]> git.donarmstrong.com Git - bamtools.git/blobdiff - BamMultiReader.h
added warning for duplicate @RG tag in header
[bamtools.git] / BamMultiReader.h
index f1a2bb242e450785c5cacf32517d393a93fc9e1a..6d5a805f2739c9306ac6c9d2f23bc37b63ab388e 100644 (file)
@@ -15,6 +15,7 @@
 #include <string>\r
 #include <map>\r
 #include <utility> // for pair\r
+#include <sstream>\r
 \r
 using namespace std;\r
 \r
@@ -27,6 +28,7 @@ namespace BamTools {
 // index mapping reference/position pairings to bamreaders and their alignments\r
 typedef multimap<pair<int, int>, pair<BamReader*, BamAlignment*> > AlignmentIndex;\r
 \r
+\r
 class BamMultiReader {\r
 \r
     // constructor / destructor\r