]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blobdiff - ChangeLog
faster rcoal... at last!
[ape.git] / ChangeLog
index ffbca029d4e12518c0b3f326641a93dc80e44e73..9191a65ad570749ac6c449b469c9158c1624b841 100644 (file)
--- a/ChangeLog
+++ b/ChangeLog
@@ -1,3 +1,27 @@
+               CHANGES IN APE VERSION 2.3-1
+
+
+BUG FIXES
+
+    o dist.gene() failed on most occasions with the default
+      pairwise.deletion = FALSE.
+
+    o read.tree() failed to read correctly the tree name(s).
+
+    o boot.phylo() now treats correctly data frames.
+
+
+OTHER CHANGES
+
+    o [.multiPhylo and [.DNAbin now respect the original class.
+
+    o Instances of the form class(phy) == "phylo" have been replaced
+      by inherits(phy, "phylo").
+
+    o rcoal() should be faster.
+
+
+
                CHANGES IN APE VERSION 2.3