]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blobdiff - bp_bin/plot_histogram
removed debug message
[biopieces.git] / bp_bin / plot_histogram
index 4950305b8aede84ba0a131644860836bb992abd0..c46b395a87b82649a3f9f277191f8fb334824f0c 100755 (executable)
@@ -38,18 +38,19 @@ use Maasha::Plot;
 my ( $options, $in, $out, $default, $terminals, $record, %data_hash, $max, @data_list, $i, $result, $fh );
 
 $default   = "Histogram";
-$terminals = "dumb,x11,aqua,post,svg";
+$terminals = "dumb,x11,aqua,post,svg,png";
 
 $options = Maasha::Biopieces::parse_options(
     [
-        { long => 'no_stream', short => 'x', type => 'flag',   mandatory => 'no',  default => undef,    allowed => undef,      disallowed => undef },
-        { long => 'data_out',  short => 'o', type => 'file',   mandatory => 'no',  default => undef,    allowed => undef,      disallowed => undef },
-        { long => 'key',       short => 'k', type => 'string', mandatory => 'yes', default => undef,    allowed => undef,      disallowed => undef },
-        { long => 'terminal',  short => 't', type => 'string', mandatory => 'no',  default => 'dumb',   allowed => $terminals, disallowed => undef },
-        { long => 'title',     short => 'T', type => 'string', mandatory => 'no',  default => $default, allowed => undef,      disallowed => undef },
-        { long => 'xlabel',    short => 'X', type => 'string', mandatory => 'no',  default => undef,    allowed => undef,      disallowed => undef },
-        { long => 'ylabel',    short => 'Y', type => 'string', mandatory => 'no',  default => undef,    allowed => undef,      disallowed => undef },
-        { long => 'sort',      short => 's', type => 'string', mandatory => 'no',  default => 'alph',   allowed => 'num,alph', disallowed => undef },
+        { long => 'no_stream',  short => 'x', type => 'flag',   mandatory => 'no',  default => undef,    allowed => undef,      disallowed => undef },
+        { long => 'data_out',   short => 'o', type => 'file',   mandatory => 'no',  default => undef,    allowed => undef,      disallowed => undef },
+        { long => 'key',        short => 'k', type => 'string', mandatory => 'yes', default => undef,    allowed => undef,      disallowed => undef },
+        { long => 'terminal',   short => 't', type => 'string', mandatory => 'no',  default => 'dumb',   allowed => $terminals, disallowed => undef },
+        { long => 'title',      short => 'T', type => 'string', mandatory => 'no',  default => $default, allowed => undef,      disallowed => undef },
+        { long => 'xlabel',     short => 'X', type => 'string', mandatory => 'no',  default => undef,    allowed => undef,      disallowed => undef },
+        { long => 'ylabel',     short => 'Y', type => 'string', mandatory => 'no',  default => undef,    allowed => undef,      disallowed => undef },
+        { long => 'sort',       short => 's', type => 'string', mandatory => 'no',  default => 'alph',   allowed => 'num,alph', disallowed => undef },
+        { long => 'logscale_y', short => 'L', type => 'flag',   mandatory => 'no',  default => undef,    allowed => undef,      disallowed => undef },
     ]   
 );