]> git.donarmstrong.com Git - samtools.git/blobdiff - misc/wgsim_eval.pl
bamcheck: new stats, number of filtered vs raw sequences
[samtools.git] / misc / wgsim_eval.pl
index d3d9c6123c2b3ce1009fe82ccf14252aa4a4b9f8..f919a0643a0d2950d8f817c6213a3183f4f9a6dc 100755 (executable)
@@ -78,7 +78,7 @@ sub wgsim_eval {
          $c0[$i] = 0 unless (defined $c0[$i]);
          $c1[$i] = 0 unless (defined $c1[$i]);
          $cc0 += $c0[$i]; $cc1 += $c1[$i];
-         printf("%.2dx %12d / %-12d  %12d  %.3e\n", $i, $c1[$i], $c0[$i], $cc0, $cc1/$cc0);
+         printf("%.2dx %12d / %-12d  %12d  %.3e\n", $i, $c1[$i], $c0[$i], $cc0, $cc1/$cc0) if ($cc0);
        }
   } else {
        for (reverse(sort {$a<=>$b} (keys %fnfp))) {