]> git.donarmstrong.com Git - bamtools.git/blobdiff - src/api/internal/SamFormatParser_p.h
Organized api/internal into subdirs
[bamtools.git] / src / api / internal / SamFormatParser_p.h
diff --git a/src/api/internal/SamFormatParser_p.h b/src/api/internal/SamFormatParser_p.h
deleted file mode 100644 (file)
index cf6d54c..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,61 +0,0 @@
-// ***************************************************************************
-// SamFormatParser.h (c) 2010 Derek Barnett
-// Marth Lab, Department of Biology, Boston College
-// ---------------------------------------------------------------------------
-// Last modified: 23 December 2010 (DB)
-// ---------------------------------------------------------------------------
-// Provides functionality for parsing SAM header text into SamHeader object
-// ***************************************************************************
-
-#ifndef SAM_FORMAT_PARSER_H
-#define SAM_FORMAT_PARSER_H
-
-//  -------------
-//  W A R N I N G
-//  -------------
-//
-// This file is not part of the BamTools API.  It exists purely as an
-// implementation detail. This header file may change from version to version
-// without notice, or even be removed.
-//
-// We mean it.
-
-#include <string>
-#include <vector>
-
-namespace BamTools {
-
-class SamHeader;
-
-namespace Internal {
-
-class SamFormatParser {
-
-    // ctor & dtor
-    public:
-        SamFormatParser(BamTools::SamHeader& header);
-        ~SamFormatParser(void);
-
-    // parse text & populate header data
-    public:
-        void Parse(const std::string& headerText);
-
-    // internal methods
-    private:
-        void ParseSamLine(const std::string& line);
-        void ParseHDLine(const std::string& line);
-        void ParseSQLine(const std::string& line);
-        void ParseRGLine(const std::string& line);
-        void ParsePGLine(const std::string& line);
-        void ParseCOLine(const std::string& line);
-        const std::vector<std::string> Split(const std::string& line, const char delim);
-
-    // data members
-    private:
-        SamHeader& m_header;
-};
-
-} // namespace Internal
-} // namespace BamTools
-
-#endif // SAM_FORMAT_PARSER_H