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final version for ape 2.6-1
[ape.git] / ChangeLog
index b4a7e8a377c17ed2308d424dfcf3f608363c71e8..50d75d73f9b7a4fac1710b6c1ecd248d6474bf1c 100644 (file)
--- a/ChangeLog
+++ b/ChangeLog
@@ -1,8 +1,17 @@
                CHANGES IN APE VERSION 2.6-1
 
 
+NEW FEATURES
+
+    o The new speciesTree calculates the species tree from a set of gene
+      trees. Several methods are available including maximum tree and
+      shallowest divergence tree.
+
+
 BUG FIXES
 
+    o A bug introduced in write.tree() with ape 2.6 has been fixed.
+
     o as.list.DNAbin() did not work correctly with vectors.
 
     o as.hclust.phylo() failed with trees with node labels (thanks to
@@ -69,8 +78,8 @@ OTHER CHANGES
     o pic() now returns a vector with the node labels of the tree (if
       available) as names.
 
-    o write.tree() and read.tree() have been substantially thanks to
-      contributions by Klaus Schliep.
+    o write.tree() and read.tree() have been substantially improved thanks
+      to contributions by Klaus Schliep.