code_ruby/test/maasha/test_digest.rb

   1 #!/usr/bin/env ruby
   2 $:.unshift File.join(File.dirname(__FILE__),'..','lib')
   3
   4 # Copyright (C) 2007-2010 Martin A. Hansen.
   5
   6 # This program is free software; you can redistribute it and/or
   7 # modify it under the terms of the GNU General Public License
   8 # as published by the Free Software Foundation; either version 2
   9 # of the License, or (at your option) any later version.
  10
  11 # This program is distributed in the hope that it will be useful,
  12 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  13 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  14 # GNU General Public License for more details.
  15
  16 # You should have received a copy of the GNU General Public License
  17 # along with this program; if not, write to the Free Software
  18 # Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
  19
  20 # http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html
  21
  22 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  23
  24 # This software is part of the Biopieces framework (www.biopieces.org).
  25
  26 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  27
  28 require 'maasha/seq'
  29 require 'maasha/digest'
  30 require 'test/unit'
  31 require 'pp'
  32
  33 class TestDigest < Test::Unit::TestCase
  34   def setup
  35     @entry = Seq.new
  36   end
  37
  38   def test_Digest_new_raises_on_bad_pattern_residue
  39     assert_raise(DigestError) { Digest.new(@entry, "X", 4) }
  40   end
  41
  42   def test_Digest_new_dont_raise_on_ok_pattern_residue
  43     assert_nothing_raised { Digest.new(@entry, "AGCUTRYWSMKHDVBNagcutrywsmkhdvbn", 4) }
  44   end
  45
  46   def test_Digest_each
  47     @entry.seq = "aaaaTTTTbbbbTTTT"
  48     digest = Digest.new(@entry, "TTNT", 1)
  49     assert_equal("aaaaT", digest.first.seq)
  50   end
  51 end
  52
  53
  54 __END__