]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blobdiff - bp_test/test/test_write_fasta
added test for blast biopieces
[biopieces.git] / bp_test / test / test_write_fasta
index f1a9a771ffa002c2133c98dd01a793c26c05c2a1..63b1ecf9d2112e707e45f78f6b07a64e8489e33e 100755 (executable)
@@ -1,11 +1,16 @@
-#!/usr/bin/env sh
+#!/bin/bash
 
 source "$BP_DIR/bp_test/lib/test.sh"
 
-run "write_fasta -I $in -o $tmp.1 -x"
-assert_no_diff $tmp.1 $out.1
-rm $tmp.1
+run "$bp -I $in -o $tmp -x"
+assert_no_diff $tmp $out.1
+rm $tmp
 
-run "write_fasta -I $in -w 4 -o $tmp.2 -x"
-assert_no_diff $tmp.2 $out.2
-rm $tmp.2
+run "$bp -I $in -w 4 -o $tmp -x"
+assert_no_diff $tmp $out.2
+rm $tmp
+
+run "$bp -I $in -w 4 -Z -o $tmp.gz -x"
+gunzip $tmp.gz
+assert_no_diff $tmp $out.3
+rm $tmp