
 +   </select>
 +   </td></tr><tr><td colspan="2">
  
 +What are your reasons for employing virtualization in you research?
 +Please indicate how much you agree to the following statements.
  
+ Generic computing/scripting/programming environments
+ C/C++
+ IDL
+ LISREL
+ Maple
+ Mathcad
+ Mathematica
+ Matlab
+ Octave
+ Perl
+ Python
+ R
+ Ruby
+ Scilab
+ SPSS
+ SCIRun
+ Shell scripting
+ Distributed Computing - frameworks and controllers
+ SGE
+ Torque/OpenPBS/Maui
+ Condor
+ Globus
+ MPI (any)
+ IPython
+ Imaging
+ 3D Slicer
+ AFNI
+ Aeskulap
+ Amide
+ BIRN Tools
+ BRAINS Tools
+ Bioimage Suite
+ BrainMap
+ BrainVISA/Anatomist
+ BrainVoyager
+ CMTK
+ Caret
+ ConnectomeViewer
+ DSI Studio
+ DTI-TK
+ Diffusion Toolkit/Trackvis
+ FSL
+ Fiji
+ FreeSurfer
+ ITK/SNAP
+ ImageJ
+ Invesalius
+ LONI
+ Lipsia
+ MIPAV/JIST
+ MRIcron
+ MRtrix
+ Mango
+ NiPy/NiTime/DiPy/NiPype
+ PyMVPA
+ REST
+ SPM
+ V3D
+ VoxBo
+ Data management
+ XNAT/PyXNAT/...
+ Human Imaging Database (HID)
+ Neural Systems Modeling
+ Brian
+ iqr
+ iNVT
+ NEURON
+ NEST
+ Genesis
+ Moose
+ PCSIM
+ PyNN
+ Electrophysiology
+ BioSig
+ BrainStorm
+ Chronus
+ EEGLAB
+ Fieldtrip
+ LORETA/sLORETA
+ OpenMEEG
+ Openelectrophy
+ RTXI
+ Relacs
+ ?Trellis-neuro
+ Brain-computer interface
+ BCI2000
+ OpenVIBE
+ Pyff
+ Hardware interface/Data acquisition
+ Comedi
+ EPICS
+ MX
+ Real-time solutions
+ RTAI
+ Xenomai
+ RTLinux
+ PREEMPT_RT
+ Psychophysics/Experimental Control
+ E-Prime
+ Presentation
+ PsychoPy
+ PyEPL
+ Psychtoolbox
+ Psytoolkit
+ OpenSesame
+ VisionEgg
+ Tscope
  .. raw:: html
  
 -   <input value="Go" type="button" onclick='JavaScript:xmlhttpPost("/cgi-bin/surveycollector.cgi")'></p>
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td class="task">
 +
 +I can run software that is otherwise incompatible with my system.
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr><td class="task">
 +
 +I have the ability to easily create snapshot of my whole analysis environment.
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td class="task">
 +
 +
 +I can take my complete analysis environment with me and run in on different
 +machines.
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td><td class="response">
 +   <div class="rating">Definitely agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly agree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Mostly disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   <div class="rating">Definitely disagree<br /><input type="radio" name="inst_r1" value="yes" /></div>
 +   </td>
 +   </tr>
 +   </table>
 +
 +
 +Resources for scientific software
 +---------------------------------
 +
 +Where do you obtain scientific software that you employ in your research? Please
 +check all items that apply.
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   <table class="questionaire">
 +   <tr class="oddrow">
 +   <td class="response"><input type="checkbox" name="software_resource" value="pet" /></td><td>
 +
 +Directly form vendor or project website
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr><td class="response"><input type="checkbox" name="software_resource" value="" /></td><td>
 +
 +Retailer
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td class="response"><input type="checkbox" name="software_resource" value="" /></td><td>
 +
 +`Extra Packages for Enterprise Linux (EPEL) <http://fedoraproject.org/wiki/EPEL>`_
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr><td class="response"><input type="checkbox" name="software_resource" value="" /></td><td>
 +
 +`Fink <http://www.finkproject.org>`_
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td class="response"><input type="checkbox" name="software_resource" value="" /></td><td>
 +
 +`FreeBSD ports <http://www.freebsd.org/ports/science.html>`_
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr><td class="response"><input type="checkbox" name="software_resource" value="" /></td><td>
 +
 +`International neuroinformatics Coordinating Facility (INCF) Research Tools <http://www.incf.org/resources/research-tools>`_
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td><input type="checkbox" name="software_resource" value="" /></td><td>
 +
 +`Macports <http://www.macports.org>`_
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr><td class="response"><input type="checkbox" name="software_resource" value="" /></td><td>
 +
 +`NeuroDebian <http://neuro.debian.net>`_
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td class="response"><input type="checkbox" name="software_resource" value="" /></td><td>
 +
 +`Neuroimaging Informatics Tools and Resources Clearinghouse (NITRC) <http://www.nitrc.org>`_
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr><td class="response"><input type="checkbox" name="software_resource" value="" /></td><td>
 +
 +`Python Package Index (PyPi) <http://pypi.python.org>`_
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr class="oddrow"><td class="response"><input type="checkbox" name="software_resource" value="" /></td><td>
 +
 +`Sourceforge <http://www.sourceforge.net>`_
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   </td></tr><tr><td class="response"><input type="checkbox" name="software_resource" value="other" /></td><td>
 +   <input name="other_resource" type="text" size="40" maxlength="200">
 +   </td></tr></table>
 +
 +Software selection
 +------------------
 +
 +.. raw:: html
 +
 +   <input value="Go" type="button"
 +          onclick='JavaScript:xmlhttpPost("/cgi-bin/surveycollector.cgi")'>
 +
     <div id="result"></div>
     </form>
  
  
 -Thanks
 +