]> git.donarmstrong.com Git - samtools.git/blobdiff - samtools.1
Release samtools-0.1.7 (r510)
[samtools.git] / samtools.1
index dee35abba1fb89c6dae1ec5cb3e5b83ebb92d0fe..31375f323f14f1df17a1f2b3b6185974d94c7b47 100644 (file)
@@ -1,4 +1,4 @@
-.TH samtools 1 "2 September 2009" "samtools-0.1.6" "Bioinformatics tools"
+.TH samtools 1 "10 November 2009" "samtools-0.1.7" "Bioinformatics tools"
 .SH NAME
 .PP
 samtools - Utilities for the Sequence Alignment/Map (SAM) format
@@ -123,8 +123,9 @@ is specified, all the alignments will be printed; otherwise only
 alignments overlapping the specified regions will be output. An
 alignment may be given multiple times if it is overlapping several
 regions. A region can be presented, for example, in the following
-format: `chr2', `chr2:1000000' or `chr2:1,000,000-2,000,000'. The
-coordinate is 1-based.
+format: `chr2' (the whole chr2), `chr2:1000000' (region starting from
+1,000,000bp) or `chr2:1,000,000-2,000,000' (region between 1,000,000 and
+2,000,000bp including the end points). The coordinate is 1-based.
 
 .B OPTIONS:
 .RS