survey/makestats

   1 #!/usr/bin/python
   2
   3 from glob import glob
   4 import json
   5 import sys
   6 import pylab as pl
   7 import numpy as np
   8 import time
   9 from mvpa.misc.plot.base import plot_bars
  10
  11 # uniform colors for OS results
  12 os_colors = ['#B63537', '#4E4DA0', '#008200', 'gray']
  13 os_order = ['linux', 'mac', 'win', 'otheros']
  14 # resources
  15 resource_categories = {
  16     'vendor': 'Vendor/Project website',
  17     'retailer': 'Retailer',
  18     'os': 'Operating system',
  19     'cpan': 'CPAN',
  20     'cran': 'CRAN',
  21     'epel': 'EPEL',
  22     'fink': 'Fink',
  23     'freebsdports': 'FreeBSD ports',
  24     'incf': 'INCF',
  25     'macports': 'Macports',
  26     'matlabcentral': 'Matlab Central',
  27     'neurodebian': 'NeuroDebian',
  28     'nitrc': 'NITRC',
  29     'pypi': 'PyPi',
  30     'pythonbundles': 'Python bundles',
  31     'sourceforge': 'Sourceforge',
  32     'other': 'Other resource'
  33     }
  34 # software categories
  35 sw_categories = {
  36         'general': 'General computing',
  37         'dc': 'Distributed computing',
  38         'img': 'Brain imaging',
  39         'datamanage': 'Data management',
  40         'neusys': 'Neural systems modeling',
  41         'electro': 'Electrophysiology, MEG/EEG',
  42         'bci': 'Brain-computer interface',
  43         'acq': 'Hardware interface/Data acquisition',
  44         'rt': 'Real-time solutions',
  45         'psychophys': 'Psychophysics/Experiment control'
  46         }
  47
  48 # some meaningful groups of OSes
  49 redhat_family = ["rhel", "centos", "fedora", "scilinux"]
  50 debian_family = ["debian", "ubuntu", "biolinux"]
  51 suse_family = ["suse", "slel"]
  52 other_linux_family = ["gentoo", "mandriva", "arch", "slackware", "otherlinux"]
  53 other_family = ["starbsd", "unix", "qnx", "beos", "solaris", "other"]
  54
  55 os_cat_names = {
  56         'win': 'Windows',
  57         'mac': 'Mac OS',
  58         'linux': 'GNU/Linux',
  59         'otheros': 'Other OS'
  60         }
  61
  62 os_family = {
  63         'win': ["windows"],
  64         'mac': ["macosx"],
  65         'linux': redhat_family + debian_family + suse_family + other_linux_family,
  66         'otheros': other_family
  67         }
  68 # end the reverse mapping
  69 os_family_rev = {}
  70 for ost in os_family:
  71     for os in os_family[ost]:
  72         os_family_rev[os] = ost
  73
  74
  75 def load_list2dict(name):
  76     d = {}
  77     lfile = open(name)
  78     for line in lfile:
  79         kv = line.split(':')
  80         d[kv[0]] = kv[1].strip().strip('"')
  81     return d
  82
  83
  84
  85 class DB(dict):
  86     os_dict = load_list2dict('oslist.txt')
  87     datamod_dict = load_list2dict('datamodlist.txt')
  88     sw_dict = load_list2dict('swlist.txt')
  89
  90     def __init__(self, srcdir):
  91         # eats the whole directory
  92         if srcdir is None:
  93             return
  94         datafilenames = glob('%s/*.json' % srcdir)
  95         for dfn in datafilenames:
  96             rawdata = json.load(open(dfn))
  97             self[rawdata['timestamp']] = rawdata
  98
  99     def get_unique(self, key):
 100         # return a set of all (unique) values for a field id
 101         uniq = set()
 102         for d in self.values():
 103             if key in d:
 104                 el = d[key]
 105                 if isinstance(el, list):
 106                     uniq = uniq.union(el)
 107                 else:
 108                     uniq = uniq.union((el,))
 109         return uniq
 110
 111     def get_not_none(self, key):
 112         # return a list of all values of a specific field id
 113         # the second return value is count of submission that did not have data
 114         # for this field id
 115         val = []
 116         missing = 0
 117         for d in self.values():
 118             if key in d:
 119                 el = d[key]
 120                 if isinstance(el, list):
 121                     val.extend(el)
 122                 else:
 123                     if el == 'none':
 124                         missing += 1
 125                     else:
 126                         val.append(el)
 127             else:
 128                 missing += 1
 129         return val, missing
 130
 131     def get_counts(self, key):
 132         # return a dict with field values as keys and respective submission
 133         # count as value
 134         vals = self.get_not_none(key)[0]
 135         uniq = np.unique(vals)
 136         counts = dict(zip(uniq, [vals.count(u) for u in uniq]))
 137         return counts
 138
 139     def select_match(self, key, values):
 140         # return a db with all submissions were a field id has one of the
 141         # supplied values
 142         match = DB(None)
 143         for k, v in self.items():
 144             if not key in v:
 145                 continue
 146             el = v[key]
 147             if isinstance(el, list):
 148                 if len(set(values).intersection(el)):
 149                     match[k] = v
 150             elif el in values:
 151                 match[k] = v
 152         return match
 153
 154     def get_nice_name(self, id):
 155         srcs = [DB.os_dict, os_cat_names, DB.sw_dict, sw_categories,
 156                 resource_categories]
 157         for src in srcs:
 158             if id in src:
 159                 return src[id]
 160         # not found, nothing nicer
 161         return id
 162
 163
 164 def mkpic_os_per_env(db, destdir):
 165     envs = ['pers_os', 'man_os', 'virt_host_os', 'virt_guest_os']
 166     env_names = ['Personal', 'Managed', 'Virt. Host', 'Virt. Guest']
 167     env_stats = {}
 168     offset = 0
 169     for env in envs:
 170         counts = db.get_counts(env)
 171         stats = dict(zip(os_family.keys(), [0] * len(os_family)))
 172         for os in counts:
 173             stats[os_family_rev[os]] += counts[os]
 174         total_count = np.sum(stats.values())
 175         for osf in stats:
 176             stats[osf] = float(stats[osf]) / total_count
 177         env_stats[env] = stats
 178     # make stacked barplot
 179     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 180     x = np.arange(len(envs))
 181     bottoms = np.zeros(len(envs))
 182     for i, os in enumerate(os_order):
 183         stat = [env_stats[e][os] for e in envs]
 184         pl.bar(x, stat, bottom=bottoms, color=os_colors[i],
 185                label=db.get_nice_name(os), width=0.8)
 186         bottoms += stat
 187     pl.legend(loc='lower right')
 188     pl.xticks(x + 0.4,  [db.get_nice_name(e) for e in env_names])
 189     pl.xlim(-0.25, len(envs))
 190     pl.title("Operating system preference by environment")
 191     pl.ylabel("Fraction of submissions")
 192     pl.savefig('%s/ospref_by_env.png' % destdir, format='png', dpi=80)
 193
 194 def mkpic_submissions_per_datamod(db, destdir):
 195     # simple demo
 196     spd = db.get_counts('bg_datamod')
 197     spd = sorted(spd.items(), cmp=lambda x, y: cmp(x[1], y[1]))[::-1]
 198     x = np.arange(len(spd))
 199     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 200     pl.title('Submissions per data modality')
 201     pl.bar(x, [s[1] for s in spd])
 202     pl.xticks(x + 0.5,  [db.datamod_dict[k[0]] for k in spd], rotation=-10)
 203     pl.ylabel('Survey submissions per data modality\n(multiple choices per submission possible)')
 204     pl.savefig('%s/submissions_per_datamod.png' % destdir, format='png', dpi=80)
 205
 206 def mkpic_resources(db, destdir):
 207     res = db.get_counts('software_resource')
 208     res = res.items()
 209     x = np.arange(len(res))
 210     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 211     pl.title('Software resources')
 212     pl.bar(x + (1./8), [s[1] for s in res], width=0.75, color = '#008200')
 213     pl.xticks(x + 0.5,  ['' for s in res])
 214     for i, s in enumerate(res):
 215         pl.text(i+.5, 0.1, db.get_nice_name(s[0]), rotation=90,
 216                 horizontalalignment='center',
 217                 verticalalignment='bottom',
 218                 bbox=dict(facecolor='white', alpha=0.8, edgecolor='white',
 219                           color='white'))
 220     pl.ylabel('Number of submissions')
 221     pl.savefig('%s/software_resources.png' % destdir, format='png', dpi=80)
 222
 223 def mkpic_software(db, destdir):
 224     for typ in sw_categories.keys():
 225         counts = db.get_counts('sw_%s' % typ)
 226         pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 227         pl.title("Software popularity: %s" % db.get_nice_name(typ))
 228         if not len(counts):
 229             pl.text(.5, .5, "[Insufficient data for this figure]",
 230                     horizontalalignment='center')
 231             pl.axis('off')
 232         else:
 233             # sort by name
 234             stats = sorted(counts.items(), cmp=lambda x, y: cmp(x[0], y[0]))
 235             x = np.arange(len(stats))
 236             pl.bar(x + (1./8), [s[1] for s in stats], width=0.75, color = '#008200')
 237             pl.xticks(x + 0.5,  ['' for s in stats])
 238             for i, s in enumerate(stats):
 239                 pl.text(i+.5, 0.1, db.get_nice_name(s[0]), rotation=90,
 240                         horizontalalignment='center',
 241                         verticalalignment='bottom',
 242                         bbox=dict(facecolor='white', alpha=0.8, edgecolor='white',
 243                                   color='white'))
 244             pl.xlim(0, len(stats))
 245             pl.ylabel("Number of submissions")
 246         pl.savefig('%s/sw_%s.png' % (destdir, typ), format='png', dpi=80)
 247
 248 def mkpic_rating_by_os(db, env, items, destdir, title):
 249     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 250     for i, os in enumerate(os_order):
 251         ratings = [db.select_match(env,
 252                         os_family[os]).get_not_none('%s' % (it,))[0]
 253                             for it in items]
 254         plot_bars(ratings, offset=((i+1)*0.2)-0.1, color=os_colors[i],
 255                   title=title, ylabel="Mean rating", label=db.get_nice_name(os))
 256     pl.ylim((0,3))
 257     pl.xlim((0,len(items)))
 258     pl.yticks((0, 3), ['Disagree', 'Agree'], rotation=90)
 259     pl.xticks(np.arange(len(items))+0.5, [i[-2:] for i in items],
 260               horizontalalignment='center')
 261     pl.legend(loc='lower right')
 262     pl.savefig('%s/ratings_%s.png' % (destdir, env), format='png', dpi=80)
 263
 264
 265 def main(srcdir, destdir):
 266     db = DB(srcdir)
 267     for pic in [mkpic_submissions_per_datamod, mkpic_os_per_env, mkpic_software,
 268                 mkpic_resources]:
 269         pic(db, destdir)
 270     mkpic_rating_by_os(db, 'pers_os', ['pers_r%i' % i for i in range(1, 9)], destdir,
 271                        "Ratings: Personal environment")
 272     mkpic_rating_by_os(db, 'man_os', ['man_r%i' % i for i in range(1, 5)], destdir,
 273                        "Ratings: Managed environment")
 274     mkpic_rating_by_os(db, 'virt_host_os', ['virt_r%i' % i for i in range(1, 4)], destdir,
 275                        "Ratings: Virtual environment (by host OS)")
 276     # submission stats: this is RST
 277     statsfile = open('%s/stats.txt' % destdir, 'w')
 278     statsfile.write('::\n\n  Number of submissions: %i\n' % len(db))
 279     statsfile.write('  Statistics last updated: %s\n\n' \
 280             % time.strftime('%A, %B %d %Y, %H:%M:%S UTC', time.gmtime()))
 281     statsfile.close()
 282
 283 if __name__ == '__main__':
 284     main(sys.argv[1], sys.argv[2])