]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blobdiff - ChangeLog
bug fix in write.tree()
[ape.git] / ChangeLog
index 94d9816f25afd2f3ca0a76b58d2918b99f01788e..057cf583a570dd78448d2e318059d3aaadd33e53 100644 (file)
--- a/ChangeLog
+++ b/ChangeLog
@@ -18,6 +18,22 @@ BUG FIXES
     o dist.nodes() returned duplicated column(s) with unrooted and/or
       multichotomous trees.
 
+    o mcmc.popsize() terminated unexpectedly if the progress bar was
+      turned off.
+
+    o prop.part(x) made R frozen if 'x' is of class "multiPhylo".
+
+    o Compilation under Mandriva failed (thanks to Jos Käfer for the fix).
+
+    o drop.tip() shuffled tip labels with subtree = TRUE or trim.internal
+      = FALSE.
+
+    o Objects returned by as.hclust.phylo() failed when analysed with
+      cutree() or rect.hclust().
+
+    o write.tree() did not output correctly node labels (thanks to Naim
+      Matasci for the fix).
+
 
 
                CHANGES IN APE VERSION 2.6-1