]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blob - bp_test/test/test_replace_vals
fixed encoding bug in read_454
[biopieces.git] / bp_test / test / test_replace_vals
1 #!/bin/bash
2
3 source "$BP_DIR/bp_test/lib/test.sh"
4
5 run "$bp -I $in.1 -k SEQ_NAME -s test1 -r foo -O $tmp"
6 assert_no_diff $tmp $out.1
7 clean
8
9 run "$bp -I $in.1 -k SEQ_NAME -f $in.2 -O $tmp"
10 assert_no_diff $tmp $out.2
11 clean
12
13 run "$bp -I $in.1 -k SEQ_NAME -f $in.2 -S 2 -R 1 -O $tmp"
14 assert_no_diff $tmp $out.3
15 clean