]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blobdiff - bp_test/out/usearch_seq.out.2
projects / biopieces.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
fixing usearch upgrade
[biopieces.git] / bp_test / out / usearch_seq.out.2
diff --git a/bp_test/out/usearch_seq.out.2 b/bp_test/out/usearch_seq.out.2
new file mode 100644 (file)
index 0000000..3739ccc
--- /dev/null
+++ b/bp_test/out/usearch_seq.out.2
@@ -0,0 +1,403 @@
+SEQ_NAME: test1
+SEQ: tgtacgtagctagctagctagctagctagctagctagctagctgactatcgtgatcgtg
+SEQ_LEN: 59
+---
+SEQ_NAME: test1_100
+SEQ: tgtacgtagctagctagctagctagctagctagctagctagctgactatcgtgatcgtg
+SEQ_LEN: 59
+---
+SEQ_NAME: test1_2
+SEQ: tgtacgtagctagctagctagctagcGagctagctagcAagctgactatcgtgatcgtg
+SEQ_LEN: 59
+---
+SEQ_NAME: test2
+SEQ: ggttgtgtgtgtgtatcgatgtagtctacatcgtctatctgtactgacttactgactac
+SEQ_LEN: 59
+---
+SEQ_NAME: test2_100
+SEQ: ggttgtgtgtgtgtatcgatgtagtctacatcgtctatctgtactgacttactgactac
+SEQ_LEN: 59
+---
+SEQ_NAME: test2_1
+SEQ: ggtAgtgtgtgAgtatcgatgtagtctacatcgtctatctgtactgacttactgactac
+SEQ_LEN: 59
+---
+SEQ_NAME: test1_rc
+SEQ: cacgatcacgatagtcagctagctagctagctagctagctagctagctagctacgtaca
+SEQ_LEN: 59
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1
+S_ID: test1_rc
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 36
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 7
+Q_END: 42
+S_BEG: 16
+S_END: 51
+E_VAL: 1.1e-16
+SCORE: 67.6
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1
+S_ID: test1_rc
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 6
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 2
+Q_END: 7
+S_BEG: 51
+S_END: 56
+E_VAL: 5.2
+SCORE: 12.2
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1
+S_ID: test1_100
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-29
+SCORE: 110.1
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1
+S_ID: test1
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-29
+SCORE: 110.1
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1_100
+S_ID: test1_rc
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 36
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 7
+Q_END: 42
+S_BEG: 16
+S_END: 51
+E_VAL: 1.1e-16
+SCORE: 67.6
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1_100
+S_ID: test1_rc
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 6
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 2
+Q_END: 7
+S_BEG: 51
+S_END: 56
+E_VAL: 5.2
+SCORE: 12.2
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1_100
+S_ID: test1_100
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-29
+SCORE: 110.1
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1_100
+S_ID: test1
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-29
+SCORE: 110.1
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1_2
+S_ID: test1
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 6
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 2
+Q_END: 7
+S_BEG: 2
+S_END: 7
+E_VAL: 5.2
+SCORE: 12.2
+STRAND: -
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1_2
+S_ID: test1_100
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 6
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 2
+Q_END: 7
+S_BEG: 2
+S_END: 7
+E_VAL: 5.2
+SCORE: 12.2
+STRAND: -
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1_2
+S_ID: test1_2
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-29
+SCORE: 110.1
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test2
+S_ID: test2
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-24
+SCORE: 93.5
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test2
+S_ID: test2_100
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-24
+SCORE: 93.5
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test2_100
+S_ID: test2
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-24
+SCORE: 93.5
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test2_100
+S_ID: test2_100
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-24
+SCORE: 93.5
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test2_1
+S_ID: test2
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 6
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 14
+Q_END: 19
+S_BEG: 14
+S_END: 19
+E_VAL: 5.2
+SCORE: 12.2
+STRAND: -
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test2_1
+S_ID: test2
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 6
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 53
+Q_END: 58
+S_BEG: 20
+S_END: 25
+E_VAL: 5.2
+SCORE: 12.2
+STRAND: -
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test2_1
+S_ID: test2
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 6
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 20
+Q_END: 25
+S_BEG: 53
+S_END: 58
+E_VAL: 5.2
+SCORE: 12.2
+STRAND: -
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test2_1
+S_ID: test2_100
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 6
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 20
+Q_END: 25
+S_BEG: 53
+S_END: 58
+E_VAL: 5.2
+SCORE: 12.2
+STRAND: -
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test2_1
+S_ID: test2_1
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.1e-26
+SCORE: 100.8
+STRAND: +
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test2_1
+S_ID: test2_100
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 6
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 14
+Q_END: 19
+S_BEG: 14
+S_END: 19
+E_VAL: 5.2
+SCORE: 12.2
+STRAND: -
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test2_1
+S_ID: test2_100
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 6
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 53
+Q_END: 58
+S_BEG: 20
+S_END: 25
+E_VAL: 5.2
+SCORE: 12.2
+STRAND: -
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1_rc
+S_ID: test1
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-29
+SCORE: 110.1
+STRAND: -
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1_rc
+S_ID: test1_100
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-29
+SCORE: 110.1
+STRAND: -
+---
+REC_TYPE: USEARCH
+Q_ID: test1_rc
+S_ID: test1_rc
+IDENT: 100.0
+ALIGN_LEN: 59
+MISMATCHES: 0
+GAPS: 0
+Q_BEG: 0
+Q_END: 58
+S_BEG: 0
+S_END: 58
+E_VAL: 1.8e-29
+SCORE: 110.1
+STRAND: +
+---
Mirror (and my branches) of biopieces http://www.biopieces.org/