]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blobdiff - ChangeLog
various fixes + del xenarthra
[ape.git] / ChangeLog
index 6e2f4f15ac1ac7ee4619f2f18504019c1227f0b3..b6bffe8687b5bf9a7dc248c22ae7d5b7ed99725f 100644 (file)
--- a/ChangeLog
+++ b/ChangeLog
@@ -1,9 +1,37 @@
+               CHANGES IN APE VERSION 2.3
+
+
+NEW FEATURES
+
+    o The new functions CADM.global and CADM.post, contributed by
+      Pierre Legendre, test the congruence among several distance
+      matrices.
+
+    o The new function yule.time fits a user-defined time-dependent
+      Yule model by maximum likelihood.
+
+
+BUG FIXES
+
+    o drop.tip() shuffled tip labels in some cases.
+
+    o is.ultrametric() now checks the ordering of the edge matrix.
+
+
+OTHER CHANGES
+
+    o The data set xenarthra has been removed.
+
+
+
                CHANGES IN APE VERSION 2.2-4
 
 BUG FIXES
 
     o The bug fix in read.nexus() in version 2.2-3 was wrong: this is
-      now fixed. (thanks to Peter Wragg for the fix!)
+      now fixed. (Thanks to Peter Wragg for the fix!)
+
+    o A warning message occurred for no reason with ace(method="GLS").
 
 
 OTHER CHANGES