branch/multisys/R/db.R

   1
   2 db_start <- function() {
   3     drv <- dbDriver('SQLite')
   4     con <- dbConnect(drv, dbname=file.path(cache_root,'cran2deb.db'))
   5     if (!dbExistsTable(con,'sysreq_override')) {
   6         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE sysreq_override ('
   7                   ,' depend_alias TEXT NOT NULL'
   8                   ,',r_pattern TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
   9                   ,')'))
  10     }
  11     if (!dbExistsTable(con,'debian_dependency')) {
  12         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE debian_dependency ('
  13                   ,' id INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT NOT NULL'
  14                   ,',alias TEXT NOT NULL'
  15                   ,',build INTEGER NOT NULL'
  16                   ,',debian_pkg TEXT NOT NULL'
  17                   ,',UNIQUE (alias,build,debian_pkg)'
  18                   ,')'))
  19     }
  20     if (!dbExistsTable(con,'forced_depends')) {
  21         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE forced_depends ('
  22                   ,' r_name TEXT NOT NULL'
  23                   ,',depend_alias TEXT NOT NULL'
  24                   ,',PRIMARY KEY (r_name,depend_alias)'
  25                   ,')'))
  26     }
  27     if (!dbExistsTable(con,'license_override')) {
  28         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE license_override ('
  29                   ,' name TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
  30                   ,',accept INT NOT NULL'
  31                   ,')'))
  32     }
  33     if (!dbExistsTable(con,'license_hashes')) {
  34         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE license_hashes ('
  35                   ,' name TEXT NOT NULL'
  36                   ,',sha1 TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
  37                   ,')'))
  38     }
  39     if (!dbExistsTable(con,'database_versions')) {
  40         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE database_versions ('
  41                   ,' version INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT NOT NULL'
  42                   ,',version_date INTEGER NOT NULL'
  43                   ,',base_epoch INTEGER NOT NULL'
  44                   ,')'))
  45         db_add_version(con,1,0)
  46     }
  47     if (!dbExistsTable(con,'packages')) {
  48         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE packages ('
  49                   ,' package TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
  50                   ,',latest_r_version TEXT'
  51                   ,')'))
  52     }
  53     if (!dbExistsTable(con,'builds')) {
  54         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE builds ('
  55                   ,' id INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT NOT NULL'
  56                   ,',system TEXT NOT NULL'
  57                   ,',package TEXT NOT NULL'
  58                   ,',r_version TEXT NOT NULL'
  59                   ,',deb_epoch INTEGER NOT NULL'
  60                   ,',deb_revision INTEGER NOT NULL'
  61                   ,',db_version INTEGER NOT NULL'
  62                   ,',date_stamp TEXT NOT NULL'
  63                   ,',scm_revision TEXT NOT NULL'
  64                   ,',success INTEGER NOT NULL'
  65                   ,',log TEXT'
  66                   ,',UNIQUE(package,system,r_version,deb_epoch,deb_revision,db_version)'
  67                   ,')'))
  68     }
  69     return(con)
  70 }
  71
  72 db_stop <- function(con,bump=F) {
  73     if (bump) {
  74         db_bump(con)
  75     }
  76     dbDisconnect(con)
  77 }
  78
  79 db_quote <- function(text) {
  80     return(paste('\'', gsub('([\'"])','\\1\\1',text),'\'',sep=''))
  81 }
  82
  83 db_now <- function() {
  84     return(as.integer(gsub('-','',Sys.Date())))
  85 }
  86
  87 db_cur_version <- function(con) {
  88     return(as.integer(dbGetQuery(con, 'SELECT max(version) FROM database_versions')[[1]]))
  89 }
  90
  91 db_base_epoch <- function(con) {
  92     return(as.integer(dbGetQuery(con,
  93         paste('SELECT max(base_epoch) FROM database_versions'
  94              ,'WHERE version IN (SELECT max(version) FROM database_versions)'))[[1]]))
  95 }
  96
  97 db_get_base_epoch <- function() {
  98     con <- db_start()
  99     v <- db_base_epoch(con)
 100     db_stop(con)
 101     return(v)
 102 }
 103
 104 db_get_version <- function() {
 105     con <- db_start()
 106     v <- db_cur_version(con)
 107     db_stop(con)
 108     return(v)
 109 }
 110
 111 db_add_version <- function(con, version, epoch) {
 112     dbGetQuery(con,paste('INSERT INTO database_versions (version,version_date,base_epoch)'
 113               ,'VALUES (',as.integer(version),',',db_now(),',',as.integer(epoch),')'))
 114 }
 115
 116 db_bump <- function(con) {
 117     db_add_version(con,db_cur_version(con)+1, db_base_epoch(con))
 118 }
 119
 120 db_bump_epoch <- function(con) {
 121     db_add_version(con,db_cur_version(con)+1, db_base_epoch(con)+1)
 122 }
 123
 124 db_sysreq_override <- function(sysreq_text) {
 125     con <- db_start()
 126     results <- dbGetQuery(con,paste(
 127                     'SELECT DISTINCT depend_alias FROM sysreq_override WHERE'
 128                             ,db_quote(tolower(sysreq_text)),'LIKE r_pattern'))
 129     db_stop(con)
 130     if (length(results) == 0) {
 131         return(NULL)
 132     }
 133     return(results$depend_alias)
 134 }
 135
 136 db_add_sysreq_override <- function(pattern,depend_alias) {
 137     con <- db_start()
 138     results <- dbGetQuery(con,paste(
 139                      'INSERT OR REPLACE INTO sysreq_override'
 140                     ,'(depend_alias, r_pattern) VALUES ('
 141                     ,' ',db_quote(tolower(depend_alias))
 142                     ,',',db_quote(tolower(pattern))
 143                     ,')'))
 144     db_stop(con,TRUE)
 145 }
 146
 147 db_sysreq_overrides <- function() {
 148     con <- db_start()
 149     overrides <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM sysreq_override'))
 150     db_stop(con)
 151     return(overrides)
 152 }
 153
 154 db_get_depends <- function(depend_alias,build=F) {
 155     con <- db_start()
 156     results <- dbGetQuery(con,paste(
 157                     'SELECT DISTINCT debian_pkg FROM debian_dependency WHERE'
 158                     ,db_quote(tolower(depend_alias)),'= alias'
 159                     ,'AND',as.integer(build),'= build'))
 160     db_stop(con)
 161     return(results$debian_pkg)
 162 }
 163
 164 db_add_depends <- function(depend_alias,debian_pkg,build=F) {
 165     con <- db_start()
 166     results <- dbGetQuery(con,paste(
 167                      'INSERT OR REPLACE INTO debian_dependency'
 168                     ,'(alias, build, debian_pkg) VALUES ('
 169                     ,' ',db_quote(tolower(depend_alias))
 170                     ,',',as.integer(build)
 171                     ,',',db_quote(tolower(debian_pkg))
 172                     ,')'))
 173     db_stop(con,TRUE)
 174 }
 175
 176 db_depends <- function() {
 177     con <- db_start()
 178     depends <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM debian_dependency'))
 179     db_stop(con)
 180     return(depends)
 181 }
 182
 183 db_get_forced_depends <- function(r_name) {
 184     con <- db_start()
 185     forced_depends <- dbGetQuery(con,
 186                 paste('SELECT depend_alias FROM forced_depends WHERE'
 187                      ,db_quote(r_name),'= r_name'))
 188     db_stop(con)
 189     return(forced_depends$depend_alias)
 190 }
 191
 192 db_add_forced_depends <- function(r_name, depend_alias) {
 193     if (!length(db_get_depends(depend_alias,build=F)) &&
 194         !length(db_get_depends(depend_alias,build=T))) {
 195         fail('Debian dependency alias',depend_alias,'is not know,'
 196                   ,'yet trying to force a dependency on it?')
 197     }
 198     con <- db_start()
 199     dbGetQuery(con,
 200             paste('INSERT OR REPLACE INTO forced_depends (r_name, depend_alias)'
 201                  ,'VALUES (',db_quote(r_name),',',db_quote(depend_alias),')'))
 202     db_stop(con,TRUE)
 203 }
 204
 205 db_forced_depends <- function() {
 206     con <- db_start()
 207     depends <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM forced_depends'))
 208     db_stop(con)
 209     return(depends)
 210 }
 211
 212 db_license_override_name <- function(name) {
 213     con <- db_start()
 214     results <- dbGetQuery(con,paste(
 215                     'SELECT DISTINCT accept FROM license_override WHERE'
 216                             ,db_quote(tolower(name)),'= name'))
 217     db_stop(con)
 218     if (length(results) == 0) {
 219         return(NULL)
 220     }
 221     return(as.logical(results$accept))
 222 }
 223
 224 db_add_license_override <- function(name,accept) {
 225     notice('adding',name,'accept?',accept)
 226     if (accept != TRUE && accept != FALSE) {
 227         fail('accept must be TRUE or FALSE')
 228     }
 229     con <- db_start()
 230     results <- dbGetQuery(con,paste(
 231                      'INSERT OR REPLACE INTO license_override'
 232                     ,'(name, accept) VALUES ('
 233                     ,' ',db_quote(tolower(name))
 234                     ,',',as.integer(accept)
 235                     ,')'))
 236     db_stop(con,TRUE)
 237 }
 238
 239 db_license_override_hash <- function(license_sha1) {
 240     con <- db_start()
 241     results <- dbGetQuery(con,paste(
 242                      'SELECT DISTINCT accept FROM license_override'
 243                     ,'INNER JOIN license_hashes'
 244                     ,'ON license_hashes.name = license_override.name WHERE'
 245                     ,db_quote(tolower(license_sha1)),'= license_hashes.sha1'))
 246     db_stop(con)
 247     if (length(results) == 0) {
 248         return(NULL)
 249     }
 250     return(as.logical(results$accept))
 251 }
 252
 253 db_license_overrides <- function() {
 254     con <- db_start()
 255     overrides <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM license_override'))
 256     hashes    <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM license_hashes'))
 257     db_stop(con)
 258     return(list(overrides=overrides,hashes=hashes))
 259 }
 260
 261 db_add_license_hash <- function(name,license_sha1) {
 262     if (is.null(db_license_override_name(name))) {
 263         fail('license',name,'is not know, yet trying to add a hash for it?')
 264     }
 265     notice('adding hash',license_sha1,'for',name)
 266     con <- db_start()
 267     dbGetQuery(con,paste(
 268          'INSERT OR REPLACE INTO license_hashes'
 269         ,'(name, sha1) VALUES ('
 270         ,' ',db_quote(tolower(name))
 271         ,',',db_quote(tolower(license_sha1))
 272         ,')'))
 273     db_stop(con,TRUE)
 274 }
 275
 276
 277 db_update_package_versions <- function() {
 278     con <- db_start()
 279     for (package in available[,'Package']) {
 280         dbGetQuery(con, paste('INSERT OR REPLACE INTO packages (package,latest_r_version)'
 281                              ,'VALUES (',db_quote(package)
 282                              ,',',db_quote(available[package,'Version']),')'))
 283     }
 284     db_stop(con)
 285 }
 286
 287 db_record_build <- function(package, deb_version, log, success=F) {
 288     con <- db_start()
 289     dbGetQuery(con,paste('INSERT OR REPLACE INTO builds'
 290                         ,'(package,system,r_version,deb_epoch,deb_revision,db_version,success,date_stamp,scm_revision,log)'
 291                         ,'VALUES'
 292                         ,'(',db_quote(package)
 293                         ,',',db_quote(which_system)
 294                         ,',',db_quote(version_upstream(deb_version))
 295                         ,',',db_quote(version_epoch(deb_version))
 296                         ,',',db_quote(version_revision(deb_version))
 297                         ,',',db_cur_version(con)
 298                         ,',',as.integer(success)
 299                         ,',',db_quote(format(Sys.time(),'%a, %d %b %Y %H:%M:%S %z'))
 300                         ,',',db_quote(scm_revision)
 301                         ,',',db_quote(paste(log, collapse='\n'))
 302                         ,')'))
 303     db_stop(con)
 304 }
 305
 306 db_builds <- function(pkgname) {
 307     # returns all successful builds
 308     con <- db_start()
 309     build <- dbGetQuery(con, paste('SELECT * FROM builds'
 310                        ,'WHERE success = 1'
 311                        ,'AND system =',db_quote(which_system)
 312                        ,'AND package =',db_quote(pkgname)))
 313     db_stop(con)
 314     if (length(build) == 0) {
 315         return(NULL)
 316     }
 317     build$success <- as.logical(build$success)
 318     return(build)
 319 }
 320
 321 db_latest_build <- function(pkgname) {
 322     con <- db_start()
 323     build <- dbGetQuery(con, paste('SELECT * FROM builds'
 324                        ,'NATURAL JOIN (SELECT package,max(id) AS max_id FROM builds'
 325                        ,              'WHERE system =',db_quote(which_system)
 326                        ,              'GROUP BY package) AS last'
 327                        ,'WHERE id = max_id'
 328                        ,'AND builds.package =',db_quote(pkgname)))
 329     db_stop(con)
 330     if (length(build) == 0) {
 331         return(NULL)
 332     }
 333     build$success <- as.logical(build$success)
 334     return(build)
 335 }
 336
 337 db_latest_build_version <- function(pkgname) {
 338     build <- db_latest_build(pkgname)
 339     if (is.null(build)) {
 340         return(NULL)
 341     }
 342     return(version_new(build$r_version, build$deb_revision, build$deb_epoch))
 343 }
 344
 345 db_latest_build_status <- function(pkgname) {
 346     build <- db_latest_build(pkgname)
 347     if (is.null(build)) {
 348         return(NULL)
 349     }
 350     return(list(build$success,build$log))
 351 }
 352
 353 db_outdated_packages <- function() {
 354     con <- db_start()
 355     packages <- dbGetQuery(con,paste('SELECT packages.package FROM packages'
 356                ,'LEFT OUTER JOIN ('
 357                # extract the latest attempt at building each package
 358                ,      'SELECT * FROM builds'
 359                ,      'NATURAL JOIN (SELECT package,max(id) AS max_id FROM builds'
 360                ,                    'WHERE system =',db_quote(which_system)
 361                ,                    'GROUP BY package) AS last'
 362                ,      'WHERE id = max_id) AS build'
 363                ,'ON build.package = packages.package'
 364                # outdated iff:
 365                # - there is no latest build
 366                ,'WHERE build.package IS NULL'
 367                # - the database has changed since last build
 368                ,'OR build.db_version < (SELECT max(version) FROM database_versions)'
 369                # - the debian epoch has been bumped up
 370                ,'OR build.deb_epoch < (SELECT max(base_epoch) FROM database_versions'
 371                ,                        'WHERE version IN ('
 372                ,                            'SELECT max(version) FROM database_versions))'
 373                # - the latest build is not of the latest R version
 374                ,'OR build.r_version != packages.latest_r_version'
 375                ))$package
 376     db_stop(con)
 377     return(packages)
 378 }
 379