]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blobdiff - bp_conf/bashrc
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[biopieces.git] / bp_conf / bashrc
index 06563c6d2d86ee4ff66323d8aec9f1cd2ad49dfa..473e0c5fc8e03023252c29371286bd877c74acd0 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
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-### Stuff that enables biopieces.
+### Stuff that enables Biopieces.
 
 ### BP_DIR, BP_DATA, BP_TMP, and BP_LOG should all be set in ~/.bashrc
 ### see http://code.google.com/p/biopieces/wiki/Installation
@@ -16,11 +16,18 @@ export BP_C="$BP_DIR/code_c"                # Direcotry with c code.
 export BP_PYTHON="$BP_DIR/code_python"      # Direcotry with Pyton code.
 export BP_RUBY="$BP_DIR/code_ruby"          # Direcotry with Ruby code.
 
-### Here we add the biopiece variable to the existing PATH and PERL5LIB variables.
+### Here we add the biopiece variable to the existing PATH.
+
+export PATH="$PATH:$BP_BIN"
+
+### Here we add the Biopieces Perl modules to PERL5LIB.
 
-export PATH="$PATH:$BP_BIN"  
 export PERL5LIB="$PERL5LIB:$BP_PERL"
 
+### Here we add the Biopieces Ruby libraries to RUBYLIB.
+
+export RUBYLIB="$RUBYLIB:$BP_RUBY"
+
 ### Alias allowing power scripting with biopieces.
 
 alias bioscript="perl -MMaasha::Biopieces=read_stream,get_record,put_record -e"