code_c/Maasha/src/inc/fasta.h

   1 /* Martin Asser Hansen (mail@maasha.dk) Copyright (C) 2008 - All right reserved */
   2
   3 #define FASTA_BUFFER 1024
   4
   5 /* Count all entries in a FASTA file given a file pointer. */
   6 size_t fasta_count( FILE *fp );
   7
   8 /* Get next sequence entry from a FASTA file given a file pointer. */
   9 bool fasta_get_entry( FILE *fp, seq_entry **entry_ppt );
  10
  11 /* Output a sequence entry in FASTA format. */
  12 void fasta_put_entry( seq_entry *entry );
  13
  14 /* Get all sequence entries from a FASTA file in a list. */
  15 //void fasta_get_entries( FILE *fp, struct list **entries );
  16
  17 /* Output all sequence entries from a list in FASTA format. */
  18 //void fasta_put_entries( struct list *entries );