]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blobdiff - man/dist.dna.Rd
various fixes + del xenarthra
[ape.git] / man / dist.dna.Rd
index 2cee8e2f95898bd5fb8df0ee86b5c81f6bd5d894..49571b17ee657dafb09e819ac29f5068efcfa043 100644 (file)
@@ -40,6 +40,7 @@ dist.dna(x, model = "K80", variance = FALSE,
   brief description is given below; more details can be found in the
   References.
 
+\itemize{
   \item{``raw'', ``N''}{This is simply the proportion or the number of
     sites that differ between each pair of sequences. This may be useful
     to draw ``saturation plots''. The options \code{variance} and
@@ -110,7 +111,7 @@ dist.dna(x, model = "K80", variance = FALSE,
 
   \item{``paralin''}{Lake (1994) developed the paralinear distance which
     can be viewed as another variant of the Barry--Hartigan distance.}
-}
+}}
 \value{
   an object of class \link[stats]{dist} (by default), or a numeric
   matrix if \code{as.matrix = TRUE}. If \code{model = "BH87"}, a numeric