]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blobdiff - NEWS
fix in c.multiPhylo()
[ape.git] / NEWS
diff --git a/NEWS b/NEWS
index 9e66a45982269e849ce15198fc94c2813a598e50..0fb711979f9b827a89a072ca869d5606a6b1e201 100644 (file)
--- a/NEWS
+++ b/NEWS
@@ -3,10 +3,16 @@
 
 NEW FEATURES
 
+    o The new function compute.brtime computes and sets branching times.
+
     o mantel.test() has a new argument 'alternative' which is
       "two-sided" by default. Previously, this test was one-tailed
       with no possibility to change.
 
+    o ace() can now do REML estimation with continuous characters,
+      giving better estimates of the variance of the Brownian motion
+      process.
+
 
 BUG FIXES
 
@@ -21,6 +27,12 @@ BUG FIXES
     o Cross-validation in chronopl() did not work when 'age.max' was
       used.
 
+    o consensus(, p = 0.5) could return an incorrect tree if some
+      incompatible splits occur in 50% of the trees (especially with
+      small number of trees).
+
+    o c() with "multiPhylo" did not work correctly.
+
 
 
                CHANGES IN APE VERSION 2.7-2