3 source "$BP_DIR/bp_test/lib/test.sh"
5 run "$bp -I $in.1 -k SEQ_NAME -s test1 -r foo -O $tmp"
6 assert_no_diff $tmp $out.1
9 run "$bp -I $in.1 -k SEQ_NAME -f $in.2 -O $tmp"
10 assert_no_diff $tmp $out.2
13 run "$bp -I $in.1 -k SEQ_NAME -f $in.2 -S 2 -R 1 -O $tmp"
14 assert_no_diff $tmp $out.3