unnecessarily rebuilt every time. Also clean bgzip.
all:$(PROG)
+.PHONY:all lib clean cleanlocal
+.PHONY:all-recur lib-recur clean-recur cleanlocal-recur install-recur
+
lib:libbam.a
libbam.a:$(LOBJS)
$(AR) -cru $@ $(LOBJS)
-samtools:lib $(AOBJS)
+samtools:$(AOBJS) libbam.a
$(CC) $(CFLAGS) -o $@ $(AOBJS) libbam.a -lm $(LIBPATH) $(LIBCURSES) -lz
razip:razip.o razf.o $(KNETFILE_O)
faidx_main.o:faidx.h razf.h
cleanlocal:
- rm -fr gmon.out *.o a.out *.exe *.dSYM razip $(PROG) *~ *.a
+ rm -fr gmon.out *.o a.out *.exe *.dSYM razip bgzip $(PROG) *~ *.a
clean:cleanlocal-recur
all:$(PROG)
+.PHONY:all lib clean cleanlocal
+.PHONY:all-recur lib-recur clean-recur cleanlocal-recur install-recur
+
lib:libbam.a
libbam.a:$(LOBJS)
$(AR) -cru $@ $(LOBJS)
-samtools:lib $(AOBJS)
+samtools:$(AOBJS) libbam.a
$(CC) $(CFLAGS) -o $@ $(AOBJS) $(LIBPATH) -lm -L. -lbam -Lwin32 -lz -lcurses -lws2_32
razip:razip.o razf.o $(KNETFILE_O)
faidx_main.o:faidx.h razf.h
clean:
- rm -fr gmon.out *.o *.exe *.dSYM razip $(PROG) *~ *.a
+ rm -fr gmon.out *.o *.exe *.dSYM razip bgzip $(PROG) *~ *.a