survey/makestats

   1 #!/usr/bin/python
   2
   3 from glob import glob
   4 import json
   5 import sys
   6 import pylab as pl
   7 import numpy as np
   8
   9 # resources
  10 resource_categories = {
  11     'vendor': 'Vendor/Project website',
  12     'retailer': 'Retailer',
  13     'os': 'Operating system',
  14     'cpan': 'CPAN',
  15     'cran': 'CRAN',
  16     'epel': 'EPEL',
  17     'fink': 'Fink',
  18     'freebsdports': 'FreeBSD ports',
  19     'incf': 'INCF',
  20     'macports': 'Macports',
  21     'matlabcentral': 'Matlab Central',
  22     'neurodebian': 'NeuroDebian',
  23     'nitrc': 'NITRC',
  24     'pypi': 'PyPi',
  25     'pythonbundles': 'Python bundles',
  26     'sourceforge': 'Sourceforge',
  27     'other': 'Other resource'
  28     }
  29 # software categories
  30 sw_categories = {
  31         'general': 'General computing',
  32         'dc': 'Distributed computing',
  33         'img': 'Brain imaging',
  34         'datamanage': 'Data management',
  35         'neusys': 'Neural systems modeling',
  36         'electro': 'Electrophysiology, MEG/EEG',
  37         'bci': 'Brain-computer interface',
  38         'acq': 'Hardware interface/Data acquisition',
  39         'rt': 'Real-time solutions',
  40         'psychphys': 'Psychophysics/Experiment control'
  41         }
  42
  43 # some meaningful groups of OSes
  44 redhat_family = ["rhel", "centos", "fedora", "scilinux"]
  45 debian_family = ["debian", "ubuntu", "biolinux"]
  46 suse_family = ["suse", "slel"]
  47 other_linux_family = ["gentoo", "mandriva", "arch", "slackware", "otherlinux"]
  48 other_family = ["starbsd", "unix", "qnx", "beos", "solaris", "other"]
  49
  50 os_cat_names = {
  51         'win': 'Windows',
  52         'mac': 'Mac OS',
  53         'linux': 'GNU/Linux',
  54         'otheros': 'Other OS'
  55         }
  56
  57 os_family = {
  58         'win': ["windows"],
  59         'mac': ["macosx"],
  60         'linux': redhat_family + debian_family + suse_family + other_linux_family,
  61         'otheros': other_family
  62         }
  63 # end the reverse mapping
  64 os_family_rev = {}
  65 for ost in os_family:
  66     for os in os_family[ost]:
  67         os_family_rev[os] = ost
  68
  69
  70 class DB(dict):
  71     def __init__(self, srcdir):
  72         # eats the whole directory
  73         datafilenames = glob('%s/*.json' % srcdir)
  74         for dfn in datafilenames:
  75             rawdata = json.load(open(dfn))
  76             self[rawdata['timestamp']] = rawdata
  77
  78         self.os_dict = load_list2dict('oslist.txt')
  79         self.datamod_dict = load_list2dict('datamodlist.txt')
  80         self.sw_dict = load_list2dict('swlist.txt')
  81
  82
  83     def get_unique(self, key):
  84         # return a set of all (unique) values for a field id
  85         uniq = set()
  86         for d in self.values():
  87             if key in d:
  88                 el = d[key]
  89                 if isinstance(el, list):
  90                     uniq = uniq.union(el)
  91                 else:
  92                     uniq = uniq.union((el,))
  93         return uniq
  94
  95     def get_not_none(self, key):
  96         # return a list of all values of a specific field id
  97         # the second return value is count of submission that did not have data
  98         # for this field id
  99         val = []
 100         missing = 0
 101         for d in self.values():
 102             if key in d:
 103                 el = d[key]
 104                 if isinstance(el, list):
 105                     val.extend(el)
 106                 else:
 107                     if el == 'none':
 108                         missing += 1
 109                     else:
 110                         val.append(el)
 111             else:
 112                 missing += 1
 113         return val, missing
 114
 115     def get_counts(self, key):
 116         # return a dict with field values as keys and respective submission
 117         # count as value
 118         vals = self.get_not_none(key)[0]
 119         uniq = np.unique(vals)
 120         counts = dict(zip(uniq, [vals.count(u) for u in uniq]))
 121         return counts
 122
 123     def select_match(self, key, values):
 124         # return a db with all submissions were a field id has one of the
 125         # supplied values
 126         match = {}
 127         for k, v in self.items():
 128             if not key in v:
 129                 continue
 130             el = v[key]
 131             if isinstance(el, list):
 132                 if len(set(values).intersection(el)):
 133                     match[k] = v
 134             elif el in values:
 135                 match[k] = v
 136         return match
 137
 138     def get_nice_name(self, id):
 139         srcs = [self.os_dict, os_cat_names, self.sw_dict, sw_categories,
 140                 resource_categories]
 141         for src in srcs:
 142             if id in src:
 143                 return src[id]
 144         # not found, nothing nicer
 145         return id
 146
 147
 148 def load_list2dict(name):
 149     d = {}
 150     lfile = open(name)
 151     for line in lfile:
 152         kv = line.split(':')
 153         d[kv[0]] = kv[1].strip().strip('"')
 154     return d
 155
 156 def mkpic_os_per_env(db, destdir):
 157     envs = ['pers_os', 'man_os', 'virt_host_os', 'virt_guest_os']
 158     env_names = ['Personal', 'Managed', 'Virt. Host', 'Virt. Guest']
 159     env_stats = {}
 160     offset = 0
 161     for env in envs:
 162         counts = db.get_counts(env)
 163         stats = dict(zip(os_family.keys(), [0] * len(os_family)))
 164         for os in counts:
 165             stats[os_family_rev[os]] += counts[os]
 166         total_count = np.sum(stats.values())
 167         for osf in stats:
 168             stats[osf] = float(stats[osf]) / total_count
 169         env_stats[env] = stats
 170     # make stacked barplot
 171     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 172     x = np.arange(len(envs))
 173     bottoms = np.zeros(len(envs))
 174     os_order = ['linux', 'mac', 'win', 'otheros']
 175     colors = ['#B63537', '#4E4DA0', '#008200', 'gray']
 176     for i, os in enumerate(os_order):
 177         stat = [env_stats[e][os] for e in envs]
 178         pl.bar(x, stat, bottom=bottoms, color=colors[i],
 179                label=db.get_nice_name(os), width=0.8)
 180         bottoms += stat
 181     pl.legend(loc='lower right')
 182     pl.xticks(x + 0.4,  [db.get_nice_name(e) for e in env_names])
 183     pl.xlim(-0.25, len(envs))
 184     pl.title("Operating system preference by environment")
 185     pl.ylabel("Fraction of submissions")
 186     pl.savefig('%s/ospref_by_env.png' % destdir, format='png')
 187
 188 def mkpic_submissions_per_datamod(db, destdir):
 189     # simple demo
 190     spd = db.get_counts('bg_datamod')
 191     spd = sorted(spd.items(), cmp=lambda x, y: cmp(x[1], y[1]))[::-1]
 192     x = np.arange(len(spd))
 193     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 194     pl.title('Submissions per data modality')
 195     pl.bar(x, [s[1] for s in spd])
 196     pl.xticks(x + 0.5,  [db.datamod_dict[k[0]] for k in spd], rotation=-10)
 197     pl.ylabel('Survey submissions per data modality\n(multiple choices per submission possible)')
 198     pl.savefig('%s/submissions_per_datamod.png' % destdir, format='png')
 199
 200 def mkpic_resources(db, destdir):
 201     res = db.get_counts('software_resource')
 202     res = res.items()
 203     x = np.arange(len(res))
 204     pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 205     pl.title('Software resources')
 206     pl.bar(x + (1./8), [s[1] for s in res], width=0.75, color = '#008200')
 207     pl.xticks(x + 0.5,  ['' for s in res])
 208     for i, s in enumerate(res):
 209         pl.text(i+.5, 0.1, db.get_nice_name(s[0]), rotation=90,
 210                 horizontalalignment='center',
 211                 verticalalignment='bottom',
 212                 bbox=dict(facecolor='white', alpha=0.8, edgecolor='white',
 213                           color='white'))
 214     pl.ylabel('Number of submissions')
 215     pl.savefig('%s/software_resources' % destdir, format='png')
 216
 217 def mkpic_software(db, destdir):
 218     for typ in sw_categories.keys():
 219         counts = db.get_counts('sw_%s' % typ)
 220         pl.figure(figsize=(6.4, 4.8), facecolor='w', edgecolor='k')
 221         if not len(counts):
 222             pl.text(.5, .5, "Insufficient data for this figure.",
 223                     horizontalalignment='center')
 224             pl.axis('off')
 225         else:
 226             # sort by name
 227             stats = sorted(counts.items(), cmp=lambda x, y: cmp(x[0], y[0]))
 228             x = np.arange(len(stats))
 229             pl.bar(x + (1./8), [s[1] for s in stats], width=0.75, color = '#008200')
 230             pl.title("Software popularity: %s" % db.get_nice_name(typ))
 231             pl.xticks(x + 0.5,  ['' for s in stats])
 232             for i, s in enumerate(stats):
 233                 pl.text(i+.5, 0.1, db.get_nice_name(s[0]), rotation=90,
 234                         horizontalalignment='center',
 235                         verticalalignment='bottom',
 236                         bbox=dict(facecolor='white', alpha=0.8, edgecolor='white',
 237                                   color='white'))
 238             pl.xlim(0, len(stats))
 239             pl.ylabel("Number of submissions")
 240         pl.savefig('%s/sw_%s.png' % (destdir, typ), format='png')
 241
 242
 243 def main(srcdir, destdir):
 244     db = DB(srcdir)
 245     for pic in [mkpic_submissions_per_datamod, mkpic_os_per_env, mkpic_software,
 246                 mkpic_resources]:
 247         pic(db, destdir)
 248
 249 if __name__ == '__main__':
 250     main(sys.argv[1], sys.argv[2])