survey/makestats

   1 #!/usr/bin/python
   2
   3 from glob import glob
   4 import json
   5 import sys
   6 import pylab as pl
   7 import numpy as np
   8 from mvpa.misc.plot.base import plot_bars
   9
  10 # uniform colors for OS results
  11 os_colors = ['#B63537', '#4E4DA0', '#008200', 'gray']
  12 os_order = ['linux', 'mac', 'win', 'otheros']
  13 # resources
  14 resource_categories = {
  15     'vendor': 'Vendor/Project website',
  16     'retailer': 'Retailer',
  17     'os': 'Operating system',
  18     'cpan': 'CPAN',
  19     'cran': 'CRAN',
  20     'epel': 'EPEL',
  21     'fink': 'Fink',
  22     'freebsdports': 'FreeBSD ports',
  23     'incf': 'INCF',
  24     'macports': 'Macports',
  25     'matlabcentral': 'Matlab Central',
  26     'neurodebian': 'NeuroDebian',
  27     'nitrc': 'NITRC',
  28     'pypi': 'PyPi',
  29     'pythonbundles': 'Python bundles',
  30     'sourceforge': 'Sourceforge',
  31     'other': 'Other resource'
  32     }
  33 # software categories
  34 sw_categories = {
  35         'general': 'General computing',
  36         'dc': 'Distributed computing',
  37         'img': 'Brain imaging',
  38         'datamanage': 'Data management',
  39         'neusys': 'Neural systems modeling',
  40         'electro': 'Electrophysiology, MEG/EEG',
  41         'bci': 'Brain-computer interface',
  42         'acq': 'Hardware interface/Data acquisition',
  43         'rt': 'Real-time solutions',
  44         'psychophys': 'Psychophysics/Experiment control'
  45         }
  46
  47 # some meaningful groups of OSes
  48 redhat_family = ["rhel", "centos", "fedora", "scilinux"]
  49 debian_family = ["debian", "ubuntu", "biolinux"]
  50 suse_family = ["suse", "slel"]
  51 other_linux_family = ["gentoo", "mandriva", "arch", "slackware", "otherlinux"]
  52 other_family = ["starbsd", "unix", "qnx", "beos", "solaris", "other"]
  53
  54 os_cat_names = {
  55         'win': 'Windows',
  56         'mac': 'Mac OS',
  57         'linux': 'GNU/Linux',
  58         'otheros': 'Other OS'
  59         }
  60
  61 os_family = {
  62         'win': ["windows"],
  63         'mac': ["macosx"],
  64         'linux': redhat_family + debian_family + suse_family + other_linux_family,
  65         'otheros': other_family
  66         }
  67 # end the reverse mapping
  68 os_family_rev = {}
  69 for ost in os_family:
  70     for os in os_family[ost]:
  71         os_family_rev[os] = ost
  72
  73
  74 def load_list2dict(name):
  75     d = {}
  76     lfile = open(name)
  77     for line in lfile:
  78         kv = line.split(':')
  79         d[kv[0]] = kv[1].strip().strip('"')
  80     return d
  81
  82
  83
  84 class DB(dict):
  85     os_dict = load_list2dict('oslist.txt')
  86     datamod_dict = load_list2dict('datamodlist.txt')
  87     sw_dict = load_list2dict('swlist.txt')
  88
  89     def __init__(self, srcdir):
  90         # eats the whole directory
  91         if srcdir is None:
  92             return
  93         datafilenames = glob('%s/*.json' % srcdir)
  94         for dfn in datafilenames:
  95             rawdata = json.load(open(dfn))
  96             self[rawdata['timestamp']] = rawdata
  97
  98     def get_unique(self, key):
  99         # return a set of all (unique) values for a field id
 100         uniq = set()
 101         for d in self.values():
 102             if key in d:
 103                 el = d[key]
 104                 if isinstance(el, list):
 105                     uniq = uniq.union(el)
 106                 else:
 107                     uniq = uniq.union((el,))
 108         return uniq
 109
 110     def get_not_none(self, key):
 111         # return a list of all values of a specific field id
 112         # the second return value is count of submission that did not have data
 113         # for this field id
 114         val = []
 115         missing = 0
 116         for d in self.values():
 117             if key in d:
 118                 el = d[key]
 119                 if isinstance(el, list):
 120                     val.extend(el)
 121                 else:
 122                     if el == 'none':
 123                         missing += 1
 124                     else:
 125                         val.append(el)
 126             else:
 127                 missing += 1
 128         return val, missing
 129
 130     def get_counts(self, key):
 131         # return a dict with field values as keys and respective submission
 132         # count as value
 133         vals = self.get_not_none(key)[0]
 134         uniq = np.unique(vals)
 135         counts = dict(zip(uniq, [vals.count(u) for u in uniq]))
 136         return counts
 137
 138     def select_match(self, key, values):
 139         # return a db with all submissions were a field id has one of the
 140         # supplied values
 141         match = DB(None)
 142         for k, v in self.items():
 143             if not key in v:
 144                 continue
 145             el = v[key]
 146             if isinstance(el, list):
 147                 if len(set(values).intersection(el)):
 148                     match[k] = v
 149             elif el in values:
 150                 match[k] = v
 151         return match
 152
 153     def get_nice_name(self, id):
 154         srcs = [DB.os_dict, os_cat_names, DB.sw_dict, sw_categories,
 155                 resource_categories]
 156         for src in srcs:
 157             if id in src:
 158                 return src[id]
 159         # not found, nothing nicer
 160         return id
 161
 162
 163 def mkpic_os_per_env(db, destdir):
 164     envs = ['pers_os', 'man_os', 'virt_host_os', 'virt_guest_os']
 165     env_names = ['Personal', 'Managed', 'Virt. Host', 'Virt. Guest']
 166     env_stats = {}
 167     offset = 0
 168     for env in envs:
 169         counts = db.get_counts(env)
 170         stats = dict(zip(os_family.keys(), [0] * len(os_family)))
 171         for os in counts:
 172             stats[os_family_rev[os]] += counts[os]
 173         total_count = np.sum(stats.values())
 174         for osf in stats:
 175             stats[osf] = float(stats[osf]) / total_count
 176         env_stats[env] = stats
 177     # make stacked barplot
 178     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 179     x = np.arange(len(envs))
 180     bottoms = np.zeros(len(envs))
 181     for i, os in enumerate(os_order):
 182         stat = [env_stats[e][os] for e in envs]
 183         pl.bar(x, stat, bottom=bottoms, color=os_colors[i],
 184                label=db.get_nice_name(os), width=0.8)
 185         bottoms += stat
 186     pl.legend(loc='lower right')
 187     pl.xticks(x + 0.4,  [db.get_nice_name(e) for e in env_names])
 188     pl.xlim(-0.25, len(envs))
 189     pl.title("Operating system preference by environment")
 190     pl.ylabel("Fraction of submissions")
 191     pl.savefig('%s/ospref_by_env.png' % destdir, format='png', dpi=80)
 192
 193 def mkpic_submissions_per_datamod(db, destdir):
 194     # simple demo
 195     spd = db.get_counts('bg_datamod')
 196     spd = sorted(spd.items(), cmp=lambda x, y: cmp(x[1], y[1]))[::-1]
 197     x = np.arange(len(spd))
 198     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 199     pl.title('Submissions per data modality')
 200     pl.bar(x, [s[1] for s in spd])
 201     pl.xticks(x + 0.5,  [db.datamod_dict[k[0]] for k in spd], rotation=-10)
 202     pl.ylabel('Survey submissions per data modality\n(multiple choices per submission possible)')
 203     pl.savefig('%s/submissions_per_datamod.png' % destdir, format='png', dpi=80)
 204
 205 def mkpic_resources(db, destdir):
 206     res = db.get_counts('software_resource')
 207     res = res.items()
 208     x = np.arange(len(res))
 209     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 210     pl.title('Software resources')
 211     pl.bar(x + (1./8), [s[1] for s in res], width=0.75, color = '#008200')
 212     pl.xticks(x + 0.5,  ['' for s in res])
 213     for i, s in enumerate(res):
 214         pl.text(i+.5, 0.1, db.get_nice_name(s[0]), rotation=90,
 215                 horizontalalignment='center',
 216                 verticalalignment='bottom',
 217                 bbox=dict(facecolor='white', alpha=0.8, edgecolor='white',
 218                           color='white'))
 219     pl.ylabel('Number of submissions')
 220     pl.savefig('%s/software_resources' % destdir, format='png', dpi=80)
 221
 222 def mkpic_software(db, destdir):
 223     for typ in sw_categories.keys():
 224         counts = db.get_counts('sw_%s' % typ)
 225         pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 226         pl.title("Software popularity: %s" % db.get_nice_name(typ))
 227         if not len(counts):
 228             pl.text(.5, .5, "[Insufficient data for this figure]",
 229                     horizontalalignment='center')
 230             pl.axis('off')
 231         else:
 232             # sort by name
 233             stats = sorted(counts.items(), cmp=lambda x, y: cmp(x[0], y[0]))
 234             x = np.arange(len(stats))
 235             pl.bar(x + (1./8), [s[1] for s in stats], width=0.75, color = '#008200')
 236             pl.xticks(x + 0.5,  ['' for s in stats])
 237             for i, s in enumerate(stats):
 238                 pl.text(i+.5, 0.1, db.get_nice_name(s[0]), rotation=90,
 239                         horizontalalignment='center',
 240                         verticalalignment='bottom',
 241                         bbox=dict(facecolor='white', alpha=0.8, edgecolor='white',
 242                                   color='white'))
 243             pl.xlim(0, len(stats))
 244             pl.ylabel("Number of submissions")
 245         pl.savefig('%s/sw_%s.png' % (destdir, typ), format='png', dpi=80)
 246
 247 def mkpic_rating_by_os(db, env, items, destdir, title):
 248     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 249     for i, os in enumerate(os_order):
 250         ratings = [db.select_match(env,
 251                         os_family[os]).get_not_none('%s' % (it,))[0]
 252                             for it in items]
 253         plot_bars(ratings, offset=((i+1)*0.2)-0.1, color=os_colors[i],
 254                   title=title, ylabel="Mean rating", label=db.get_nice_name(os))
 255     pl.ylim((0,3))
 256     pl.xlim((0,len(items)))
 257     pl.yticks((0, 3), ['Disagree', 'Agree'], rotation=90)
 258     pl.xticks(np.arange(len(items))+0.5, [i[-2:] for i in items],
 259               horizontalalignment='center')
 260     pl.legend(loc='lower right')
 261     pl.savefig('%s/ratings_%s.png' % (destdir, env), format='png', dpi=80)
 262
 263
 264 def main(srcdir, destdir):
 265     db = DB(srcdir)
 266     for pic in [mkpic_submissions_per_datamod, mkpic_os_per_env, mkpic_software,
 267                 mkpic_resources]:
 268         pic(db, destdir)
 269     mkpic_rating_by_os(db, 'pers_os', ['pers_r%i' % i for i in range(1, 9)], destdir,
 270                        "Ratings: Personal environment")
 271     mkpic_rating_by_os(db, 'man_os', ['man_r%i' % i for i in range(1, 5)], destdir,
 272                        "Ratings: Managed environment")
 273     mkpic_rating_by_os(db, 'virt_host_os', ['virt_r%i' % i for i in range(1, 4)], destdir,
 274                        "Ratings: Virtual environment (by host OS)")
 275
 276 if __name__ == '__main__':
 277     main(sys.argv[1], sys.argv[2])