bp_test/test/test_read_embl

   1 #!/bin/bash
   2
   3 source "$BP_DIR/bp_test/lib/test.sh"
   4
   5 run "$bp -i $in -O $tmp"
   6 assert_no_diff $tmp $out.1
   7 clean
   8
   9 run "$bp -i $in.gz -O $tmp"
  10 assert_no_diff $tmp $out.1
  11 clean
  12
  13 run "$bp -i $in -k AC -O $tmp"
  14 assert_no_diff $tmp $out.2
  15 clean
  16
  17 run "$bp -i $in -k AC -f CDS -O $tmp"
  18 assert_no_diff $tmp $out.3
  19 clean
  20
  21 run "$bp -i $in -k AC -f CDS -q translation -O $tmp"
  22 assert_no_diff $tmp $out.4
  23 clean