]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blob - code_c/Maasha/src/lib/Makefile
made check_bed optional
[biopieces.git] / code_c / Maasha / src / lib / Makefile
1 # Martin Asser Hansen (mail@maasha.dk) Copyright (C) 2008 - All right reserved 
2
3 CC      = gcc
4 # Cflags  = -Wall -Werror
5 Cflags = -Wall -Werror -g -pg  # gprof
6 INC_DIR = -I ../inc/
7
8 all: barray.o bits.o common.o mem.o strings.o seq.o filesys.o fasta.o list.o hash.o ucsc.o
9
10 barray.o: barray.c
11         $(CC) $(Cflags) $(INC_DIR) -c barray.c
12
13 bits.o: bits.c
14         $(CC) $(Cflags) $(INC_DIR) -c bits.c
15
16 common.o: common.c
17         $(CC) $(Cflags) $(INC_DIR) -c common.c
18
19 mem.o: mem.c
20         $(CC) $(Cflags) $(INC_DIR) -c mem.c
21
22 strings.o: strings.c
23         $(CC) $(Cflags) $(INC_DIR) -c strings.c
24
25 seq.o: seq.c
26         $(CC) $(Cflags) $(INC_DIR) -c seq.c
27
28 filesys.o: filesys.c
29         $(CC) $(Cflags) $(INC_DIR) -c filesys.c
30
31 fasta.o: fasta.c
32         $(CC) $(Cflags) $(INC_DIR) -c fasta.c
33
34 list.o: list.c
35         $(CC) $(Cflags) $(INC_DIR) -c list.c
36
37 hash.o: hash.c
38         $(CC) $(Cflags) $(INC_DIR) -c hash.c
39
40 ucsc.o: ucsc.c
41         $(CC) $(Cflags) $(INC_DIR) -c ucsc.c
42
43 clean:
44         rm barray.o
45         rm bits.o
46         rm common.o
47         rm mem.o
48         rm strings.o
49         rm seq.o
50         rm filesys.o
51         rm fasta.o
52         rm list.o
53         rm hash.o
54         rm ucsc.o
55