]> git.donarmstrong.com Git - bamtools.git/blobdiff - src/api/internal/BamPipe_p.cpp
Organized api/internal into subdirs
[bamtools.git] / src / api / internal / BamPipe_p.cpp
diff --git a/src/api/internal/BamPipe_p.cpp b/src/api/internal/BamPipe_p.cpp
deleted file mode 100644 (file)
index e13ad7c..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,57 +0,0 @@
-// ***************************************************************************
-// BamPipe_p.cpp (c) 2011 Derek Barnett
-// Marth Lab, Department of Biology, Boston College
-// ---------------------------------------------------------------------------
-// Last modified: 10 October 2011 (DB)
-// ---------------------------------------------------------------------------
-// Provides BAM pipe-specific IO behavior
-// ***************************************************************************
-
-#include "api/internal/BamPipe_p.h"
-using namespace BamTools;
-using namespace BamTools::Internal;
-
-#include <cstdio>
-#include <iostream>
-using namespace std;
-
-BamPipe::BamPipe(void) : ILocalIODevice() { }
-
-BamPipe::~BamPipe(void) { }
-
-bool BamPipe::IsRandomAccess(void) const {
-    return false;
-}
-
-bool BamPipe::Open(const IBamIODevice::OpenMode mode) {
-
-    // make sure we're starting with a fresh pipe
-    Close();
-
-    // open stdin/stdout depending on requested openmode
-    if ( mode == IBamIODevice::ReadOnly )
-        m_stream = freopen(0, "rb", stdin);
-    else if ( mode == IBamIODevice::WriteOnly )
-        m_stream = freopen(0, "wb", stdout);
-    else {
-        SetErrorString("BamPipe::Open", "unknown open mode requested");
-        return false;
-    }
-
-    // check that we obtained a valid FILE*
-    if ( m_stream == 0 ) {
-        const string message_base = string("could not open handle on ");
-        const string message = message_base + ( (mode == IBamIODevice::ReadOnly) ? "stdin" : "stdout" );
-        SetErrorString("BamPipe::Open", message);
-        return false;
-    }
-
-    // store current IO mode & return success
-    m_mode = mode;
-    return true;
-}
-
-bool BamPipe::Seek(const int64_t& ) {
-    SetErrorString("BamPipe::Seek", "random access not allowed in FIFO pipe");
-    return false;
-}