pkg/trunk/R/db.R

   1
   2 db_start <- function() {
   3     drv <- dbDriver('SQLite')
   4     con <- dbConnect(drv, dbname=file.path(cache_root,'cran2deb.db'))
   5     if (!dbExistsTable(con,'sysreq_override')) {
   6         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE sysreq_override ('
   7                   ,' depend_alias TEXT NOT NULL'
   8                   ,',r_pattern TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
   9                   ,')'))
  10     }
  11     if (!dbExistsTable(con,'debian_dependency')) {
  12         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE debian_dependency ('
  13                   ,' id INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT NOT NULL'
  14                   ,',alias TEXT NOT NULL'
  15                   ,',build INTEGER NOT NULL'
  16                   ,',debian_pkg TEXT NOT NULL'
  17                   ,',UNIQUE (alias,build,debian_pkg)'
  18                   ,')'))
  19     }
  20     if (!dbExistsTable(con,'forced_depends')) {
  21         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE forced_depends ('
  22                   ,' r_name TEXT NOT NULL'
  23                   ,',depend_alias TEXT NOT NULL'
  24                   ,',PRIMARY KEY (r_name,depend_alias)'
  25                   ,')'))
  26     }
  27     if (!dbExistsTable(con,'license_override')) {
  28         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE license_override ('
  29                   ,' name TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
  30                   ,',accept INT NOT NULL'
  31                   ,')'))
  32     }
  33     if (!dbExistsTable(con,'license_hashes')) {
  34         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE license_hashes ('
  35                   ,' name TEXT NOT NULL'
  36                   ,',sha1 TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
  37                   ,')'))
  38     }
  39     if (!dbExistsTable(con,'database_versions')) {
  40         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE database_versions ('
  41                   ,' version INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT NOT NULL'
  42                   ,',version_date INTEGER NOT NULL'
  43                   ,',base_epoch INTEGER NOT NULL'
  44                   ,')'))
  45         db_add_version(con,1,0)
  46     }
  47     if (!dbExistsTable(con,'packages')) {
  48         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE packages ('
  49                   ,' package TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
  50                   ,',latest_r_version TEXT'
  51                   ,')'))
  52     }
  53     if (!dbExistsTable(con,'builds')) {
  54         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE builds ('
  55                   ,' id INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT NOT NULL'
  56                   ,',package TEXT NOT NULL'
  57                   ,',r_version TEXT NOT NULL'
  58                   ,',deb_epoch INTEGER NOT NULL'
  59                   ,',deb_revision INTEGER NOT NULL'
  60                   ,',db_version INTEGER NOT NULL'
  61                   ,',success INTEGER NOT NULL'
  62                   ,',log TEXT'
  63                   ,',UNIQUE(package,r_version,deb_epoch,deb_revision,db_version)'
  64                   ,')'))
  65     }
  66     return(con)
  67 }
  68
  69 db_stop <- function(con,bump=F) {
  70     if (bump) {
  71         db_bump(con)
  72     }
  73     dbDisconnect(con)
  74 }
  75
  76 db_quote <- function(text) {
  77     return(paste('"',gsub('([^][[:alnum:]*?. ()<>:/=+%-])','\\\\\\1',text),'"',sep=''))
  78 }
  79
  80 db_now <- function() {
  81     return(as.integer(gsub('-','',Sys.Date())))
  82 }
  83
  84 db_cur_version <- function(con) {
  85     return(as.integer(dbGetQuery(con, 'SELECT max(version) FROM database_versions')[[1]]))
  86 }
  87
  88 db_base_epoch <- function(con) {
  89     return(as.integer(dbGetQuery(con,
  90         paste('SELECT max(base_epoch) FROM database_versions'
  91              ,'WHERE version IN (SELECT max(version) FROM database_versions)'))[[1]]))
  92 }
  93
  94 db_get_base_epoch <- function() {
  95     con <- db_start()
  96     v <- db_base_epoch(con)
  97     db_stop(con)
  98     return(v)
  99 }
 100
 101 db_add_version <- function(con, version, epoch) {
 102     dbGetQuery(con,paste('INSERT INTO database_versions (version,version_date,base_epoch)'
 103               ,'VALUES (',as.integer(version),',',db_now(),',',as.integer(epoch),')'))
 104 }
 105
 106 db_bump <- function(con) {
 107     db_add_version(con,db_cur_version(con)+1, db_base_epoch(con))
 108 }
 109
 110 db_bump_epoch <- function(con) {
 111     db_add_version(con,db_cur_version(con)+1, db_base_epoch(con)+1)
 112 }
 113
 114 db_sysreq_override <- function(sysreq_text) {
 115     con <- db_start()
 116     results <- dbGetQuery(con,paste(
 117                     'SELECT DISTINCT depend_alias FROM sysreq_override WHERE'
 118                             ,db_quote(tolower(sysreq_text)),'LIKE r_pattern'))
 119     db_stop(con)
 120     if (length(results) == 0) {
 121         return(NA)
 122     }
 123     return(results$depend_alias)
 124 }
 125
 126 db_add_sysreq_override <- function(pattern,depend_alias) {
 127     con <- db_start()
 128     results <- dbGetQuery(con,paste(
 129                      'INSERT OR REPLACE INTO sysreq_override'
 130                     ,'(depend_alias, r_pattern) VALUES ('
 131                     ,' ',db_quote(tolower(depend_alias))
 132                     ,',',db_quote(tolower(pattern))
 133                     ,')'))
 134     db_stop(con,TRUE)
 135 }
 136
 137 db_sysreq_overrides <- function() {
 138     con <- db_start()
 139     overrides <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM sysreq_override'))
 140     db_stop(con)
 141     return(overrides)
 142 }
 143
 144 db_get_depends <- function(depend_alias,build=F) {
 145     con <- db_start()
 146     results <- dbGetQuery(con,paste(
 147                     'SELECT DISTINCT debian_pkg FROM debian_dependency WHERE'
 148                     ,db_quote(tolower(depend_alias)),'= alias'
 149                     ,'AND',as.integer(build),'= build'))
 150     db_stop(con)
 151     return(results$debian_pkg)
 152 }
 153
 154 db_add_depends <- function(depend_alias,debian_pkg,build=F) {
 155     con <- db_start()
 156     results <- dbGetQuery(con,paste(
 157                      'INSERT OR REPLACE INTO debian_dependency'
 158                     ,'(alias, build, debian_pkg) VALUES ('
 159                     ,' ',db_quote(tolower(depend_alias))
 160                     ,',',as.integer(build)
 161                     ,',',db_quote(tolower(debian_pkg))
 162                     ,')'))
 163     db_stop(con,TRUE)
 164 }
 165
 166 db_depends <- function() {
 167     con <- db_start()
 168     depends <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM debian_dependency'))
 169     db_stop(con)
 170     return(depends)
 171 }
 172
 173 db_get_forced_depends <- function(r_name) {
 174     con <- db_start()
 175     forced_depends <- dbGetQuery(con,
 176                 paste('SELECT depend_alias FROM forced_depends WHERE'
 177                      ,db_quote(r_name),'= r_name'))
 178     db_stop(con)
 179     return(forced_depends$depend_alias)
 180 }
 181
 182 db_add_forced_depends <- function(r_name, depend_alias) {
 183     if (!length(db_get_depends(depend_alias,build=F)) &&
 184         !length(db_get_depends(depend_alias,build=T))) {
 185         fail('Debian dependency alias',depend_alias,'is not know,'
 186                   ,'yet trying to force a dependency on it?')
 187     }
 188     con <- db_start()
 189     dbGetQuery(con,
 190             paste('INSERT OR REPLACE INTO forced_depends (r_name, depend_alias)'
 191                  ,'VALUES (',db_quote(r_name),',',db_quote(depend_alias),')'))
 192     db_stop(con,TRUE)
 193 }
 194
 195 db_forced_depends <- function() {
 196     con <- db_start()
 197     depends <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM forced_depends'))
 198     db_stop(con)
 199     return(depends)
 200 }
 201
 202 db_license_override_name <- function(name) {
 203     con <- db_start()
 204     results <- dbGetQuery(con,paste(
 205                     'SELECT DISTINCT accept FROM license_override WHERE'
 206                             ,db_quote(tolower(name)),'= name'))
 207     db_stop(con)
 208     if (length(results) == 0) {
 209         return(NA)
 210     }
 211     return(as.logical(results$accept))
 212 }
 213
 214 db_add_license_override <- function(name,accept) {
 215     notice('adding',name,'accept?',accept)
 216     if (accept != TRUE && accept != FALSE) {
 217         fail('accept must be TRUE or FALSE')
 218     }
 219     con <- db_start()
 220     results <- dbGetQuery(con,paste(
 221                      'INSERT OR REPLACE INTO license_override'
 222                     ,'(name, accept) VALUES ('
 223                     ,' ',db_quote(tolower(name))
 224                     ,',',as.integer(accept)
 225                     ,')'))
 226     db_stop(con,TRUE)
 227 }
 228
 229 db_license_override_hash <- function(license_sha1) {
 230     con <- db_start()
 231     results <- dbGetQuery(con,paste(
 232                      'SELECT DISTINCT accept FROM license_override'
 233                     ,'INNER JOIN license_hashes'
 234                     ,'ON license_hashes.name = license_override.name WHERE'
 235                     ,db_quote(tolower(license_sha1)),'= license_hashes.sha1'))
 236     db_stop(con)
 237     if (length(results) == 0) {
 238         return(NA)
 239     }
 240     return(as.logical(results$accept))
 241 }
 242
 243 db_license_overrides <- function() {
 244     con <- db_start()
 245     overrides <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM license_override'))
 246     hashes    <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM license_hashes'))
 247     db_stop(con)
 248     return(list(overrides=overrides,hashes=hashes))
 249 }
 250
 251 db_add_license_hash <- function(name,license_sha1) {
 252     if (is.na(db_license_override_name(name))) {
 253         fail('license',name,'is not know, yet trying to add a hash for it?')
 254     }
 255     notice('adding hash',license_sha1,'for',name)
 256     con <- db_start()
 257     dbGetQuery(con,paste(
 258          'INSERT OR REPLACE INTO license_hashes'
 259         ,'(name, sha1) VALUES ('
 260         ,' ',db_quote(tolower(name))
 261         ,',',db_quote(tolower(license_sha1))
 262         ,')'))
 263     db_stop(con,TRUE)
 264 }
 265
 266
 267 db_update_package_versions <- function() {
 268     con <- db_start()
 269     for (package in available[,'Package']) {
 270         dbGetQuery(con, paste('INSERT OR REPLACE INTO packages (package,latest_r_version)'
 271                              ,'VALUES (',db_quote(package)
 272                              ,',',db_quote(available[package,'Version']),')'))
 273     }
 274     db_stop(con)
 275 }
 276
 277 db_record_build <- function(package, deb_version, log, success=F) {
 278     con <- db_start()
 279     dbGetQuery(con,paste('INSERT INTO builds'
 280                         ,'(package,r_version,deb_epoch,deb_revision,db_version,success,log)'
 281                         ,'VALUES'
 282                         ,'(',db_quote(package)
 283                         ,',',db_quote(version_upstream(deb_version))
 284                         ,',',db_quote(version_epoch(deb_version))
 285                         ,',',db_quote(version_revision(deb_version))
 286                         ,',',db_cur_version(con)
 287                         ,',',as.integer(success)
 288                         ,',',db_quote(paste(log, collapse='\n'))
 289                         ,')'))
 290     db_stop(con)
 291 }
 292
 293 db_latest_build <- function(pkgname) {
 294     con <- db_start()
 295     build <- dbGetQuery(con, paste('SELECT * FROM builds'
 296                        ,'NATURAL JOIN (SELECT package,max(id) AS max_id FROM builds'
 297                        ,              'GROUP BY package) AS last'
 298                        ,'WHERE id = max_id'
 299                        ,'AND builds.package =',db_quote(pkgname)))
 300     db_stop(con)
 301     return(build)
 302 }
 303
 304 db_latest_build_version <- function(pkgname) {
 305     build <- db_latest_build(pkgname)
 306     if (length(build) == 0) {
 307         return(NA)
 308     }
 309     return(version_new(build$r_version, build$deb_revision, build$deb_epoch))
 310 }
 311
 312 db_latest_build_status <- function(pkgname) {
 313     build <- db_latest_build(pkgname)
 314     if (length(build) == 0) {
 315         return(NA)
 316     }
 317     return(c(build$success,build$log))
 318 }
 319
 320 db_outdated_packages <- function() {
 321     con <- db_start()
 322     packages <- dbGetQuery(con,paste('SELECT packages.package FROM packages'
 323                ,'LEFT OUTER JOIN ('
 324                # extract the latest attempt at building each package
 325                ,      'SELECT * FROM builds'
 326                ,      'NATURAL JOIN (SELECT package,max(id) AS max_id FROM builds'
 327                ,                    'GROUP BY package) AS last'
 328                ,      'WHERE id = max_id) AS build'
 329                ,'ON build.package = packages.package'
 330                # outdated iff:
 331                # - there is no latest build
 332                ,'WHERE build.package IS NULL'
 333                # - the database has changed since last build
 334                ,'OR build.db_version < (SELECT max(version) FROM database_versions)'
 335                # - the debian epoch has been bumped up
 336                ,'OR build.deb_epoch < (SELECT max(base_epoch) FROM database_versions'
 337                ,                        'WHERE version IN ('
 338                ,                            'SELECT max(version) FROM database_versions))'
 339                # - the latest build is not of the latest R version
 340                ,'OR build.r_version != packages.latest_r_version'
 341                ))$package
 342     db_stop(con)
 343     return(packages)
 344 }
 345