-DFLAGS= -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_USE_KNETFILE -D_BCF_QUAD
-LOBJS= bcf.o vcf.o bcfutils.o prob1.o kfunc.o index.o fet.o
+DFLAGS= -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_USE_KNETFILE
+LOBJS= bcf.o vcf.o bcfutils.o prob1.o em.o kfunc.o kmin.o index.o fet.o mut.o bcf2qcall.o