code_c/Maasha/src/fasta_count.c

   1 #include "common.h"
   2 #include "filesys.h"
   3 #include "seq.h"
   4 #include "fasta.h"
   5
   6
   7 /* >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> MAIN <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< */
   8
   9
  10 int main( int argc, char *argv[] )
  11 {
  12     int i;
  13     int count;
  14     int total;
  15     FILE *fp;
  16
  17     count = 0;
  18     total = 0;
  19
  20     for ( i = 1; argv[ i ]; i++ )
  21     {
  22         fp = read_open( argv[ i ] );
  23
  24         count = fasta_count( fp );
  25
  26         close_stream( fp );
  27
  28         printf( "%s: %d\n", argv[ i ], count );
  29
  30         total += count;
  31     }
  32
  33     if ( total > count ) {
  34         printf( "total: %d\n", total );
  35     }
  36
  37     return 0;
  38 }
  39
  40
  41 /* >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< */