CC= gcc
-CFLAGS= -g -Wall #-O2 #-fPIC #-m64 #-arch ppc
+CFLAGS= -g -Wall -O2 #-m64 #-arch ppc
DFLAGS= -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_USE_KNETFILE
-LOBJS= bcf.o vcf.o bcfutils.o prob1.o index.o
+LOBJS= bcf.o vcf.o bcfutils.o prob1.o kfunc.o index.o fet.o bcf2qcall.o
OMISC= ..
-AOBJS= vcfout.o main.o $(OMISC)/kstring.o $(OMISC)/bgzf.o $(OMISC)/knetfile.o
+AOBJS= call1.o main.o $(OMISC)/kstring.o $(OMISC)/bgzf.o $(OMISC)/knetfile.o
PROG= bcftools
INCLUDES=
SUBDIRS= .