pkg/R/print.xtable.R

   1 ### xtable package\r
   2 ###\r
   3 ### Produce LaTeX and HTML tables from R objects.\r
   4 ###\r
   5 ### Copyright 2000-2012 David B. Dahl <dahl@stat.tamu.edu>\r
   6 ###\r
   7 ### Maintained by Charles Roosen <croosen@mango-solutions.com>\r
   8 ###\r
   9 ### This file is part of the `xtable' library for R and related languages.\r
  10 ### It is made available under the terms of the GNU General Public\r
  11 ### License, version 2, or at your option, any later version,\r
  12 ### incorporated herein by reference.\r
  13 ###\r
  14 ### This program is distributed in the hope that it will be\r
  15 ### useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied\r
  16 ### warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR\r
  17 ### PURPOSE.  See the GNU General Public License for more\r
  18 ### details.\r
  19 ###\r
  20 ### You should have received a copy of the GNU General Public\r
  21 ### License along with this program; if not, write to the Free\r
  22 ### Software Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330, Boston,\r
  23 ### MA 02111-1307, USA\r
  24 print.xtable <- function(\r
  25   x,\r
  26   type=getOption("xtable.type", "latex"),\r
  27   file=getOption("xtable.file", ""),\r
  28   append=getOption("xtable.append", FALSE),\r
  29   floating=getOption("xtable.floating", TRUE),\r
  30   floating.environment=getOption("xtable.floating.environment", "table"),\r
  31   table.placement=getOption("xtable.table.placement", "ht"),\r
  32   caption.placement=getOption("xtable.caption.placement", "bottom"),\r
  33   latex.environments=getOption("xtable.latex.environments", c("center")),\r
  34   tabular.environment=getOption("xtable.tabular.environment", "tabular"),\r
  35   size=getOption("xtable.size", NULL),\r
  36   hline.after=getOption("xtable.hline.after", c(-1,0,nrow(x))),\r
  37   NA.string=getOption("xtable.NA.string", ""),\r
  38   include.rownames=getOption("xtable.include.rownames", TRUE),\r
  39   include.colnames=getOption("xtable.include.colnames", TRUE),\r
  40   only.contents=getOption("xtable.only.contents", FALSE),\r
  41   add.to.row=getOption("xtable.add.to.row", NULL),\r
  42   sanitize.text.function=getOption("xtable.sanitize.text.function", NULL),\r
  43   sanitize.rownames.function=getOption("xtable.sanitize.rownames.function", \r
  44     sanitize.text.function),\r
  45   sanitize.colnames.function=getOption("xtable.sanitize.colnames.function", \r
  46     sanitize.text.function),\r
  47   math.style.negative=getOption("xtable.math.style.negative", FALSE),\r
  48   html.table.attributes=getOption("xtable.html.table.attributes", "border=1"),\r
  49   print.results=getOption("xtable.print.results", TRUE),\r
  50   format.args=getOption("xtable.format.args", NULL),\r
  51   short.caption=getOption("xtable.short.caption", NULL),\r
  52   rotate.rownames=getOption("xtable.rotate.rownames", FALSE),\r
  53   rotate.colnames=getOption("xtable.rotate.colnames", FALSE),\r
  54   booktabs = getOption("xtable.booktabs", FALSE),\r
  55   ...) {\r
  56   # Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 hline.after\r
  57   # By default it print an \hline before and after the columns names independently they are printed or not and at the end of the table\r
  58   # Old code that set hline.after should include c(-1, 0, nrow(x)) in the hline.after vector\r
  59   # If you do not want any \hline inside the data, set hline.after to NULL \r
  60   # PHEADER instead the string '\\hline\n' is used in the code\r
  61   # Now hline.after counts how many time a position appear  \r
  62   # I left an automatic PHEADER in the longtable is this correct?\r
  63 \r
  64   # Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 include.rownames, include.colnames  \r
  65   pos <- 0\r
  66   if (include.rownames) pos <- 1\r
  67   \r
  68   # Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 hline.after checks\r
  69   if (any(hline.after < -1) | any(hline.after > nrow(x))) stop("'hline.after' must be inside [-1, nrow(x)]")\r
  70   \r
  71   # Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 add.to.row checks\r
  72   if (!is.null(add.to.row)) {\r
  73     if (is.list(add.to.row) && length(add.to.row)==2) {\r
  74       if (is.null(names(add.to.row))) {\r
  75         names(add.to.row) <- c('pos', 'command')\r
  76       } else if (any(sort(names(add.to.row))!=c('command', 'pos'))) {\r
  77         stop("the names of the elements of 'add.to.row' must be 'pos' and 'command'")\r
  78       }\r
  79       if (is.list(add.to.row$pos) && is.vector(add.to.row$command, mode='character')) {\r
  80         if ((npos <- length(add.to.row$pos)) != length(add.to.row$command)) {\r
  81           stop("the length of 'add.to.row$pos' must be equal to the length of 'add.to.row$command'")\r
  82         }\r
  83         if (any(unlist(add.to.row$pos) < -1) | any(unlist(add.to.row$pos) > nrow(x))) {\r
  84           stop("the values in add.to.row$pos must be inside the interval [-1, nrow(x)]")\r
  85         }\r
  86       } else {\r
  87         stop("the first argument ('pos') of 'add.to.row' must be a list, the second argument ('command') must be a vector of mode character")\r
  88       }\r
  89     } else {\r
  90       stop("'add.to.row' argument must be a list of length 2")\r
  91     }\r
  92   } else {\r
  93      add.to.row <- list(pos=list(), command=vector(length=0, mode="character"))\r
  94      npos <- 0\r
  95   }\r
  96 \r
  97   # Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 add.to.row\r
  98   # Add further commands at the end of rows\r
  99   if (type=="latex") {\r
 100     ## Original code before changes in version 1.6-1\r
 101     # PHEADER <- "\\hline\n"\r
 102 \r
 103         # booktabs code from Matthieu Stigler <matthieu.stigler@gmail.com>, 1 Feb 2012\r
 104     if(!booktabs){\r
 105       PHEADER <- "\\hline\n"\r
 106         } else {\r
 107       PHEADER <- ifelse(-1%in%hline.after, "\\toprule\n", "") \r
 108       if(0%in%hline.after) {\r
 109         PHEADER <- c(PHEADER, "\\midrule\n")\r
 110           }\r
 111       if(nrow(x)%in%hline.after) {\r
 112         PHEADER <- c(PHEADER, "\\bottomrule\n")\r
 113           }\r
 114     }\r
 115   } else {\r
 116      PHEADER <- ""\r
 117   }\r
 118    \r
 119   lastcol <- rep(" ", nrow(x)+2)\r
 120   if (!is.null(hline.after)) {\r
 121     # booktabs change - Matthieu Stigler: fill the hline arguments separately, 1 Feb 2012\r
 122         #\r
 123     # Code before booktabs change was:\r
 124         #    add.to.row$pos[[npos+1]] <- hline.after\r
 125 \r
 126     if (!booktabs){\r
 127        add.to.row$pos[[npos+1]] <- hline.after\r
 128         } else {\r
 129        for(i in 1:length(hline.after)) {            \r
 130               add.to.row$pos[[npos+i]] <- hline.after[i] \r
 131            }\r
 132     }      \r
 133     add.to.row$command <- c(add.to.row$command, PHEADER)\r
 134   }\r
 135 \r
 136   if ( length(add.to.row$command) > 0 ) {\r
 137     for (i in 1:length(add.to.row$command)) {\r
 138       addpos <- add.to.row$pos[[i]]\r
 139       freq <- table(addpos)\r
 140       addpos <- unique(addpos)\r
 141       for (j in 1:length(addpos)) {\r
 142         lastcol[addpos[j]+2] <- paste(lastcol[addpos[j]+2], paste(rep(add.to.row$command[i], freq[j]), sep="", collapse=""), sep=" ")\r
 143       }\r
 144     }\r
 145   }\r
 146   \r
 147   if (length(type)>1) stop("\"type\" must have length 1")\r
 148   type <- tolower(type)\r
 149   if (!all(!is.na(match(type,c("latex","html"))))) stop("\"type\" must be in {\"latex\", \"html\"}")\r
 150   if (!all(!is.na(match(floating.environment,c("table","table*","sidewaystable"))))) stop("\"type\" must be in {\"table\", \"table*\", \"sidewaystable\"}")\r
 151   if (!is.null(table.placement) && !all(!is.na(match(unlist(strsplit(table.placement, split="")),c("H","h","t","b","p","!"))))) {\r
 152     stop("\"table.placement\" must contain only elements of {\"h\",\"t\",\"b\",\"p\",\"!\"}")\r
 153   }\r
 154   if (!all(!is.na(match(caption.placement,c("bottom","top"))))) stop("\"caption.placement\" must be either {\"bottom\",\"top\"}")\r
 155 \r
 156   if (type=="latex") {\r
 157     BCOMMENT <- "% "\r
 158     ECOMMENT <- "\n"\r
 159     # See e-mail from "John S. Walker <jsw9c@uic.edu>" dated 5-19-2003 regarding "texfloat"\r
 160     # See e-mail form "Fernando Henrique Ferraz P. da Rosa" <academic@feferraz.net>" dated 10-28-2005 regarding "longtable"\r
 161     if ( tabular.environment == "longtable" & floating == TRUE ) {\r
 162       warning("Attempt to use \"longtable\" with floating=TRUE. Changing to FALSE.")\r
 163       floating <- FALSE\r
 164     }\r
 165     if ( floating == TRUE ) {\r
 166       # See e-mail from "Pfaff, Bernhard <Bernhard.Pfaff@drkw.com>" dated 7-09-2003 regarding "suggestion for an amendment of the source"\r
 167       # See e-mail from "Mitchell, David" <David.Mitchell@dotars.gov.au>" dated 2003-07-09 regarding "Additions to R xtable package"\r
 168       # See e-mail from "Garbade, Sven" <Sven.Garbade@med.uni-heidelberg.de> dated 2006-05-22 regarding the floating environment.\r
 169       BTABLE <- paste("\\begin{", floating.environment, "}",ifelse(!is.null(table.placement),\r
 170         paste("[",table.placement,"]",sep=""),""),"\n",sep="")\r
 171       if ( is.null(latex.environments) || (length(latex.environments)==0) ) {\r
 172         BENVIRONMENT <- ""\r
 173         EENVIRONMENT <- ""\r
 174       }\r
 175       else {\r
 176         BENVIRONMENT <- ""\r
 177         EENVIRONMENT <- ""\r
 178         for ( i in 1:length(latex.environments) ) {\r
 179           if ( latex.environments[i] == "" ) next\r
 180           BENVIRONMENT <- paste(BENVIRONMENT, "\\begin{",latex.environments[i],"}\n",sep="")\r
 181           EENVIRONMENT <- paste("\\end{",latex.environments[i],"}\n",EENVIRONMENT,sep="")\r
 182         }\r
 183       }\r
 184       ETABLE <- paste("\\end{", floating.environment, "}\n", sep="")\r
 185     }\r
 186     else {\r
 187       BTABLE <- ""\r
 188       ETABLE <- ""\r
 189       BENVIRONMENT <- ""\r
 190       EENVIRONMENT <- ""\r
 191     }\r
 192 \r
 193     tmp.index.start <- 1\r
 194     if ( ! include.rownames ) {\r
 195       while ( attr(x,"align",exact=TRUE)[tmp.index.start] == '|' ) tmp.index.start <- tmp.index.start + 1\r
 196       tmp.index.start <- tmp.index.start + 1\r
 197     }\r
 198     BTABULAR <- paste("\\begin{",tabular.environment,"}{",\r
 199                       paste(c(attr(x, "align",exact=TRUE)[tmp.index.start:length(attr(x,"align",exact=TRUE))], "}\n"),\r
 200                             sep="", collapse=""),\r
 201                       sep="")\r
 202     \r
 203     ## fix 10-26-09 (robert.castelo@upf.edu) the following 'if' condition is added here to support\r
 204     ## a caption on the top of a longtable\r
 205     if (tabular.environment == "longtable" && caption.placement=="top") {\r
 206                 if (is.null(short.caption)){\r
 207                         BCAPTION <- "\\caption{"\r
 208                 } else {\r
 209                         BCAPTION <- paste("\\caption[", short.caption, "]{", sep="")\r
 210                 }       \r
 211         ECAPTION <- "} \\\\ \n"\r
 212         if ((!is.null(attr(x,"caption",exact=TRUE))) && (type=="latex")) BTABULAR <- paste(BTABULAR,  BCAPTION, attr(x,"caption",exact=TRUE), ECAPTION, sep="")\r
 213     }\r
 214     # Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 add.to.row position -1\r
 215     BTABULAR <- paste(BTABULAR,lastcol[1], sep="")\r
 216     # the \hline at the end, if present, is set in full matrix    \r
 217     ETABULAR <- paste("\\end{",tabular.environment,"}\n",sep="")\r
 218     \r
 219     # BSIZE contributed by Benno <puetz@mpipsykl.mpg.de> in e-mail dated Wednesday, December 01, 2004\r
 220     if (is.null(size) || !is.character(size)) {\r
 221       BSIZE <- ""\r
 222       ESIZE <- ""\r
 223     } else {\r
 224       if(length(grep("^\\\\",size))==0){\r
 225         size <- paste("\\",size,sep="")\r
 226       }\r
 227       BSIZE <- paste("{",size,"\n",sep="")\r
 228       ESIZE <- "}\n"\r
 229     }\r
 230     BLABEL <- "\\label{"\r
 231     ELABEL <- "}\n"\r
 232         if (is.null(short.caption)){\r
 233                 BCAPTION <- "\\caption{"\r
 234         } else {\r
 235                 BCAPTION <- paste("\\caption[", short.caption, "]{", sep="")\r
 236         }       \r
 237     ECAPTION <- "}\n"\r
 238     BROW <- ""\r
 239     EROW <- " \\\\ \n"\r
 240     BTH <- ""\r
 241     ETH <- ""\r
 242     STH <- " & "\r
 243     BTD1 <- " & "\r
 244     BTD2 <- ""\r
 245     BTD3 <- ""\r
 246     ETD  <- ""\r
 247     # Based on contribution from Jonathan Swinton <jonathan@swintons.net> in e-mail dated Wednesday, January 17, 2007\r
 248     sanitize <- function(str) {\r
 249       result <- str\r
 250       result <- gsub("\\\\","SANITIZE.BACKSLASH",result)\r
 251       result <- gsub("$","\\$",result,fixed=TRUE)\r
 252       result <- gsub(">","$>$",result,fixed=TRUE)\r
 253       result <- gsub("<","$<$",result,fixed=TRUE)\r
 254       result <- gsub("|","$|$",result,fixed=TRUE)\r
 255       result <- gsub("{","\\{",result,fixed=TRUE)\r
 256       result <- gsub("}","\\}",result,fixed=TRUE)\r
 257       result <- gsub("%","\\%",result,fixed=TRUE)\r
 258       result <- gsub("&","\\&",result,fixed=TRUE)\r
 259       result <- gsub("_","\\_",result,fixed=TRUE)\r
 260       result <- gsub("#","\\#",result,fixed=TRUE)\r
 261       result <- gsub("^","\\verb|^|",result,fixed=TRUE)\r
 262       result <- gsub("~","\\~{}",result,fixed=TRUE)\r
 263       result <- gsub("SANITIZE.BACKSLASH","$\\backslash$",result,fixed=TRUE)\r
 264       return(result)\r
 265     }\r
 266     sanitize.numbers <- function(x) {\r
 267       result <- x\r
 268       if ( math.style.negative ) {\r
 269         # Jake Bowers <jwbowers@illinois.edu> in e-mail from 2008-08-20 suggested\r
 270         # disabling this feature to avoid problems with LaTeX's dcolumn package.\r
 271         # by Florian Wickelmaier <florian.wickelmaier@uni-tuebingen.de> in e-mail\r
 272         # from 2008-10-03 requested the ability to use the old behavior.\r
 273         for(i in 1:length(x)) {\r
 274           result[i] <- gsub("-","$-$",result[i],fixed=TRUE)\r
 275         }\r
 276       }\r
 277       return(result)\r
 278     }\r
 279     sanitize.final <- function(result) {\r
 280       return(result)\r
 281     }\r
 282   } else {\r
 283     BCOMMENT <- "<!-- "\r
 284     ECOMMENT <- " -->\n"\r
 285     BTABLE <- paste("<TABLE ",html.table.attributes,">\n",sep="")\r
 286     ETABLE <- "</TABLE>\n"\r
 287     BENVIRONMENT <- ""\r
 288     EENVIRONMENT <- ""\r
 289     BTABULAR <- ""\r
 290     ETABULAR <- ""\r
 291     BSIZE <- ""\r
 292     ESIZE <- ""\r
 293     BLABEL <- "<A NAME="\r
 294     ELABEL <- "></A>\n"\r
 295     BCAPTION <- paste("<CAPTION ALIGN=\"",caption.placement,"\"> ",sep="")\r
 296     ECAPTION <- " </CAPTION>\n"\r
 297     BROW <- "<TR>"\r
 298     EROW <- " </TR>\n"\r
 299     BTH <- " <TH> "\r
 300     ETH <- " </TH> "\r
 301     STH <- " </TH> <TH> "\r
 302     BTD1 <- " <TD align=\""\r
 303     align.tmp <- attr(x,"align",exact=TRUE)\r
 304     align.tmp <- align.tmp[align.tmp!="|"]\r
 305     BTD2 <- matrix(align.tmp[(2-pos):(ncol(x)+1)],nrow=nrow(x),ncol=ncol(x)+pos,byrow=TRUE)\r
 306     # Based on contribution from Jonathan Swinton <jonathan@swintons.net> in e-mail dated Wednesday, January 17, 2007\r
 307     BTD2[regexpr("^p",BTD2)>0] <- "left"\r
 308     BTD2[BTD2=="r"] <- "right"\r
 309     BTD2[BTD2=="l"] <- "left"\r
 310     BTD2[BTD2=="c"] <- "center"\r
 311     BTD3 <- "\"> "\r
 312     ETD  <- " </TD>"\r
 313     sanitize <- function(str) {\r
 314       result <- str\r
 315       result <- gsub("&","&amp ",result,fixed=TRUE)\r
 316       result <- gsub(">","&gt ",result,fixed=TRUE)\r
 317       result <- gsub("<","&lt ",result,fixed=TRUE)\r
 318       # Kurt Hornik <Kurt.Hornik@wu-wien.ac.at> on 2006/10/05 recommended not escaping underscores.\r
 319       # result <- gsub("_", "\\_", result, fixed=TRUE)\r
 320       return(result)\r
 321     }\r
 322     sanitize.numbers <- function(x) {\r
 323       return(x)\r
 324     }\r
 325     sanitize.final <- function(result) {\r
 326       # Suggested by Uwe Ligges <ligges@statistik.uni-dortmund.de> in e-mail dated 2005-07-30.\r
 327       result$text <- gsub("  *"," ", result$text,fixed=TRUE)\r
 328       result$text <- gsub(' align="left"', "", result$text,fixed=TRUE)\r
 329       return(result)\r
 330     }\r
 331   }\r
 332 \r
 333   result <- string("",file=file,append=append)\r
 334   info <- R.Version()\r
 335   # modified Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 to set automatically the package version\r
 336   result <- result + BCOMMENT + type + " table generated in " +\r
 337             info$language + " " + info$major + "." + info$minor + " by xtable " + packageDescription('xtable')$Version + " package" + ECOMMENT\r
 338   result <- result + BCOMMENT + date() + ECOMMENT\r
 339   # Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 only.contents\r
 340   if (!only.contents) {\r
 341     result <- result + BTABLE\r
 342     result <- result + BENVIRONMENT\r
 343     if ( floating == TRUE ) {\r
 344       if ((!is.null(attr(x,"caption",exact=TRUE))) && (type=="html" || caption.placement=="top")) result <- result + BCAPTION + attr(x,"caption",exact=TRUE) + ECAPTION\r
 345       if (!is.null(attr(x,"label",exact=TRUE)) && (type=="latex" && caption.placement=="top")) result <- result + BLABEL + attr(x,"label",exact=TRUE) + ELABEL  \r
 346     }\r
 347     result <- result + BSIZE\r
 348     result <- result + BTABULAR\r
 349   }\r
 350   # Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28 include.colnames, include.rownames \r
 351   if (include.colnames) {\r
 352     result <- result + BROW + BTH\r
 353     if (include.rownames) {\r
 354           result <- result + STH\r
 355         }  \r
 356     # David G. Whiting in e-mail 2007-10-09\r
 357     if (is.null(sanitize.colnames.function)) {                                     \r
 358           CNAMES <- sanitize(names(x))\r
 359         } else {\r
 360       CNAMES <- sanitize.colnames.function(names(x))\r
 361         }\r
 362     if (rotate.colnames) {\r
 363           #added by Markus Loecher, 2009-11-16\r
 364       CNAMES <- paste("\\begin{sideways}", CNAMES, "\\end{sideways}")\r
 365         }       \r
 366     result <- result + paste(CNAMES, collapse=STH)\r
 367 \r
 368     result <- result + ETH + EROW\r
 369   }\r
 370 \r
 371   cols <- matrix("",nrow=nrow(x),ncol=ncol(x)+pos)\r
 372   if (include.rownames) {\r
 373     # David G. Whiting in e-mail 2007-10-09\r
 374     if (is.null(sanitize.rownames.function)) {                                     \r
 375       RNAMES <- sanitize(row.names(x))\r
 376     } else {\r
 377       RNAMES <- sanitize.rownames.function(row.names(x))                         \r
 378     }\r
 379     if (rotate.rownames) {\r
 380           #added by Markus Loecher, 2009-11-16\r
 381       RNAMES <- paste("\\begin{sideways}", RNAMES, "\\end{sideways}")\r
 382         }       \r
 383         cols[,1] <- RNAMES\r
 384   }\r
 385 \r
 386 ## Begin vectorizing the formatting code by Ian Fellows [ian@fellstat.com]\r
 387 ## 06 Dec 2011\r
 388 ##\r
 389 #  disp <- function(y) {\r
 390 #    if (is.factor(y)) {\r
 391 #      y <- levels(y)[y]\r
 392 #    }\r
 393 #    if (is.list(y)) {\r
 394 #      y <- unlist(y)\r
 395 #    }\r
 396 #    return(y)\r
 397 #  }\r
 398   varying.digits <- is.matrix( attr( x, "digits",exact=TRUE ) )\r
 399   # Code for letting "digits" be a matrix was provided by Arne Henningsen <ahenningsen@agric-econ.uni-kiel.de> in e-mail dated 2005-06-04.\r
 400   #if( !varying.digits ) {\r
 401     # modified Claudio Agostinelli <claudio@unive.it> dated 2006-07-28\r
 402   #  attr(x,"digits") <- matrix( attr( x, "digits",exact=TRUE ), nrow = nrow(x), ncol = ncol(x)+1, byrow = TRUE )\r
 403   #}\r
 404   for(i in 1:ncol(x)) {\r
 405         xcol <- x[,i]\r
 406         if(is.factor(xcol))\r
 407                 xcol <- as.character(xcol)\r
 408         if(is.list(xcol))\r
 409                 xcol <- sapply(xcol,unlist)\r
 410     ina <- is.na(xcol)\r
 411     is.numeric.column <- is.numeric(xcol)\r
 412 \r
 413         if(is.character(xcol)) {\r
 414                 cols[,i+pos] <- xcol\r
 415         } else {\r
 416           if (is.null(format.args)){\r
 417             format.args <- list()\r
 418           }\r
 419           if (is.null(format.args$decimal.mark)){\r
 420             format.args$decimal.mark <- options()$OutDec\r
 421           }\r
 422           if(!varying.digits){\r
 423                 curFormatArgs <- c(list( \r
 424                     x = xcol,\r
 425                         format = ifelse( attr( x, "digits",exact=TRUE )[i+1] < 0, "E", \r
 426                           attr( x, "display",exact=TRUE )[i+1] ), \r
 427                         digits = abs( attr( x, "digits",exact=TRUE )[i+1] )),\r
 428                         format.args)\r
 429             cols[,i+pos] <- do.call("formatC", curFormatArgs)\r
 430       }else{\r
 431                 for( j in 1:nrow( cols ) ) {\r
 432                   curFormatArgs <- c(list( \r
 433             x = xcol[j],\r
 434                         format = ifelse( attr( x, "digits",exact=TRUE )[j,i+1] < 0, "E", \r
 435               attr( x, "display",exact=TRUE )[i+1] ), \r
 436             digits = abs( attr( x, "digits",exact=TRUE )[j,i+1] )),\r
 437                         format.args)\r
 438                   cols[j,i+pos] <- do.call("formatC", curFormatArgs)                    \r
 439                 }\r
 440       } \r
 441         }\r
 442         ## End Ian Fellows changes\r
 443         \r
 444     if ( any(ina) ) cols[ina,i+pos] <- NA.string\r
 445     # Based on contribution from Jonathan Swinton <jonathan@swintons.net> in e-mail dated Wednesday, January 17, 2007\r
 446     if ( is.numeric.column ) {\r
 447       cols[,i+pos] <- sanitize.numbers(cols[,i+pos])\r
 448     } else {\r
 449       if (is.null(sanitize.text.function)) {\r
 450         cols[,i+pos] <- sanitize(cols[,i+pos])\r
 451       } else {\r
 452         cols[,i+pos] <- sanitize.text.function(cols[,i+pos])\r
 453       }\r
 454     }\r
 455   }\r
 456 \r
 457   multiplier <- 5\r
 458   full <- matrix("",nrow=nrow(x),ncol=multiplier*(ncol(x)+pos)+2)\r
 459   full[,1] <- BROW\r
 460   full[,multiplier*(0:(ncol(x)+pos-1))+2] <- BTD1\r
 461   full[,multiplier*(0:(ncol(x)+pos-1))+3] <- BTD2\r
 462   full[,multiplier*(0:(ncol(x)+pos-1))+4] <- BTD3\r
 463   full[,multiplier*(0:(ncol(x)+pos-1))+5] <- cols\r
 464   full[,multiplier*(0:(ncol(x)+pos-1))+6] <- ETD\r
 465 \r
 466   full[,multiplier*(ncol(x)+pos)+2] <- paste(EROW, lastcol[-(1:2)], sep=" ")\r
 467  \r
 468   if (type=="latex") full[,2] <- ""\r
 469   result <- result + lastcol[2] + paste(t(full),collapse="")\r
 470   if (!only.contents) {\r
 471     if (tabular.environment == "longtable") {\r
 472           # booktabs change added the if() - 1 Feb 2012\r
 473           if(!booktabs) {\r
 474             result <- result + PHEADER\r
 475       }\r
 476           \r
 477       ## fix 10-27-09 Liviu Andronic (landronimirc@gmail.com) the following 'if' condition is inserted in order to avoid\r
 478       ## that bottom caption interferes with a top caption of a longtable\r
 479       if(caption.placement=="bottom"){\r
 480         if ((!is.null(attr(x,"caption",exact=TRUE))) && (type=="latex")) result <- result + BCAPTION + attr(x,"caption",exact=TRUE) + ECAPTION\r
 481       }\r
 482       if (!is.null(attr(x,"label",exact=TRUE))) result <- result + BLABEL + attr(x,"label",exact=TRUE) + ELABEL\r
 483       ETABULAR <- "\\end{longtable}\n"\r
 484     }\r
 485     result <- result + ETABULAR\r
 486     result <- result + ESIZE\r
 487     if ( floating == TRUE ) {\r
 488       if ((!is.null(attr(x,"caption",exact=TRUE))) && (type=="latex" && caption.placement=="bottom")) result <- result + BCAPTION + attr(x,"caption",exact=TRUE) + ECAPTION\r
 489       if (!is.null(attr(x,"label",exact=TRUE)) && caption.placement=="bottom") result <- result + BLABEL + attr(x,"label",exact=TRUE) + ELABEL  \r
 490     }\r
 491     result <- result + EENVIRONMENT\r
 492     result <- result + ETABLE\r
 493   }   \r
 494   result <- sanitize.final(result)\r
 495   \r
 496   if (print.results){\r
 497         print(result)\r
 498   }\r
 499   \r
 500   return(invisible(result$text))\r
 501 }\r
 502 \r
 503 "+.string" <- function(x,y) {\r
 504   x$text <- paste(x$text,as.string(y)$text,sep="")\r
 505   return(x)\r
 506 }\r
 507 \r
 508 print.string <- function(x,...) {\r
 509   cat(x$text,file=x$file,append=x$append)\r
 510   return(invisible())\r
 511 }\r
 512 \r
 513 string <- function(text,file="",append=FALSE) {\r
 514   x <- list(text=text,file=file,append=append)\r
 515   class(x) <- "string"\r
 516   return(x)\r
 517 }\r
 518 \r
 519 as.string <- function(x,file="",append=FALSE) {\r
 520   if (is.null(attr(x,"class",exact=TRUE)))\r
 521   switch(data.class(x),\r
 522       character=return(string(x,file,append)),\r
 523       numeric=return(string(as.character(x),file,append)),\r
 524       stop("Cannot coerse argument to a string"))\r
 525   if (class(x)=="string")\r
 526     return(x)\r
 527   stop("Cannot coerse argument to a string")\r
 528 }\r
 529 \r
 530 is.string <- function(x) {\r
 531   return(class(x)=="string")\r
 532 }\r
 533 \r