]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blob - bp_test/out/kmer_freq.out.1
added read_sff biopiece
[biopieces.git] / bp_test / out / kmer_freq.out.1
1 DUMMY: nothing
2 ---
3 SEQ: atcgatcgatcg
4 AAAA: 0
5 AAAT: 0
6 AAAC: 0
7 AAAG: 0
8 AATA: 0
9 AATT: 0
10 AATC: 0
11 AATG: 0
12 AACA: 0
13 AACT: 0
14 AACC: 0
15 AACG: 0
16 AAGA: 0
17 AAGT: 0
18 AAGC: 0
19 AAGG: 0
20 ATAA: 0
21 ATAT: 0
22 ATAC: 0
23 ATAG: 0
24 ATTA: 0
25 ATTT: 0
26 ATTC: 0
27 ATTG: 0
28 ATCA: 0
29 ATCT: 0
30 ATCC: 0
31 ATCG: 2
32 ATGA: 0
33 ATGT: 0
34 ATGC: 0
35 ATGG: 0
36 ACAA: 0
37 ACAT: 0
38 ACAC: 0
39 ACAG: 0
40 ACTA: 0
41 ACTT: 0
42 ACTC: 0
43 ACTG: 0
44 ACCA: 0
45 ACCT: 0
46 ACCC: 0
47 ACCG: 0
48 ACGA: 0
49 ACGT: 0
50 ACGC: 0
51 ACGG: 0
52 AGAA: 0
53 AGAT: 0
54 AGAC: 0
55 AGAG: 0
56 AGTA: 0
57 AGTT: 0
58 AGTC: 0
59 AGTG: 0
60 AGCA: 0
61 AGCT: 0
62 AGCC: 0
63 AGCG: 0
64 AGGA: 0
65 AGGT: 0
66 AGGC: 0
67 AGGG: 0
68 TAAA: 0
69 TAAT: 0
70 TAAC: 0
71 TAAG: 0
72 TATA: 0
73 TATT: 0
74 TATC: 0
75 TATG: 0
76 TACA: 0
77 TACT: 0
78 TACC: 0
79 TACG: 0
80 TAGA: 0
81 TAGT: 0
82 TAGC: 0
83 TAGG: 0
84 TTAA: 0
85 TTAT: 0
86 TTAC: 0
87 TTAG: 0
88 TTTA: 0
89 TTTT: 0
90 TTTC: 0
91 TTTG: 0
92 TTCA: 0
93 TTCT: 0
94 TTCC: 0
95 TTCG: 0
96 TTGA: 0
97 TTGT: 0
98 TTGC: 0
99 TTGG: 0
100 TCAA: 0
101 TCAT: 0
102 TCAC: 0
103 TCAG: 0
104 TCTA: 0
105 TCTT: 0
106 TCTC: 0
107 TCTG: 0
108 TCCA: 0
109 TCCT: 0
110 TCCC: 0
111 TCCG: 0
112 TCGA: 2
113 TCGT: 0
114 TCGC: 0
115 TCGG: 0
116 TGAA: 0
117 TGAT: 0
118 TGAC: 0
119 TGAG: 0
120 TGTA: 0
121 TGTT: 0
122 TGTC: 0
123 TGTG: 0
124 TGCA: 0
125 TGCT: 0
126 TGCC: 0
127 TGCG: 0
128 TGGA: 0
129 TGGT: 0
130 TGGC: 0
131 TGGG: 0
132 CAAA: 0
133 CAAT: 0
134 CAAC: 0
135 CAAG: 0
136 CATA: 0
137 CATT: 0
138 CATC: 0
139 CATG: 0
140 CACA: 0
141 CACT: 0
142 CACC: 0
143 CACG: 0
144 CAGA: 0
145 CAGT: 0
146 CAGC: 0
147 CAGG: 0
148 CTAA: 0
149 CTAT: 0
150 CTAC: 0
151 CTAG: 0
152 CTTA: 0
153 CTTT: 0
154 CTTC: 0
155 CTTG: 0
156 CTCA: 0
157 CTCT: 0
158 CTCC: 0
159 CTCG: 0
160 CTGA: 0
161 CTGT: 0
162 CTGC: 0
163 CTGG: 0
164 CCAA: 0
165 CCAT: 0
166 CCAC: 0
167 CCAG: 0
168 CCTA: 0
169 CCTT: 0
170 CCTC: 0
171 CCTG: 0
172 CCCA: 0
173 CCCT: 0
174 CCCC: 0
175 CCCG: 0
176 CCGA: 0
177 CCGT: 0
178 CCGC: 0
179 CCGG: 0
180 CGAA: 0
181 CGAT: 2
182 CGAC: 0
183 CGAG: 0
184 CGTA: 0
185 CGTT: 0
186 CGTC: 0
187 CGTG: 0
188 CGCA: 0
189 CGCT: 0
190 CGCC: 0
191 CGCG: 0
192 CGGA: 0
193 CGGT: 0
194 CGGC: 0
195 CGGG: 0
196 GAAA: 0
197 GAAT: 0
198 GAAC: 0
199 GAAG: 0
200 GATA: 0
201 GATT: 0
202 GATC: 2
203 GATG: 0
204 GACA: 0
205 GACT: 0
206 GACC: 0
207 GACG: 0
208 GAGA: 0
209 GAGT: 0
210 GAGC: 0
211 GAGG: 0
212 GTAA: 0
213 GTAT: 0
214 GTAC: 0
215 GTAG: 0
216 GTTA: 0
217 GTTT: 0
218 GTTC: 0
219 GTTG: 0
220 GTCA: 0
221 GTCT: 0
222 GTCC: 0
223 GTCG: 0
224 GTGA: 0
225 GTGT: 0
226 GTGC: 0
227 GTGG: 0
228 GCAA: 0
229 GCAT: 0
230 GCAC: 0
231 GCAG: 0
232 GCTA: 0
233 GCTT: 0
234 GCTC: 0
235 GCTG: 0
236 GCCA: 0
237 GCCT: 0
238 GCCC: 0
239 GCCG: 0
240 GCGA: 0
241 GCGT: 0
242 GCGC: 0
243 GCGG: 0
244 GGAA: 0
245 GGAT: 0
246 GGAC: 0
247 GGAG: 0
248 GGTA: 0
249 GGTT: 0
250 GGTC: 0
251 GGTG: 0
252 GGCA: 0
253 GGCT: 0
254 GGCC: 0
255 GGCG: 0
256 GGGA: 0
257 GGGT: 0
258 GGGC: 0
259 GGGG: 0
260 ---
261 SEQ: atcgatcgatcgATCGATCGATCG
262 AAAA: 0
263 AAAT: 0
264 AAAC: 0
265 AAAG: 0
266 AATA: 0
267 AATT: 0
268 AATC: 0
269 AATG: 0
270 AACA: 0
271 AACT: 0
272 AACC: 0
273 AACG: 0
274 AAGA: 0
275 AAGT: 0
276 AAGC: 0
277 AAGG: 0
278 ATAA: 0
279 ATAT: 0
280 ATAC: 0
281 ATAG: 0
282 ATTA: 0
283 ATTT: 0
284 ATTC: 0
285 ATTG: 0
286 ATCA: 0
287 ATCT: 0
288 ATCC: 0
289 ATCG: 5
290 ATGA: 0
291 ATGT: 0
292 ATGC: 0
293 ATGG: 0
294 ACAA: 0
295 ACAT: 0
296 ACAC: 0
297 ACAG: 0
298 ACTA: 0
299 ACTT: 0
300 ACTC: 0
301 ACTG: 0
302 ACCA: 0
303 ACCT: 0
304 ACCC: 0
305 ACCG: 0
306 ACGA: 0
307 ACGT: 0
308 ACGC: 0
309 ACGG: 0
310 AGAA: 0
311 AGAT: 0
312 AGAC: 0
313 AGAG: 0
314 AGTA: 0
315 AGTT: 0
316 AGTC: 0
317 AGTG: 0
318 AGCA: 0
319 AGCT: 0
320 AGCC: 0
321 AGCG: 0
322 AGGA: 0
323 AGGT: 0
324 AGGC: 0
325 AGGG: 0
326 TAAA: 0
327 TAAT: 0
328 TAAC: 0
329 TAAG: 0
330 TATA: 0
331 TATT: 0
332 TATC: 0
333 TATG: 0
334 TACA: 0
335 TACT: 0
336 TACC: 0
337 TACG: 0
338 TAGA: 0
339 TAGT: 0
340 TAGC: 0
341 TAGG: 0
342 TTAA: 0
343 TTAT: 0
344 TTAC: 0
345 TTAG: 0
346 TTTA: 0
347 TTTT: 0
348 TTTC: 0
349 TTTG: 0
350 TTCA: 0
351 TTCT: 0
352 TTCC: 0
353 TTCG: 0
354 TTGA: 0
355 TTGT: 0
356 TTGC: 0
357 TTGG: 0
358 TCAA: 0
359 TCAT: 0
360 TCAC: 0
361 TCAG: 0
362 TCTA: 0
363 TCTT: 0
364 TCTC: 0
365 TCTG: 0
366 TCCA: 0
367 TCCT: 0
368 TCCC: 0
369 TCCG: 0
370 TCGA: 5
371 TCGT: 0
372 TCGC: 0
373 TCGG: 0
374 TGAA: 0
375 TGAT: 0
376 TGAC: 0
377 TGAG: 0
378 TGTA: 0
379 TGTT: 0
380 TGTC: 0
381 TGTG: 0
382 TGCA: 0
383 TGCT: 0
384 TGCC: 0
385 TGCG: 0
386 TGGA: 0
387 TGGT: 0
388 TGGC: 0
389 TGGG: 0
390 CAAA: 0
391 CAAT: 0
392 CAAC: 0
393 CAAG: 0
394 CATA: 0
395 CATT: 0
396 CATC: 0
397 CATG: 0
398 CACA: 0
399 CACT: 0
400 CACC: 0
401 CACG: 0
402 CAGA: 0
403 CAGT: 0
404 CAGC: 0
405 CAGG: 0
406 CTAA: 0
407 CTAT: 0
408 CTAC: 0
409 CTAG: 0
410 CTTA: 0
411 CTTT: 0
412 CTTC: 0
413 CTTG: 0
414 CTCA: 0
415 CTCT: 0
416 CTCC: 0
417 CTCG: 0
418 CTGA: 0
419 CTGT: 0
420 CTGC: 0
421 CTGG: 0
422 CCAA: 0
423 CCAT: 0
424 CCAC: 0
425 CCAG: 0
426 CCTA: 0
427 CCTT: 0
428 CCTC: 0
429 CCTG: 0
430 CCCA: 0
431 CCCT: 0
432 CCCC: 0
433 CCCG: 0
434 CCGA: 0
435 CCGT: 0
436 CCGC: 0
437 CCGG: 0
438 CGAA: 0
439 CGAT: 5
440 CGAC: 0
441 CGAG: 0
442 CGTA: 0
443 CGTT: 0
444 CGTC: 0
445 CGTG: 0
446 CGCA: 0
447 CGCT: 0
448 CGCC: 0
449 CGCG: 0
450 CGGA: 0
451 CGGT: 0
452 CGGC: 0
453 CGGG: 0
454 GAAA: 0
455 GAAT: 0
456 GAAC: 0
457 GAAG: 0
458 GATA: 0
459 GATT: 0
460 GATC: 5
461 GATG: 0
462 GACA: 0
463 GACT: 0
464 GACC: 0
465 GACG: 0
466 GAGA: 0
467 GAGT: 0
468 GAGC: 0
469 GAGG: 0
470 GTAA: 0
471 GTAT: 0
472 GTAC: 0
473 GTAG: 0
474 GTTA: 0
475 GTTT: 0
476 GTTC: 0
477 GTTG: 0
478 GTCA: 0
479 GTCT: 0
480 GTCC: 0
481 GTCG: 0
482 GTGA: 0
483 GTGT: 0
484 GTGC: 0
485 GTGG: 0
486 GCAA: 0
487 GCAT: 0
488 GCAC: 0
489 GCAG: 0
490 GCTA: 0
491 GCTT: 0
492 GCTC: 0
493 GCTG: 0
494 GCCA: 0
495 GCCT: 0
496 GCCC: 0
497 GCCG: 0
498 GCGA: 0
499 GCGT: 0
500 GCGC: 0
501 GCGG: 0
502 GGAA: 0
503 GGAT: 0
504 GGAC: 0
505 GGAG: 0
506 GGTA: 0
507 GGTT: 0
508 GGTC: 0
509 GGTG: 0
510 GGCA: 0
511 GGCT: 0
512 GGCC: 0
513 GGCG: 0
514 GGGA: 0
515 GGGT: 0
516 GGGC: 0
517 GGGG: 0
518 ---