CC= gcc
CFLAGS= -g -Wall -O2 #-m64 #-arch ppc
DFLAGS= -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_USE_KNETFILE
-LOBJS= bcf.o vcf.o bcfutils.o prob1.o kfunc.o index.o fet.o
+LOBJS= bcf.o vcf.o bcfutils.o prob1.o ld.o kfunc.o index.o fet.o bcf2qcall.o
OMISC= ..
AOBJS= call1.o main.o $(OMISC)/kstring.o $(OMISC)/bgzf.o $(OMISC)/knetfile.o
PROG= bcftools
$(CC) $(CFLAGS) -o $@ $(AOBJS) -lm $(LIBPATH) -lz -L. -lbcf
bcf.o:bcf.h
+vcf.o:bcf.h
+index.o:bcf.h
+bcfutils.o:bcf.h
prob1.o:prob1.h bcf.h
-vcfout.o:bcf.h prob1.h
+call1.o:prob1.h bcf.h
+bcf2qcall.o:bcf.h
main.o:bcf.h
bcf.pdf:bcf.tex