code_c/Maasha/src/test/test_ucsc.c

   1 #include "common.h"
   2 #include "filesys.h"
   3 #include "list.h"
   4 #include "ucsc.h"
   5
   6 static void test_bed_entry_get();
   7 static void test_bed_entries_get();
   8 static void test_bed_entries_sort();
   9
  10
  11 int main()
  12 {
  13     fprintf( stderr, "Running all tests for ucsc.c\n" );
  14
  15     test_bed_entry_get();
  16     test_bed_entries_get();
  17     test_bed_entries_sort();
  18
  19     fprintf( stderr, "Done\n\n" );
  20
  21     return EXIT_SUCCESS;
  22 }
  23
  24
  25 void test_bed_entry_get()
  26 {
  27     fprintf( stderr, "   Testing bed_entry_get ... " );
  28
  29     char      *path  = "test/test_files/test12.bed";
  30     FILE      *fp    = NULL;
  31     bed_entry *entry = NULL;
  32
  33     fp = read_open( path );
  34
  35     while ( ( entry = bed_entry_get( fp, 12 ) ) != NULL )
  36     {
  37 //        bed_entry_put( entry, 3 );
  38     }
  39
  40     close_stream( fp );
  41
  42     fprintf( stderr, "OK\n" );
  43 }
  44
  45
  46 void test_bed_entries_get()
  47 {
  48     fprintf( stderr, "   Testing bed_entries_get ... " );
  49
  50     char    *path    = "test/test_files/test12.bed";
  51     list_sl *entries = NULL;
  52
  53     entries = bed_entries_get( path, 0 );
  54
  55     bed_entries_put( entries, 0 );
  56
  57     fprintf( stderr, "OK\n" );
  58 }
  59
  60
  61 void test_bed_entries_sort()
  62 {
  63     fprintf( stderr, "   Testing bed_entries_sort ... " );
  64
  65     char    *path    = "test/test_files/test12.bed";
  66     list_sl *entries = NULL;
  67
  68     entries = bed_entries_get( path, 0 );
  69
  70     list_sl_sort( &entries, cmp_bed_sort_chr_beg );
  71     list_sl_sort( &entries, cmp_bed_sort_chr_strand_beg );
  72
  73     bed_entries_put( entries, 0 );
  74
  75     fprintf( stderr, "OK\n" );
  76 }
  77