]> git.donarmstrong.com Git - neurodebian.git/blob - sphinx/booth_sfn2010.rst
1cdf0deae00ebae0c723839992909338a68b221c
[neurodebian.git] / sphinx / booth_sfn2010.rst
1 .. _chap_debian_booth_sfn2010:
2
3 Debian booth at SfN2010 in San Diego
4 ====================================
5
6 .. image:: pics/sfn2010/SanDiegoConferenceCenter.jpg
7    :width: 100%
8
9 During November 13-17, 2010 the NeuroDebian team ran its first Debian booth at the
10 annual meeting of the `Society for Neuroscience`_ (SfN2010_) in San
11 Diego, USA. We presented the upcoming release Debian 6.0 Squeeze and
12 demonstrated its utility as a robust and versatile research environment for
13 neuroscience. Booth visitors had the opportunity to meet with developers
14 of neuroscience research software, and to get information on available software
15 and recommendations for deployment strategies in research laboratories.
16
17 .. image:: pics/sfn2010/PosterSession.jpg
18
19 The `annual meeting`_ of the Society for Neuroscience is one of the largest
20 neuroscience conferences in the world, with over 30,000 attendees. Researchers,
21 clinicians, and leading experts discuss the latest findings about the brain,
22 nervous system, and related disorders.
23
24
25 Booth setup
26 -----------
27
28 `Don Armstrong`_ kindly provided us with Debian banners to decorate the
29 booth and some Debian T-shirts to give away. Moreover, we were equipped with
30 laptops running Debian squeeze and sid, as well as two additional laptops each
31 running a Debian squeeze virtual machine on top of Mac OS X and Windows,
32 respectively (CDs with the VM image were also available for visitors to take
33 home). To demonstrate Debian's versatility, we had a complete Debian
34 archive mirror that was used to show the full selection of available software
35 and the simplicity of installation and upgrade procedures.  The mirror
36 was provided from an external harddrive by a commodity router box
37 running the Debian-based DebWrt_ distribution.
38 All machines were connected to our own local wired network to avoid problems
39 with conference center's free wireless network (poor at best). Finally, we had
40 several hundred `tri-fold flyers`_ with general Debian facts on one side, and
41 NeuroDebian facts on the other (`sources are available`_).
42
43
44 .. figure:: pics/sfn2010/BoothReady.jpg
45
46    Final booth setup with staff (left to right): Michael Hanke, Yaroslav
47    Halchenko and Swaroop Guntupali.
48
49
50 Booth visitors
51 --------------
52
53 The booth was well attended on all days of the conference. Many people were
54 somewhat surprised, but also pleased to see Debian represented. The visitors
55 comprised the whole range from long-term Debian users to people who were not
56 aware of an operating system other than Windows and Mac OS.
57
58 A number of visitors were involved in free software development -- at various
59 levels. We talked to a Debian ftpmaster, a Gentoo developer, various developers
60 of neuroscience-related software that is already integrated in Debian and many
61 more whose work still needs to be packaged.  We were visited by representatives of
62 companies looking for support to get their open-source products into Debian.
63 The vast majority, however, were scientists looking for a better research
64 platform for their labs. That included the struggling Phd-student, as well as
65 lab heads sharing their experience managing a computing infrastructure for
66 neuroscience research.
67
68 The Debian booth also served as a platform for upstream developers to meet with
69 Debian users of their software.
70
71 .. image:: pics/sfn2010/BusyBooth.jpg
72
73
74
75 Debian-based systems are the preferred Linux environment
76 --------------------------------------------------------
77
78 The overwhelming majority of visitors running some Linux flavor used a
79 Debian-based operating system -- including Debian_ itself, Ubuntu_ and
80 sidux/apttosid_. Especially people using Python for research purposes seem to
81 prefer the comprehensive support of Python modules in Debian, whereas e.g. R_
82 users are more uniformly distributed across GNU/Linux distributions. This
83 assessment is, of course, biased by the fact that Debian was the only
84 distribution that was present at this conference.
85
86 In general, we had the impression that Linux users employ a larger variety of
87 tools in their research activities, whereas users of proprietary operating
88 systems tended to limit themselves to a more restricted set, or use an
89 intermediate computing platform, such as Matlab.
90
91 .. figure:: pics/sfn2010/NeuroDebianPosterSession.jpg
92
93    During the conference's poster session we explained the Debian system and
94    community processes to many interested visitors (`download the poster`_).
95
96
97 Take-home messages
98 ------------------
99
100 While there was a large variety of topics that were brought up by visitors there
101 were some common patterns.
102
103 Visibility
104
105   For a Debian developer it may be surprising, but many people still do not
106   know that Debian exists -- even despite the fact that Debian is often a
107   perfect match for their particular requirements. People who got introduced to
108   Debian at the booth often couldn't believe what they were hearing or
109   seeing: so much software, runs on any hardware, all for free.
110
111   We believe it would be very beneficial for Debian to reach out beyond the IT
112   sector and present itself in all fields of applications that it already
113   supports today.
114
115 Debian and Ubuntu
116
117   Apparently it is still a largely unknown fact that Ubuntu is based on Debian.
118
119 Live-CD
120
121   There was a significant demand for (customized) Live-CDs. On one hand, people
122   were asking for a way to quickly try out Debian (and we believe that this
123   doesn't necessarily have to be a live-cd). On the other hand, for example,
124   teachers were asking for means to temporarily deploy Debian on, e.g.
125   university computer pool machines and use Debian-packaged software for
126   teaching courses (e.g. on brain-imaging data analysis).
127
128 Electrophysiology tools
129
130   Of all subfields of neuroscience, electrophysiology researchers expressed the
131   greatest demand for better tools in Debian -- or basically at least some
132   specialized tools at all.  Moreover, many research projects relying
133   on FOSS solutions in electrophysiology already use Debian-based
134   systems to accomplish the mission; they just rely on manual (from sources)
135   deployment of the necessary tools.  We started a `new Debian Science Blend task`_ to
136   collect information about existing relevant software and to eventually package it.
137
138 Realtime capabilities
139
140   Apparently, numerous research groups utilize Debian-based equipment to perform
141   various flavors of real-time data acquisition and processing. They expressed
142   their demand for real-time capabilities of (some) Debian kernel images.
143
144 Cloud-computing
145
146   Cloud-computing seems to be an increasingly interesting topic for neuroscience
147   data analysis. We got the impression that there is a tendency to look for
148   alternatives to Matlab to be able to run analyses in the cloud cheaper (or at
149   all). We pointed people to ongoing efforts in Debian to enable Debian-based
150   cloud computing (see e.g. the `Debian wiki`_).
151
152
153 Many Thanks
154 -----------
155
156 Throughout the conference many people stopped by to express their gratitude to
157 Debian for developing their operating system of choice. We want to affirm this
158 and relay it to the larger Debian community. Thanks for Debian.
159
160
161 Acknowledgements
162 ----------------
163
164 This booth has been made possible by the generous support of Prof. James V.
165 Haxby (Dartmouth College, New Hampshire, USA) and `other donations to the Debian
166 project`_.
167
168
169 .. _annual meeting: http://www.sfn.org/am2010/
170 .. _SfN2010: http://www.sfn.org/am2010/
171 .. _Society for Neuroscience: http://www.sfn.org/
172 .. _Don Armstrong: http://www.donarmstrong.org
173 .. _DebWrt: http://www.debwrt.net
174 .. _Debian: http://www.debian.org
175 .. _Ubuntu: http://www.ubuntu.com
176 .. _apttosid: http://aptosid.com
177 .. _R: http://www.r-project.org
178 .. _tri-fold flyers: http://neuro.debian.net/_files/brochure_debian-neurodebian.pdf
179 .. _sources are available: http://git.debian.org/?p=pkg-exppsy/neurodebian.git;a=tree;hb=HEAD;f=artwork/brochure
180 .. _Debian wiki: http://wiki.debian.org/Cloud
181 .. _new Debian Science Blend task: http://blends.alioth.debian.org/science/tasks/neuroscience-electrophysiology
182 .. _download the poster: http://neuro.debian.net/_files/NeuroDebian_SfN2010.png
183 .. _other donations to the Debian project: http://www.debian.org/donations