X-Git-Url: https://git.donarmstrong.com/?a=blobdiff_plain;ds=sidebyside;f=bp_test%2Fout%2Fread_embl.out.4;h=c74f84c4161108fa213ac638e907620136337fbb;hb=0253e2b8737fba111f4ec7406704dacaa4877d8d;hp=01ab57f4cae97463fb1181d8436fcdc3f2b50fba;hpb=fdaa61df56405472b0a8aa2591353c9b9cd416d6;p=biopieces.git diff --git a/bp_test/out/read_embl.out.4 b/bp_test/out/read_embl.out.4 index 01ab57f..c74f84c 100644 --- a/bp_test/out/read_embl.out.4 +++ b/bp_test/out/read_embl.out.4 @@ -2,8 +2,8 @@ TRANSLATION: SSIYNGISTSGLDLNNGTIADMRQLGIVESYKLKRAVVSSASEAAEVLLRVDNIIRARPRTANRQHM FEATURE: CDS LOCATOR: <1..206 AC: U49845; -SEQ: gatcctccatatacaacggtatctccacctcaggtttagatctcaacaacggaaccattgccgacatgagacagttaggtatcgtcgagagttacaagctaaaacgagcagtagtcagctctgcatctgaagccgctgaagttctactaagggtggataacatcatccgtgcaagaccaagaaccgccaatagacaacatatgta -SEQ_LEN: 205 +SEQ: gatcctccatatacaacggtatctccacctcaggtttagatctcaacaacggaaccattgccgacatgagacagttaggtatcgtcgagagttacaagctaaaacgagcagtagtcagctctgcatctgaagccgctgaagttctactaagggtggataacatcatccgtgcaagaccaagaaccgccaatagacaacatatgtaa +SEQ_LEN: 206 STRAND: + S_BEG: 0 S_END: 205 @@ -12,8 +12,8 @@ TRANSLATION: MTQLQISLLLTATISLLHLVVATPYEAYPIGKQYPPVARVNESFTFQISNDTYKSSVDKTAQITYNC FEATURE: CDS LOCATOR: 687..3158 AC: U49845; -SEQ: atgacacagcttcagatttcattattgctgacagctactatatcactactccatctagtagtggccacgccctatgaggcatatcctatcggaaaacaataccccccagtggcaagagtcaatgaatcgtttacatttcaaatttccaatgatacctataaatcgtctgtagacaagacagctcaaataacatacaattgcttcgacttaccgagctggctttcgtttgactctagttctagaacgttctcaggtgaaccttcttctgacttactatctgatgcgaacaccacgttgtatttcaatgtaatactcgagggtacggactctgccgacagcacgtctttgaacaatacataccaatttgttgttacaaaccgtccatccatctcgctatcgtcagatttcaatctattggcgttgttaaaaaactatggttatactaacggcaaaaacgctctgaaactagatcctaatgaagtcttcaacgtgacttttgaccgttcaatgttcactaacgaagaatccattgtgtcgtattacggacgttctcagttgtataatgcgccgttacccaattggctgttcttcgattctggcgagttgaagtttactgggacggcaccggtgataaactcggcgattgctccagaaacaagctacagttttgtcatcatcgctacagacattgaaggattttctgccgttgaggtagaattcgaattagtcatcggggctcaccagttaactacctctattcaaaatagtttgataatcaacgttactgacacaggtaacgtttcatatgacttacctctaaactatgtttatctcgatgacgatcctatttcttctgataaattgggttctataaacttattggatgctccagactgggtggcattagataatgctaccatttccgggtctgtcccagatgaattactcggtaagaactccaatcctgccaatttttctgtgtccatttatgatacttatggtgatgtgatttatttcaacttcgaagttgtctccacaacggatttgtttgccattagttctcttcccaatattaacgctacaaggggtgaatggttctcctactattttttgccttctcagtttacagactacgtgaatacaaacgtttcattagagtttactaattcaagccaagaccatgactgggtgaaattccaatcatctaatttaacattagctggagaagtgcccaagaatttcgacaagctttcattaggtttgaaagcgaaccaaggttcacaatctcaagagctatattttaacatcattggcatggattcaaagataactcactcaaaccacagtgcgaatgcaacgtccacaagaagttctcaccactccacctcaacaagttcttacacatcttctacttacactgcaaaaatttcttctacctccgctgctgctacttcttctgctccagcagcgctgccagcagccaataaaacttcatctcacaataaaaaagcagtagcaattgcgtgcggtgttgctatcccattaggcgttatcctagtagctctcatttgcttcctaatattctggagacgcagaagggaaaatccagacgatgaaaacttaccgcatgctattagtggacctgatttgaataatcctgcaaataaaccaaatcaagaaaacgctacacctttgaacaacccctttgatgatgatgcttcctcgtacgatgatacttcaatagcaagaagattggctgctttgaacactttgaaattggataaccactctgccactgaatctgatatttccagcgtggatgaaaagagagattctctatcaggtatgaatacatacaatgatcagttccaatcccaaagtaaagaagaattattagcaaaacccccagtacagcctccagagagcccgttctttgacccacagaataggtcttcttctgtgtatatggatagtgaaccagcagtaaataaatcctggcgatatactggcaacctgtcaccagtctctgatattgtcagagacagttacggatcacaaaaaactgttgatacagaaaaacttttcgatttagaagcaccagagaaggaaaaacgtacgtcaagggatgtcactatgtcttcactggacccttggaacagcaatattagcccttctcccgtaagaaaatcagtaacaccatcaccatataacgtaacgaagcatcgtaaccgccacttacaaaatattcaagactctcaaagcggtaaaaacggaatcactcccacaacaatgtcaacttcatcttctgacgattttgttccggttaaagatggtgaaaatttttgctgggtccatagcatggaaccagacagaagaccaagtaagaaaaggttagtagatttttcaaataagagtaatgtcaatgttggtcaagttaaggacattcacggacgcatcccagaaatgctgtg -SEQ_LEN: 2471 +SEQ: atgacacagcttcagatttcattattgctgacagctactatatcactactccatctagtagtggccacgccctatgaggcatatcctatcggaaaacaataccccccagtggcaagagtcaatgaatcgtttacatttcaaatttccaatgatacctataaatcgtctgtagacaagacagctcaaataacatacaattgcttcgacttaccgagctggctttcgtttgactctagttctagaacgttctcaggtgaaccttcttctgacttactatctgatgcgaacaccacgttgtatttcaatgtaatactcgagggtacggactctgccgacagcacgtctttgaacaatacataccaatttgttgttacaaaccgtccatccatctcgctatcgtcagatttcaatctattggcgttgttaaaaaactatggttatactaacggcaaaaacgctctgaaactagatcctaatgaagtcttcaacgtgacttttgaccgttcaatgttcactaacgaagaatccattgtgtcgtattacggacgttctcagttgtataatgcgccgttacccaattggctgttcttcgattctggcgagttgaagtttactgggacggcaccggtgataaactcggcgattgctccagaaacaagctacagttttgtcatcatcgctacagacattgaaggattttctgccgttgaggtagaattcgaattagtcatcggggctcaccagttaactacctctattcaaaatagtttgataatcaacgttactgacacaggtaacgtttcatatgacttacctctaaactatgtttatctcgatgacgatcctatttcttctgataaattgggttctataaacttattggatgctccagactgggtggcattagataatgctaccatttccgggtctgtcccagatgaattactcggtaagaactccaatcctgccaatttttctgtgtccatttatgatacttatggtgatgtgatttatttcaacttcgaagttgtctccacaacggatttgtttgccattagttctcttcccaatattaacgctacaaggggtgaatggttctcctactattttttgccttctcagtttacagactacgtgaatacaaacgtttcattagagtttactaattcaagccaagaccatgactgggtgaaattccaatcatctaatttaacattagctggagaagtgcccaagaatttcgacaagctttcattaggtttgaaagcgaaccaaggttcacaatctcaagagctatattttaacatcattggcatggattcaaagataactcactcaaaccacagtgcgaatgcaacgtccacaagaagttctcaccactccacctcaacaagttcttacacatcttctacttacactgcaaaaatttcttctacctccgctgctgctacttcttctgctccagcagcgctgccagcagccaataaaacttcatctcacaataaaaaagcagtagcaattgcgtgcggtgttgctatcccattaggcgttatcctagtagctctcatttgcttcctaatattctggagacgcagaagggaaaatccagacgatgaaaacttaccgcatgctattagtggacctgatttgaataatcctgcaaataaaccaaatcaagaaaacgctacacctttgaacaacccctttgatgatgatgcttcctcgtacgatgatacttcaatagcaagaagattggctgctttgaacactttgaaattggataaccactctgccactgaatctgatatttccagcgtggatgaaaagagagattctctatcaggtatgaatacatacaatgatcagttccaatcccaaagtaaagaagaattattagcaaaacccccagtacagcctccagagagcccgttctttgacccacagaataggtcttcttctgtgtatatggatagtgaaccagcagtaaataaatcctggcgatatactggcaacctgtcaccagtctctgatattgtcagagacagttacggatcacaaaaaactgttgatacagaaaaacttttcgatttagaagcaccagagaaggaaaaacgtacgtcaagggatgtcactatgtcttcactggacccttggaacagcaatattagcccttctcccgtaagaaaatcagtaacaccatcaccatataacgtaacgaagcatcgtaaccgccacttacaaaatattcaagactctcaaagcggtaaaaacggaatcactcccacaacaatgtcaacttcatcttctgacgattttgttccggttaaagatggtgaaaatttttgctgggtccatagcatggaaccagacagaagaccaagtaagaaaaggttagtagatttttcaaataagagtaatgtcaatgttggtcaagttaaggacattcacggacgcatcccagaaatgctgtga +SEQ_LEN: 2472 STRAND: + S_BEG: 686 S_END: 3157 @@ -22,8 +22,8 @@ TRANSLATION: MNRWVEKWLRVYLKCYINLILFYRNVYPPQSFDYTTYQSFNLPQFVPINRHPALIDYIEELILDVLS FEATURE: CDS LOCATOR: complement(3300..4037) AC: U49845; -SEQ: tgaatagatgggtagagaagtggctgagggtatacttaaaatgctacattaatttgattttattttatagaaatgtatacccacctcagtcattcgactacactacttaccagtcattcaacttgccgcagttcgttcccattaataggcatcctgctttaattgactatatagaagaacttatactggatgttctttctaaattaacgcacgtttacagattttccatctgcattattaataaaaagaacgatttatgcattgaaaaatacgttttagattttagtgaattacaacatgtggataaagacgatcagatcattacggaaactgaagtgttcgacgaattccgatcttccttaaatagtttgattatgcatttggagaaattacctaaagtcaacgatgacacaataacatttgaagcagttattaatgcgatcgaattggaactaggacataagttggacagaaacaggagggtcgatagtttggaggaaaaagcagaaattgaaagggattcaaactgggttaaatgtcaagaagatgaaaatttaccagacaataatggttttcaacctcctaaaataaaactcacttctttagtcggttctgacgtggggcctttgattattcatcagtttagtgaaaaattaatcagcggtgacgacaaaattttgaatggagtgtattctcaatatgaagagggcgagagcatttttggatctttgttttaa -SEQ_LEN: 737 +SEQ: atgaatagatgggtagagaagtggctgagggtatacttaaaatgctacattaatttgattttattttatagaaatgtatacccacctcagtcattcgactacactacttaccagtcattcaacttgccgcagttcgttcccattaataggcatcctgctttaattgactatatagaagaacttatactggatgttctttctaaattaacgcacgtttacagattttccatctgcattattaataaaaagaacgatttatgcattgaaaaatacgttttagattttagtgaattacaacatgtggataaagacgatcagatcattacggaaactgaagtgttcgacgaattccgatcttccttaaatagtttgattatgcatttggagaaattacctaaagtcaacgatgacacaataacatttgaagcagttattaatgcgatcgaattggaactaggacataagttggacagaaacaggagggtcgatagtttggaggaaaaagcagaaattgaaagggattcaaactgggttaaatgtcaagaagatgaaaatttaccagacaataatggttttcaacctcctaaaataaaactcacttctttagtcggttctgacgtggggcctttgattattcatcagtttagtgaaaaattaatcagcggtgacgacaaaattttgaatggagtgtattctcaatatgaagagggcgagagcatttttggatctttgttttaa +SEQ_LEN: 738 STRAND: - S_BEG: 3299 S_END: 4036