]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blobdiff - man/subtreeplot.Rd
some small changes
[ape.git] / man / subtreeplot.Rd
index c9f80cee949ee3ded03824a218ef4561410da23d..33f846993f5586383387a6a0cad685dad75d29b9 100644 (file)
@@ -6,13 +6,13 @@
   (supposedly large) and a portion of it determined by clicking on the nodes of the phylogeny. On exit, returns the last subtree visualized.
 }
 \usage{
-subtreeplot(phy, wait=FALSE, ...)
+subtreeplot(x, wait=FALSE, ...)
 }
 
 \arguments{
   \item{x}{an object of class \code{"phylo"}.}
   \item{wait}{a logical indicating whether the node beeing processed should be printed (useful for big phylogenies).}
-  \item{...}{further arguments passed to \code{plot.phylo}.}
+  \item{\dots}{further arguments passed to \code{plot.phylo}.}
 }
 \details{
   This function aims at easily exploring very large trees. The main argument is
@@ -28,12 +28,14 @@ subtreeplot(phy, wait=FALSE, ...)
   \code{\link{plot.phylo}}, \code{\link{drop.tip}}, \code{\link{subtrees}}
 }
 \examples{
+\dontrun{
 #example 1: simple
-tree1<-rtree(50) #random tree with 50 leaves
-tree2<-subtreeplot(tree1, wait=TRUE) # on exit, tree2 will be a subtree of tree1.
+tree1 <- rtree(50)
+tree2 <- subtreeplot(tree1, wait = TRUE) # on exit, tree2 will be a subtree of tree1
 
 #example 2: more than one zoom
-tree1<-rtree(60)
-tree2<-subtreeplot(subtreeplot(subtreeplot(tree1))) #allows three succssive zooms.
+tree1 <- rtree(60)
+tree2 <- subtreeplot(subtreeplot(subtreeplot(tree1))) # allow three succssive zooms
+}
 }
 \keyword{hplot}