]> git.donarmstrong.com Git - neurodebian.git/blob - sphinx/testimonials.rst
Quotes from Alexander and Joseph, Thanks!
[neurodebian.git] / sphinx / testimonials.rst
1 .. _testimonials:
2
3 Testimonials
4 ============
5
6 .. None so far replied
7 ..
8 .. Organizations
9 .. -------------
10 ..
11 .. .. quotes::
12 ..    :group: Organizations
13
14
15 By Topic
16 --------
17
18 * :ref:`testimonials_open_science`
19 * :ref:`testimonials_standardization`
20 * :ref:`testimonials_vm`
21
22
23 Research Institutions
24 ---------------------
25
26 .. quotes::
27    :group: Research institutions
28
29 ..   not implemented for now
30 ..   :sections: group
31
32 .. quote::
33     :author: Christian Haselgrove
34     :affiliation: Vice President for Neuroinformatics at
35                                   Neuromorphometrics, Inc; University of Massachusetts Medical School
36     :date: 2013-02-06
37     :tags: email, derivatives, management
38
39     Developing informatics infrastructure often involves building
40     complex systems that require interaction between existing
41     components such as software and atlases.  NeuroDebian makes it
42     trivial to manage the components of these systems, freeing me to
43     focus on the novel and important aspects of my work.
44
45
46 Research Software Projects
47 --------------------------
48
49 .. quotes::
50    :group: Research software projects
51
52
53 .. quote::
54    :author: Stephan Gerhard, et al.
55    :date: 2011-06-06
56    :tags:  practices, quality
57    :source: The Connectome Viewer Toolkit, Front. Neuroinform. 5:3. doi: 10.3389/fninf.2011.00003
58
59    For proper software packaging and distribution, the NeuroDebian project provides professional expertise and infrastructure.
60
61 .. quote::
62    :author: Chuck Theobald
63    :affiliation: Lewis Center for Neuroimaging, University of Oregon, MRIConvert/mcverter build master and developer
64    :tags: email, impact, software distribution, upstream, dissemination
65    :date: 2013-02-06
66
67    As a system administrator, I support the efforts of a number of
68    researchers who use fMRI analysis software. I was overjoyed to find
69    the NeuroDebian repository, a one-stop shop for nearly every
70    software package the researchers use. The work of the NeuroDebian
71    Team greatly simplifies the task of providing our researchers the
72    best software available, and I consider the repository a vital part
73    of my professional life.  As a maintainer on the MRIConvert
74    project, I find that NeuroDebian provides a valuable venue for
75    dissemination of our software. It would not be possible to reach
76    the same wide audience without the NeuroDebian repository.
77
78 .. quote::
79     :author: Dr. Kiyotaka Nemoto
80     :affiliation: University of Tsukuba
81     :tags: email, derivatives, time
82     :date: 2013-02-06
83
84     Neurodebian is the best solution for researchers in neuroscience.
85     Everybody should have experienced wasting so much time in just setting
86     up software. With Neurodebian repository, you can easily setup many
87     useful software packages and focus on your research. I recommend this
88     repository to everyone who is interested in using Linux in
89     neuroscience.
90
91 .. quote::
92     :author: Dr. Andrew Janke
93     :affiliation: Center for Advanced Imaging, University of Queensland, Australia
94     :date: 2013-02-06
95     :tags: email, upstream, stability, versioning, provenance, vm,
96                    reproducibility, collaboration
97
98     We use NeuroDebian on a daily basis as it provides a stable and
99     versioned software base for analysis. This is critical as it allows us
100     to maintain data provenance, something that is often sorely lacking.
101     Our collaborators who don't quite have their heads around Linux yet
102     are pointed to the NeuroDebian Virtual Machine, it allows them to run
103     an identical analysis environment to us regardless of where they are
104     or operating system.
105
106 .. quote::
107    :author: Nina Preuss
108    :affiliation: PMP, nitrc.org
109    :date: 2013-02-06
110    :tags: disqus, money, quality, contributions, cloud, derivatives
111
112     NITRC-CE, or the NITRC Computational Environment, on the Amazon
113     Marketplace wouldn't have happened as quickly and thus cost effectively
114     without leveraging NeuroDebian's good works. We appreciate their
115     critical contribution to the neuroimaging compute community.
116
117 .. quote::
118    :author: Sebastiaan Mathôt
119    :affiliation: Aix-Marseille université, Laboratoire de Psychologie Cognitive
120    :date: 2013-02-06
121    :tags: email, impact
122
123    For any neuroscientist that relies on open-source software,
124    NeuroDebian is the single most important resource.
125
126 .. quote::
127    :author: Sebastian Eichelbaum
128    :affiliation: OpenWalnut project, Image and Signal Processing Group, Institute of Computer Science, University of Leipzig, Germany
129    :date: 2013-02-11
130    :tags: email, breadth, dissemination
131
132    With NeuroDebian we can utilize thousands of tools, providing the foundation for our research. On the other hand, we can provide our tools to a large community easily.
133
134
135 .. quote::
136    :author: Francisco Pereira
137    :affiliation: Siemens Corporate Research
138    :date: 2013-02-06
139    :tags: gplus, time
140
141    Thanks to NeuroDebian I now have to spend my time thinking hard about what to do with the tools, rather than leisurely installing them and tracking dependencies.
142
143 .. quote::
144    :author: Alexander Wiebel
145    :affiliation: OpenWalnut project, Zuse Institute Berlin (ZIB), Germany
146    :date: 2013-02-19
147    :tags: email, breadth, dissemination
148
149    It is great to have NeuroDebian as a platform to bring our
150    visualization system OpenWalnut to a broad audience together with the large variety of
151    related data analysis tools available in NeuroDebian.
152
153
154
155 Individual Laboratories and Researchers
156 ---------------------------------------
157
158 .. quotes::
159    :group: Individual laboratories and researchers
160
161
162 .. quote::
163    :author: Prof. Petr Hlustik
164    :affiliation: Departments of Neurology and Radiology, Palacky University School of Medicine and University Hospital, Olomouc, Czech Republic
165    :date: 2010-10-11
166    :tags: breadth
167
168    [...] those wonderful tools in Debian Neuro [...] make my life as a
169    researcher who also maintains a bunch of Debian boxes so much easier.
170
171 .. quote::
172    :author: Dr. Jo Etzel
173    :affiliation: Department of Psychology, Washington University
174    :date: 2012-03-15
175    :tags: vm
176
177    I am a dedicated R user ... and have a Windows box. But this
178    afternoon I (finally) downloaded and installed NeuroDebian and the
179    VirtualBox, ran AFNI, and generated the files I needed, all within
180    about an hour and a half. [...] not bad, considering that I know
181    essentially no Linux/Unix. So here's a big "thanks!" :)
182
183 .. quote::
184   :author: Vincent Kersten
185   :affiliation: University Medical Center Utrecht
186   :tags: email, standardization, money, Debian
187   :date: 2013-02-06
188
189   Neurodebian provides us with a consitent way of sotware packaging
190   and upgrades, eliminating tedious compiles and home-brew setups,
191   while seamlessly integrating with the Debian distribution. Excellent
192   and very valuable work, saving costs and difficult to spot
193   errors. High five Michael, Yaroslav and team! Keep them packages
194   coming!
195
196 .. quote::
197    :author: Christian Stephan-Otto
198    :affiliation: Neuroimaging Research Group, Parc Sanitari Sant Joan de Deu, Barcelona, Spain
199    :date: 2013-02-06
200    :tags: email, vm, breadth
201
202    Since I started using a NeuroDebian virtual machine on win64 months
203    ago I am relying more and more on its diverse tools, from
204    population-specific template creation to pipelining the analysis of
205    fMRI, DTI and morphology studies. There is a great chance I will
206    end up working exclusively with NeuroDebian!
207
208 .. quote::
209    :author: Mathias Goldau
210    :affiliation: Cortical Networks, Max-Planck-Institute for neurological research, Cologne, Germany
211    :date: 2013-02-07
212    :tags: email, time, breadth
213
214    Without NeuroDebian we would have wasted precious time for
215    deploying software, and we wouldn't have tested so many software
216    tools.
217
218 .. quote::
219    :author: Joseph Viviano
220    :affiliation: York University, Toronto Canada
221    :date: 2013-02-19
222    :tags: email, reproducibility, versioning, impact
223
224    NeuroDebian not only helped our lab focus on research and producing
225    results with FOSS, it has also made it much easier to maintain
226    version control, facilitating data portability and
227    reproducibility. I see this as the most important current project
228    working towards transparent neuroscientific methods with clear and
229    reproducible results.