* samtools-0.1.7-2 (r520)

[samtools.git] / Makefile

diff --git a/Makefile b/Makefile
index 246ac5cd329dba60aa9dcfc7552132c3fea8e430..2a7ab713d3c71a683fe792ca76bd45e865b99b87 100644 (file)
--- a/Makefile
+++ b/Makefile
@@ -36,10 +36,10 @@ libbam.a:$(LOBJS)
                $(AR) -cru $@ $(LOBJS)
 
 samtools:lib $(AOBJS)
-               $(CC) $(CFLAGS) -o $@ $(AOBJS) -lm $(LIBPATH) $(LIBCURSES) -lz -L. -lbam
+               $(CC) $(CFLAGS) -o $@ $(AOBJS) libbam.a -lm $(LIBPATH) $(LIBCURSES) -lz
 
-razip:razip.o razf.o
-               $(CC) $(CFLAGS) -o $@ razf.o razip.o -lz
+razip:razip.o razf.o knetfile.o
+               $(CC) $(CFLAGS) -o $@ razf.o razip.o knetfile.o -lz
 
 bgzip:bgzip.o bgzf.o
                $(CC) $(CFLAGS) -o $@ bgzf.o bgzip.o -lz
@@ -63,6 +63,6 @@ faidx.o:faidx.h razf.h khash.h
 faidx_main.o:faidx.h razf.h
 
 cleanlocal:
-               rm -fr gmon.out *.o a.out *.dSYM razip $(PROG) *~ *.a
+               rm -fr gmon.out *.o a.out *.exe *.dSYM razip $(PROG) *~ *.a
 
 clean:cleanlocal-recur