]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blobdiff - bp_bin/write_bed
removed debug message
[biopieces.git] / bp_bin / write_bed
index 51cdc758225af677fab9ee31c3f7f0fbb6ef116f..5b1e1564934599c7cc475e075bdede71139f8f26 100755 (executable)
@@ -54,8 +54,6 @@ $fh = Maasha::Biopieces::write_stream( $options->{ 'data_out' }, $options->{ 'co
 
 while ( $record = Maasha::Biopieces::get_record( $in ) ) 
 {
-    $record = Maasha::UCSC::psl2record( $record ) if $record->{ 'tBaseInsert' }; # Dirty addition to allow Affy data from MySQL to be dumped
-
     if ( $bed_entry = Maasha::UCSC::BED::biopiece2bed( $record, $options->{ 'cols' } ) ) {
         Maasha::UCSC::BED::bed_entry_put( $bed_entry, $fh, $options->{ 'cols' }, $options->{ 'check' } );
     }