sphinx/vm.rst

   1 Standart Debian install
   2
   3 hostname: neurodebian
   4 domain: ''
   5
   6 all file in one partition
   7
   8 root: not there
   9 user: brain
  10 pwd: neurodebian
  11
  12
  13 Do a minimal install
  14 --------------------
  15
  16 make separte vdi images for
  17
  18 * /
  19 * /tmp
  20 * /var/cache/apt
  21 * swap
  22
  23 just base system, run selection, but no tasks
  24
  25
  26 install new stuff
  27 -----------------
  28
  29 Add sources.list for backports and neurodebian
  30
  31 wget -O - http://backports.org/debian/archive.key | apt-key add -
  32 wget -O - http://neuro.debian.net.asc | apt-key add -
  33
  34 install kernel 2.6.27 (or later) from backports to have support for OpenGL
  35 direct rendering in VirtualBox
  36
  37 # a basic desktop
  38 aptitude install \
  39  alacarte desktop-base evince file-roller gcalctool gdm gksu gnome-core
  40  gnome-keyring gnome-utils gnome-volume-manager gnome-mount gthumb
  41  bash-completion less mc gnome-themes
  42
  43 # cleanup unwanted stuff
  44 # video drivers (all but vesa)
  45 aptitude purge $(apt-cache search --names-only --installed xserver-xorg-video | grep xserver-xorg-video | cut -d ' ' -f 1,1) xserver-xorg-video-vesa+
  46 # random stuff
  47 aptitude purge radeontool sound-juicer
  48
  49 # prepare for kernel module building (guest additions)
  50 aptitude install module-assistant
  51 module-assistant prepare
  52 bash /media/cdrom/VBoxLinuxAdditions-amd64.run (need 2.6.27+ kernel for direct rendering)
  53
  54 #make sure that xorg.conf has 'vboxvideo' as device driver and also
  55 echo "vboxvideo" >> /etc/modules
  56
  57 # make user brain allowed to execute sudo without a password
  58 adduser brain sudo
  59 visudo
  60 # and uncomment the respective line at the end of the file
  61 # (make sure there is nothing below it
  62
  63 # configure shared folders
  64 mkdir /mnt/host
  65 mount -t vboxsf host /mnt/host
  66 # better put the following into the session startup config of the user
  67 sudo mount -t vboxsf -o defaults,uid=brain,gid=brain host /mnt/host
  68
  69
  70 # neuro-stuff
  71 aptitude install afni afni-atlases amide caret dicomnifti fsl fsl-atlases lipsia
  72  minc-tools odin psychopy python-mvpa python-pyepl
  73
  74 # general scientifically useful stuff
  75 aptitude install ipython
  76
  77 mkdir -p .config/backgrounds
  78 cp /mnt/host/.config/awesome/hotbrain.png .config/backgrounds/
  79
  80 #change menu icon
  81 sudo cp /mnt/host/hacking/neurodebian/artwork/icon.svg /usr/share/icons/Mist/scalable/places/start-here.svg