]> git.donarmstrong.com Git - bamtools.git/blobdiff - src/api/internal/SamHeaderValidator_p.h
Minor cleanup
[bamtools.git] / src / api / internal / SamHeaderValidator_p.h
index ee48f891500d72ba57e111273b2d23443e921f93..1fc1644dd5e1033019724bff5826e2218e246c24 100644 (file)
@@ -1,7 +1,6 @@
 // ***************************************************************************
 // SamHeaderValidator.h (c) 2010 Derek Barnett
 // Marth Lab, Department of Biology, Boston College
-// All rights reserved.
 // ---------------------------------------------------------------------------
 // Last modified: 13 January 2011 (DB)
 // ---------------------------------------------------------------------------
@@ -64,18 +63,13 @@ class SamHeaderValidator {
 
         // validate read group dictionary
         bool ValidateReadGroupDictionary(void);
-        bool ValidateReadGroup(const SamReadGroup& rg);
         bool ContainsUniqueIDsAndPlatformUnits(void);
+        bool ValidateReadGroup(const SamReadGroup& rg);
         bool CheckReadGroupID(const std::string& id);
         bool CheckSequencingTechnology(const std::string& technology);
-        bool Is454(const std::string& technology);
-        bool IsHelicos(const std::string& technology);
-        bool IsIllumina(const std::string& technology);
-        bool IsPacBio(const std::string& technology);
-        bool IsSolid(const std::string& technology);
 
         // validate program data
-        bool ValidateProgramData(void);
+        bool ValidateProgramChain(void);
         bool ContainsUniqueProgramIds(void);
         bool ValidatePreviousProgramIds(void);